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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Molecular dissection of robust and flexible circadian clock and its control of animal physiology

Research Project

Project/Area Number 17H06096
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

深田 吉孝  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 名誉教授 (80165258)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 饗場 篤  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 教授 (20271116)
高尾 敏文  大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (10197048)
小島 大輔  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (60376530)
清水 貴美子  東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, プロジェクト准教授 (50451828)
吉種 光  公益財団法人東京都医学総合研究所, 基礎医科学研究分野, 副参事研究員 (70569920)
浅野 吉政  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 助教 (50872123)
Project Period (FY) 2017-04-25 – 2022-03-31
Keywords概日リズム / 翻訳後修飾 / 位相制御 / 高次脳機能 / 老化 / 概日振動機構 / 光入力 / カルシウムイオン
Outline of Annual Research Achievements

ipRGC特異的に人工リガンド受容体DREADDを発現するマウスを用いて古典的Gq経路および新規経路をそれぞれ選択的に活性化した。その結果、行動リズム位相シフトおよび瞳孔収縮のいずれも古典的Gq経路の活性化に応答したが、新規経路の活性化はいずれの応答も引き起こさないことから、新規経路は古典的Gq経路に協調的に作用してipRGCの働きを増強すると結論した。また、行動リズムの光制御を担う分子の同定に向け、カリフォルニアマウス変異系統約100匹の家系図を作成し、ゲノム/RNAseqデータを用いて行動リズムの光制御異常との連鎖解析を行った。
時計振動体における転写ネットワークの重要性を理解するため時計振動に必須なBmal1遺伝子に着目し、その近傍の時計シス配列RREを欠損した変異細胞・マウスを作製した。この変異により、Bmal1の転写リズムは消失したが細胞・個体の概日リズムは維持された。その一方で、安定な時計機構が脆弱になることを見出し、多くの動物種で保存されたRRE配列の生理的役割を明らかにした。また、Ca2+制御関連因子としてNa+/Ca2+交換体NCXとCaMKIIの役割を解析し、NCX2/3やCaMKIIβの変異がマウス自発行動のリズム性を減弱させることを見出した。さらに、NCX阻害剤の混餌投与はショウジョウバエの自発行動リズムの減衰を誘導し、また培地中Ca2+の除去によりクラミドモナスとシアノバクテリアの転写リズムの振幅が減少したことから、Ca2+はリズム振幅の維持に普遍的な役割を持つことが分かった。
若齢マウスの空間記憶は、休息期後半から活動期前半に学習すると記憶が長く維持されやすいという日周リズムを示したが、老齢マウスはどの時刻の学習でも記憶を長く維持できず、記憶維持の日周変動が消失した。つまり概日時計が記憶維持機構を制御する過程は老化に伴って低下することを明らかにした。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (68 results)

All 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 11 results) Presentation (50 results) (of which Int'l Joint Research: 12 results,  Invited: 22 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] KAIST(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      KAIST
  • [Journal Article] Diurnal variation in declarative memory and the involvement of SCOP in cognitive functions in nonhuman primates2023

    • Author(s)
      Shimizu K, Inoue K, Oishi T, Takada M, Fukada Y, Imai H
    • Journal Title

      Molecular Brain

      Volume: 16 Pages: 31

    • DOI

      10.1186/s13041-023-01022-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The circadian clock in the piriform cortex intrinsically tunes daily changes of odor-evoked neural activity2023

    • Author(s)
      Takeuchi S, Shimizu K, Fukada Y, Emoto K
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 6 Pages: 332

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04691-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Kinase signaling in distinct neuronal populations in the mouse brain controls sleep homeostasis and the circadian2023

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 120 Pages: e2303354120

    • DOI

      10.1073/pnas.2303354120

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Singularity response reveals entrainment properties in mammalian circadian clock2023

    • Author(s)
      K. Masuda, N. Kon, K. Iizuka, Y. Fukada, T. Sakurai and A. Hirano.
    • Journal Title

