Exploring novel pathogenic enteric viruses from selective metagenomic analysis of domestic wastewater

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17K06614
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Civil and environmental engineering
• Research Institution: The University of Tokyo (2018-2019); Ochanomizu University (2017)
• Principal Investigator: Kazama Shinobu 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 特任講師 (20749444)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 腸管系ウイルス / メタゲノム / 流入下水 / 未知塩基配列

Outline of Final Research Achievements

Using the selective metagenomic analysis method that efficiently detects single-stranded (+) RNA viruses, we succeeded in detecting a sequence considered to be an unknown viral genome in raw sewage and human stool samples. The sequence was detected in 100% of the raw sewage samples (31 samples) and 86% in the stool samples of gastroenteritis patients (50 samples). The method used in this study is expected to detect novel virus. It was also suggested that the sequence detected in this study is useful as a new indicator for fecal contamination.

Free Research Field

土木環境システム

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

途上国のみならず先進国においても，毎年ノロウイルス等の病原微生物による感染性胃腸炎が流行しており，我が国においてもその社会的損失は計り知れない。今後，社会の国際化や地球温暖化等による病原微生物の生態変化によって，新興ウイルスあるいは，これまで我が国では感染報告の無いウイルスによる新たな感染症の増加が懸念される。本研究では、新たなウイルスと考えられるゲノムの一部を下水から検出し、また地域における分布状況を示した。今後、本手法を応用することで、ウイルス感染症の発生状況を把握し，将来的なウイルス感染症の早期検出が期待される。