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2021 Fiscal Year Annual Research Report

Identification of higher-order-epigenetic modification machineries and development of potential novel therapeutics in severe virus infection

Research Project

Project/Area Number 17H06179
Research InstitutionNational Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition

Principal Investigator

今井 由美子  国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 ワクチン・アジュバント研究センター, プロジェクトリーダー (50231163)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 久場 敬司  九州大学, 大学院医学研究院, 教授 (10451915)
Project Period (FY) 2017-05-31 – 2022-03-31
Keywordsウイルス / クロマチン / 重症感染症
Outline of Annual Research Achievements

本研究ではインフルエンザウイルスや新型コロナウイルス(SARS-CoV2)等のウイルス感染に伴う宿主高次エピゲノムの作動原理について研究した。インフルエンザウイルス感染に伴って宿主クロマチンの構造がダイナミックに変化すること、特にH4K20のトリメチル化酵素であるSuv4-20h2は非感染状態では、クロマチン構造の維持に関っているコヒーシンと結合しているが、感染に伴ってSuv4-20h2とコヒーシンの結合が低下して、特定のゲノム領域のバウンダリーにローディングして、クロマチンループが形成され、同領域の遺伝発現が誘導され、感染病態の形成に関わることを見出した。このようなコヒーシンを介したクロマチンの構造変化(ループ形成等)を介したエピジェネティクス制御はウイルス感染症の新しい治療法やバイオマーカーの開発につながることが示唆された。さらに、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)発生後、臨床検体を使ったエピゲノムを含むオミクス解析を行い、COVID-19 の重症化とヒストン脱メチル化酵素を中心としたエピジェネティクス制御に関する知見を得た。さらに、健常高齢者の臨床検体を用いたシングルセル解析から非感染状態において、個人個人でエピゲノム(オープンクロマチン構造等)状態が異なり、免疫学的多様性に関わっていることを明らかにした。これはウイルス感染症に対する精密医療の基盤情報となるものである。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (28 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 8 results) Presentation (19 results) (of which Invited: 12 results)

  • [Journal Article] 新型コロナウイルス感染症の重症化予測AIモデル2023

    • Author(s)
      衣笠泰葉, 西野泰子, Mara Covarrubias, 今井由美子 他
    • Journal Title

      人工呼吸

      Volume: in press Pages: -

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamics of Higher-Order Chromatin Structure in Response to Viral Infection and its Potential for Treatment of Infectious Diseases2022

    • Author(s)
      Imai Y
    • Journal Title

      Journal of Infectious Diseases & Therapy

      Volume: 10 Pages: 1000506

    • DOI

      10.4172/2332-0877.1000506

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Intensive single-cell analysis reveals immune-cell diversity among healthy individuals2022

    • Author(s)
      Kashima Yukie、Kaneko Keiya、Reteng Patrick、Yoshitake Nina、Runtuwene Lucky Ronald、Nagasawa Satoi、Onishi Masaya、Seki Masahide、Suzuki Ayako、Sugano Sumio、Sakata-Yanagimoto Mamiko、Imai Yumiko、Nakayama-Hosoya Kaori、Kawana-Tachikawa Ai、Mizutani Taketoshi、Suzuki Yutaka
    • Journal Title

      Life Science Alliance

      Volume: 5 Pages: e202201398

    • DOI

      10.26508/lsa.202201398

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of Galectin-7 as a crucial metastatic enhancer of squamous cell carcinoma associated with immunosuppression2022

    • Author(s)
      An Jianbo、Nagaki Yushi、Motoyama Satoru、Kuze Yuta、Hoshizaki Midori、Kemuriyama Kohei、Yamaguchi Tomokazu、Ebihara Takashi、Minamiya Yoshihiro、Suzuki Yutaka、Imai Yumiko、Kuba Keiji
    • Journal Title

      Oncogene

      Volume: 41 Pages: 5319~5330

    • DOI

      10.1038/s41388-022-02525-1

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ACE2-like enzyme B38-CAP suppresses abdominal sepsis and severe acute lung injury2022

    • Author(s)
      Minato Takafumi、Yamaguchi Tomokazu、Hoshizaki Midori、Nirasawa Satoru、An Jianbo、Takahashi Saori、Penninger Josef M.、Imai Yumiko、Kuba Keiji
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 17 Pages: e0270920

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0270920

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Dynamics of the host chromatin three-dimensional response to influenza virus infection2021