      Nat Commun

      Volume: . Pages: in press

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Diurnal shift of mouse activity by the deficiency of an ageing-related gene Lmna2022

    • Author(s)
      Kawakami S, Yoshitane H, Morimura T, Kimura W, Fukada Y.
    • Journal Title

      J Biochem

      Volume: 171 Pages: 509-518

    • DOI

      10.1093/jb/mvac015

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular encoding and synaptic decoding of context during salt chemotaxis in C. elegans2022

    • Author(s)
      Hiroki S, Yoshitane H, Mitsui H, Sato H, Umatani C, Kanda S, Fukada Y, Iino Y.
    • Journal Title

      Nat Commun

      Volume: 13 Pages: 2928

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30279-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Adiponectin regulates the circadian rhythm of glucose and lipid metabolism2022

    • Author(s)
      Wada T, Yamamoto Y, Takasugi Y, Ishii H, Uchiyama T, Saitoh K, Suzuki M, Uchiyama M, Yoshitane H, Fukada Y, Shimba S.
    • Journal Title

      J Endocrinol

      Volume: 254 Pages: 121-133

    • DOI

      10.1530/JOE-22-0006

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Rhythmic transcription of Bmal1 stabilizes the circadian timekeeping system in mammals2022

    • Author(s)
      Abe YO, Yoshitane H, Kim DW, Kawakami S, Koebis M, Nakao K, Aiba A, Kim JK, Fukada Y.
    • Journal Title

      Nat Commun

      Volume: 13 Pages: 4652

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32326-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lint-O cooperates with L(3)mbt in target gene suppression to maintain homeostasis in fly ovary and brain2022

    • Author(s)
      Yamamoto-Matsuda H, Miyoshi K, Moritoh M, Yoshitane H, Fukada Y, Saito K, Yamanaka S, Siomi MC.
    • Journal Title

      EMBO Rep

      Volume: 23 Pages: e53813

    • DOI

      10.15252/embr.202153813

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Post-transcriptional repression of circadian component CLOCK regulates cancer-stemness in murine breast cancer cells2021

    • Author(s)
      Ogino T, Matsunaga N, Tanaka T, Tanihara T, Terajima H, Yoshitane H, Fukada Y, Tsuruta A, Koyanagi S, Ohdo S.
    • Journal Title

      Elife

      Volume: 10 Pages: e66155

    • DOI

      10.7554/eLife.66155

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Attenuated SIRT1 Activity Leads to PER2 Cytoplasmic Localization and Dampens the Amplitude of Bmal1 Promoter-Driven Circadian Oscillation2021

    • Author(s)
      Ashimori A, Nakahata Y, Sato T, Fukamizu Y, Matsui T, Yoshitane H, Fukada Y, Shinohara K, Bessho Y.
    • Journal Title

      Front Neurosci

      Volume: 15 Pages: 647589

    • DOI

      10.3389/fnins.2021.647589

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Foxq2 determines blue cone identity in zebrafish.2021

    • Author(s)
      Ogawa Y, Shiraki T, Fukada Y, Kojima D
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 7 Pages: eabi9784

    • DOI

      10.1126/sciadv.abi9784e

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 概日リズムを位相制御する光受容体2021

    • Author(s)
      小島大輔, 深田吉孝
    • Journal Title

      BRAIN and NERVE

      Volume: 73 Pages: 1193_1199

    • DOI

      10.11477/mf.1416201917

  • [Journal Article] mTOR-AKT Signaling in Cellular Clock Resetting Triggered by Osmotic Stress2021

    • Author(s)
      Yoshitane H, Imamura K, Okubo T, Otobe Y, Kawakami S, Ito S, Takumi T, Hattori K, Naguro I, Ichijo H, Fukada Y.
    • Journal Title

      Antioxid Redox Signal

      Volume: 37 Pages: 631-646

    • DOI

      10.1089/ars.2021.0059

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 約24時間周期で振動する体内時計の分子的な仕組み2023

