2019 Fiscal Year Annual Research Report
エピゲノム制御機構の破綻によるグリオーマ発生・進展機構の解明と治療標的の探索
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17H04300
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
武笠 晃丈 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 教授 (90463869)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
永江 玄太 東京大学, 先端科学技術研究センター, 講師 (10587348)
篠島 直樹 熊本大学, 病院, 講師 (50648269)
田中 將太 東京大学, 医学部附属病院, 助教 (80643725)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | エピゲノム / メチル化 / ヒドロキシメチル化 / 腫瘍発生 / 悪性化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究はIDH1/2変異型神経膠腫（IDHmt glioma）に関し、悪性転化に伴うDNAヒドロキシメチル化変動と遺伝子発現変動を解析する事で悪性転化機構の解明を試みた。昨年度までに、悪性転化に伴い優先的に能動的脱メチル化が起きる3120箇所のCpG領域（能動的脱メチル化領域, actively demethylated regions: AcDR）を同定した。遺伝子領域にAcDRを含む遺伝子は2647あり、この中で悪性転化に伴い発現変動が起きた遺伝子は322 あった。この322遺伝子は380のAcDRを擁しており、その全AcDRにおいて、能動的脱メチル化の変化と、属する遺伝子の発現変化を相関解析した。結果、380 中113 のAcDRでその能動的脱メチル化の亢進と遺伝子発現が相関（Pearson‘s correlation test, | r | > 0.5）していた。AcDRの能動的脱メチル化亢進と属する遺伝子の発現が正の相関をしているAcDRと負の相関をしているAcDRがあったが、負の相関をしているAcDRは、gene body 及びintergenic 領域に多く分布する傾向があった。公開されているIDHmt gliomaのH3K27ac_ChIP 情報を元に、同113 AcDRの中で遺伝子制御領域に該当すると考えられるAcDRを抽出し、周囲の塩基配列に対しmotif 解析を行ったところ、SP1-like transcription factors に属する転写因子の結合motif が有意に濃縮していた。これらの事から、特定の遺伝子群がある時点で能動的脱メチル化を受け、結果的に共通の転写因子を介してその発現を変化させる事がIDHmt gliomaの悪性転化の一因になる可能性が示唆された。本研究は神経膠腫悪性転化機構の研究に新たな展望をもたらした。
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| Research Progress Status |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和元年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(19 results)
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[Journal Article] Reduced Neoantigen Expression Revealed by Longitudinal Multiomics as a Possible Immune Evasion Mechanism in Glioma2019
Author(s)
Nejo T, Matsushita H, Karasaki T, Nomura M, Saito K, Tanaka S, Takayanagi S, Hana T, Takahashi S, Kitagawa Y, Koike T, Kobayashi Y, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Narita Y, Nagane M, Ueki K, Nishikawa R, Aburatani H, Mukasa A, Saito N, Kakimi K
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Journal Title
Cancer Immunology Research
Volume: 7
Pages: 1148～1161
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Intratumoural immune cell landscape in germinoma reveals multipotent lineages and exhibits prognostic significance2019
Author(s)
Takami H, Fukushima S, Aoki K, Satomi K, Narumi K, Hama N, Matsushita Y, Fukuoka K, Yamasaki K, Nakamura T, Mukasa A, et al.
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Journal Title
Neuropathology and Applied Neurobiology
Volume: 46
Pages: 111～124
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Spray Fluorescent Probes for Fluorescence-Guided Neurosurgery2019
Author(s)
Kitagawa Yosuke、Tanaka Shota、Kuriki Yugo、Yamamoto Kyoko、Ogasawara Akira、Nejo Takahide、Matsuura Reiko、Koike Tsukasa、Hana Taijun、Takahashi Satoshi、Nomura Masashi、Takayanagi Shunsaku、Mukasa Akitake、Kamiya Mako、Urano Yasuteru、Saito Nobuhito
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Journal Title
Frontiers in Oncology
Volume: 9
Pages: 727
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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