    • Author(s)
      Shiimori Masami、Nukiwa Ryota、Imai Yumiko
    • Journal Title

      International Immunology

      Volume: 33 Pages: 541~545

    • DOI

      10.1093/intimm/dxab043

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Drug Repurposing Prediction and Validation From Clinical Big Data for the Effective Treatment of Interstitial Lung Disease2021

    • Author(s)
      Siswanto Soni、Yamamoto Hiroki、Furuta Haruka、Kobayashi Mone、Nagashima Takuya、Kayanuma Gen、Nagayasu Kazuki、Imai Yumiko、Kaneko Shuji
    • Journal Title

      Frontiers in Pharmacology

      Volume: 12 Pages: 635293

    • DOI

      10.3389/fphar.2021.635293

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ACE2-like carboxypeptidase B38-CAP protects from SARS-CoV-2-induced lung injury2021

    • Author(s)
      Yamaguchi Tomokazu、Hoshizaki Midori、Minato Takafumi、Yumiko Imai et al
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 6791

    • DOI

      10.1038/s41467-021-27097-8

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Suv4-20h2 protects against influenza virus infection by suppression of chromatin loop formation2021

    • Author(s)
      Shiimori Masami、Ichida Yu、Nukiwa Ryota、Sakuma Toshie、Abe Haruka、Kajitani Rei、Fujino Yuji、Kikuchi Akira、Kawamura Takeshi、Kodama Tatsuhiko、Toyooka Shinichi、Shirahige Katsuhiko、Schotta Gunnar、Kuba Keiji、Itoh Takehiko、Imai Yumiko
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 24 Pages: 102660~102660

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102660

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] ウイルスに対する宿主生命システムの動作原理の解明と新規治療基盤の確立2023

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第147回日本薬理学会関東部会
    • Invited
  • [Presentation] ウイルスに対する生体システムの応答2023

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      レドックスR&D戦略委員会
    • Invited
  • [Presentation] ウイルス感染のエピジェネティクス制御機構と創薬応用2023

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第32回循環薬理学会
    • Invited
  • [Presentation] COVID-19感染症 重症化/合併症の基礎メカニズム解明から創薬応用へ2022

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      日本学術会議・日本薬学会主催シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] Role of histone ubiquitination in SARS-CoN2 and influenza virus infection2022

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第51回日本免疫学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] COVID-19の医療情報を用いた長期・短期の重症化予測AIアルゴリズムの開発2022

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第4回日本メディカルAI学会学術集会
  • [Presentation] ICU関連筋委縮のマウスモデルを用いた解析2022

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第95回日本薬理学会年会
  • [Presentation] ウイルス感染におけるヒストンユビキチン化の役割2022

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第95回日本薬理学会年会
  • [Presentation] Systemic host response to virus and the development of precision medicine for infectious disease2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      沖縄科学技術大学院大学(OIST)セミナー
  • [Presentation] マウスモデルを用いた集中治療に関連した筋力低下 ; ICU acquired weakness(ICU-AW)の病態解析2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第140回日本薬理学会近畿部会
  • [Presentation] 輝く女性の未来がはじまる-関西から世界へ繋げるダイバーシティ研究環境2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      大阪大学シンポジウム
    • Invited
  • [Presentation] ウイルスに対する宿主応答システムの理解と感染症精密医療2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      大阪大学微生物病研究所Advanced Seminar
    • Invited
  • [Presentation] COVID-19の精密医療を目指した多階層おミクスの計測・解析プラットフォームの構築2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第43回日本呼吸療法医学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] ARDSマウスモデルを用いたICU関連筋力低下の病態の検討2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第43回日本呼吸療法医学会学術集会
  • [Presentation] 振興・再興感染症制圧に向けての取り組み、現状と未来について2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第1回NIID-NCGM共同webセミナー
    • Invited
  • [Presentation] 感染症克服について2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      東京大学医科学研究所大学院セミナー
    • Invited
  • [Presentation] SARS-CoV-2スパイクタンパク質に対する人工核酸アプタマーの開発2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      日本化学会 第101春季年会
  • [Presentation] COVID-19の精密医療を目指した多階層オミクスの計測・解析プラットフォームの構築2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第94回日本薬理学会年会
    • Invited
  • [Presentation] ウイルス感染に対する宿主クロマチン4D応答機構2021

    • Author(s)
      今井由美子
    • Organizer
      第14回次世代アジュバント研究会
    • Invited

URL: 

Published: 2023-12-25  

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