    • Author(s)
      深田吉孝
    • Organizer
      電気通信大学 脳・医工学研究センター第100回 CNBEセミナー
    • Invited
  • [Presentation] 体内時計の研究の流れと約24時間リズムを支える分子的な仕組み2023

    • Author(s)
      深田吉孝
    • Organizer
      国立循環器病研究センターセミナー
    • Invited
  • [Presentation] 時計老化: 加齢に基づく老化現象の分子メカニズム2023

    • Author(s)
      吉種光
    • Organizer
      日本生理学会 第100回 記念大会
    • Invited
  • [Presentation] Non-visual photoreceptor opsins in the retina regulate circadian rhythm and relevant physiology in vertebrates2023

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      Toyoma University Academic Symposium on “Photoreception and Behavioral Control”
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 空間学習トレーニングによって誘導される7a-水酸化ニューロステロイドはマウスの空間維持能力をもつ2023

    • Author(s)
      清水貴美子
    • Organizer
      第147回日本薬理学会関東部会
  • [Presentation] 視覚と時間2023

    • Author(s)
      深田吉孝
    • Organizer
      シンポジウム「光といのち」
    • Invited
  • [Presentation] Calcium ion signaling as a player conserved among circadian clocks among circadian clocks2023

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      The 10th Congress of Asian Sleep Research Society and Asian Forum of Chronobiology 2023
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 記憶維持機能の日周リズムとニューロステロイドによる制御2022

    • Author(s)
      清水貴美子
    • Organizer
      第99回日本生理学会
    • Invited
  • [Presentation] molecular basis for mammalian circadian clock oscillation2022

    • Author(s)
      Yuta Otobe, Shunsuke Ito, Michinori Koebis, Atsu Aiba, Yoshitaka Fukada and Hikari Yoshitane
    • Organizer
      米国時間生物学会SRBR 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マウスの空間記憶形成の日周変化とニューロステロイドによる制御2022

    • Author(s)
      清水貴美子、池野知子、前畑佳納子、Wang Qiuyi、高尾敏文、深田吉孝
    • Organizer
      Neuro2022 (第45回日本神経科学大会)
  • [Presentation] Rhythmic transcription of Bmal1 stabilizes the circadian timekeeping system in mammals2022

    • Author(s)
      Hikari Yoshitane, Yasuko O. Abe, Dae W. Kim, Jae K. Kim and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      ヨーロッパ時間生物学会EBRS 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Circadian rhythm of protein-protein interactions and post-translational modifications in the clock protein complex2022

    • Author(s)
      Yuta Otobe, Michinori Koebis, Atsu Aiba, Yoshitaka Fukada and Hikari Yoshitane
    • Organizer
      ヨーロッパ時間生物学会EBRS 2022
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Axelrod Lecture: Chronocode on clock proteins signed by protein kinases2022

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      The 17th Congress of European Biological Rhythms Society 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 青色感受性の錐体視細胞のアイデンティティを決定する転写因子Foxq22022

    • Author(s)
      小川洋平、白木知也、深田吉孝、小島大輔
    • Organizer
      第22回日本光生物学協会年会
  • [Presentation] Circadian quartz: Implication for protein oscillator in mammalian circadian clockwork2022

    • Author(s)
      Hikari Yoshitane
    • Organizer
      Sapporo Symposium on Biological Rhythm
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Roles of Ca2+ Signaling in Molecular Clocks2022

    • Author(s)
      Naohiro Kon
    • Organizer
      Sapporo Symposium on Biological Rhythm
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新生仔マウスの行動における光依存的な変化2022

    • Author(s)
      春井佑希、木股直規、小島大輔
    • Organizer
      日本動物学会第93回大会
  • [Presentation] マウス光感受性網膜神経節細胞における新規光シグナル経路の機能解析2022

    • Author(s)
      木股直規、鳥居雅樹、田中翔大、末長祥一、中尾晴美、饗場篤、小島大輔、深田吉孝
    • Organizer
      日本動物学会第93回大会
  • [Presentation] ゼブラフィッシュのメラノプシン発現ニューロンへの遺伝子発現誘導2022

    • Author(s)
      竹前和彦、小島大輔
    • Organizer
      日本動物学会第93回大会
  • [Presentation] 健康的な生活リズムを支える体内時計を知ろう2022

    • Author(s)
      深田吉孝
    • Organizer
      2022年度第5回「都民講座」
    • Invited
  • [Presentation] 時間タンパク質学:時計タンパク質の相互作用リズムと翻訳後修飾コード2022

    • Author(s)
      吉種光
    • Organizer
      第95回 日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 時計遺伝子Bmal1のリズミックな転写制御を介した概日時計振動の安定化機構2022

    • Author(s)
      阿部泰子、吉種光、Dae Wook Kim、川上聖司、古戎道典、中尾和貴、饗場篤、 Jae Kyoung Kim, 深田吉孝
    • Organizer
      第95回 日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 時計タンパク質の相互作用リズムと翻訳後修飾コード2022

    • Author(s)
      乙部優太、伊藤舜喬、安藤涼音、古戎道典、饗場篤、深田吉孝、吉種光
    • Organizer
      第95回 日本生化学会大会
  • [Presentation] Physiological analyses of the novel signaling pathway in intrinsically photosensitive-retinal ganglion cells of mice2022

    • Author(s)
      Daisuke Kojima, Naoki Kimata, Masaki Torii, Shodai Tanaka, Shoichi Suenaga, Harumi Nakao, Michinori Koebis, Atsu Aiba, Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      日本比較生理生化学会第44回大会
  • [Presentation] Generation of the transgenic line to elucidate the melanopsin-expressing retinal circuit regulating the background adaptation in zebrafish2022

    • Author(s)
      Kazuhiko Takemae, Daisuke Kojima
    • Organizer
      日本比較生理生化学会第44回大会
  • [Presentation] ニューロステロイドによるマウス空間記憶形成の制御とその日周変化2022

    • Author(s)
      清水貴美子、池野知子、前畑佳納子、Wang Qiuyi、高尾敏文、深田吉孝
    • Organizer
      第96回日本薬理学会
  • [Presentation] Functional roles of retinal photoreceptors in non-visual physiologies of vertebrates2022

    • Author(s)
      Daisuke Kojima
    • Organizer
      The 19th International Conference on Retinal Proteins
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 概日時計クオーツ:真核生物でもタンパク質振動子が自律振動する可能性2022

    • Author(s)
      吉種光
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
    • Invited
  • [Presentation] 線虫C.elegansにおいてROR/NHR-23の標的遺伝子の転写リズムは発生から概日性の時間スケールへと周波数変調する2022

    • Author(s)
      廣木進吾、飯野雄一、吉種光
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] Molecular studies on circadian phosphorylation rhythms of CLOCK2022

    • Author(s)
      倉林伸博、乙部優太、吉種光
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] 哺乳類培養細胞を用いた時計の位相同調メカニズムの解析2022

    • Author(s)
      加藤雪、吉種光
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] 高度に同期した時計タンパク質の複合体形成リズムとリン酸化スイッチ2022

    • Author(s)
      乙部優太、古戎道典、饗場篤、深田吉孝、吉種光
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] 時計遺伝子欠損細胞の機能回復実験から迫る時計タンパク質翻訳後修飾の役割2022

    • Author(s)
      伊藤舜喬、乙部優太、深田吉孝、吉種光
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] 加齢に伴い概日リズムの出力が破綻する分子基盤の解明2022

    • Author(s)
      森村太貴、川上聖司、深田吉孝、吉種光
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] Molecular studies on circadian phosphorylation rhythms of CLOCK2022

    • Author(s)
      浅野吉政、酒井誠之介、尾崎遼、鈴木穣、岩崎渉、吉種光、深田吉孝
    • Organizer
      第29回 日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] Phosphorylation of clock proteins and Ca ion signaling2021

    • Author(s)
      Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      Asian Forum of Chronobiology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Hippocampal 7a-hydroxylated neurosteroids upregulated in a training-dependent manner are essential for remote memory formation.2021

    • Author(s)
      Kimiko Shimizu
    • Organizer
      The 1st CJK international meeting/the 44th annual meeting of the Japan neuroscience society
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 光生物学から時間生物学へ転進した経緯: 概日リズムとCaイオンシグナリング2021

    • Author(s)
      深田吉孝
    • Organizer
      第92回日本動物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] Clock aging: a molecular basis for age-related physiological dysfunction2021

    • Author(s)
      Hikari Yoshitane, Satoshi Kawakami, Rina Nunokawa, Yutaka Suzuki, and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      National Academy of Medicine (NAM) Healthy Longevity Global Innovator Summit
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Clock Aging: Molecular basis for age-related functional decline2021

    • Author(s)
      吉種光
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 時計タンパク質複合体の相互作用マップと翻訳後修飾リズム2021

    • Author(s)
      乙部優太、古戎道典、饗場篤、深田吉孝、吉種光
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会
  • [Presentation] Clock aging: a molecular basis for age-related physiological dysfunction2021

    • Author(s)
      Satoshi Kawakami, Rina Nunokawa, Yutaka Suzuki, Yoshitaka Fukada, and Hikari Yoshitane
    • Organizer
      第28回日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] Bmal1の転写リズムを介した概日時計振動の安定化機構2021

    • Author(s)
      Yasuko O. Abe, Hikari Yoshitane, Dae Wook Kim, Michinori Koebis, Kazuki Nakao, Atsu Aiba, Jae Kyoung Kim, and Yoshitaka Fukada
    • Organizer
      第28回日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] 時計タンパク質複合体の相互作用マップと翻訳後修飾リズム2021

    • Author(s)
      乙部優太、古戎道典、饗場篤、深田吉孝、吉種光
    • Organizer
      第28回日本時間生物学会学術大会
  • [Presentation] いま我が国の生物リズム分野では何に取り組むべきか?2021

    • Author(s)
      深田吉孝
    • Organizer
      生物リズム若手研究者の集い2021
    • Invited
  • [Presentation] 「時」を生み出すタンパク質複合体の相互作用と翻訳後修飾リズム2021

    • Author(s)
      吉種光、乙部優太、深田吉孝
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Chronocode: molecular basis for mammalian circadian clock oscillation2021

    • Author(s)
      Yuta. Otobe, Shunsuke. Ito, Michinori Koebis, Atsu Aiba, Yoshitaka Fukada and Hikari Yoshitane
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Functional analyses of physiological outputs of G-protein signaling pathways in intrinsically photosensitive-retinal ganglion cells.2021

    • Author(s)
      木股直規、鳥居雅樹、田中翔大、末長祥一、中尾晴美、饗場篤、小島大輔、深田吉孝
    • Organizer
      日本比較生理生化学会第43回大会
  • [Presentation] Foxq2 determines blue cone identity in zebrafish.2021

    • Author(s)
      小川洋平、白木知也、深田吉孝、小島大輔
    • Organizer
      日本比較生理生化学会第43回大会
  • [Presentation] あなたは何時に実験しましたか?~概日時計の基礎から応用まで~2021

    • Author(s)
      吉種光
    • Organizer
      第 78回 Scienc-ome
    • Invited
  • [Book] Spectroscopic analysis of wavelength sensitivities of opsin-type photoreceptor proteins. in “Circadian Clocks”, Neuromethods, vol 186, (T. Hirota, M. Hatori, S. Panda, eds.)2022

    • Author(s)
      Daisuke Kojima, Yoshitaka Fukada
    • Total Pages
      17
    • Publisher
      Humana
    • ISBN
      978-1-0716-2576-7
  • [Remarks] 時計遺伝子Bmal1が時刻依存的に転写される仕組みと意義

    • URL

      https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2022/7954/

  • [Remarks] 青色センサー遺伝子の制御メカニズム ~脊椎動物の色覚の起源に迫る~

    • URL

      https://www.s.u-tokyo.ac.jp/ja/press/2021/7529/

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Published: 2023-12-25  

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