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2017 Fiscal Year Research-status Report

染色体凝縮を担うコンデンシン制御サブユニットの構造基盤の解明

Research Project

Project/Area Number 17K07314
Research InstitutionUniversity of Shizuoka

Principal Investigator

原 幸大  静岡県立大学, 薬学部, 助教 (80729343)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 橋本 博  静岡県立大学, 薬学部, 教授 (40336590)
Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
KeywordsX線結晶構造解析 / タンパク質複合体 / タンパク質間相互作用 / 染色体凝縮
Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、染色体凝縮に関わるコンデンシンの制御サブユニットの結晶構造を決定すると共に、再構成系を用いた構造機能相関解析を通して、染色体凝縮の作用機序を原子レベルで明らかにすることである。染色体凝縮は正常な細胞分裂を行うための必須機能である一方、その機能不全は細胞のがん化やダウン症・小頭症などの遺伝性疾患を引き起こす。従って、コンデンシンの分子メカニズムを理解することで染色体凝縮を標的とした新規抗がん剤の創出が期待でき、産業活用にインパクトを与える。
H29年度はコンデンシンI制御サブユニットであるCAP-G-CAP-H複合体の結晶化とX線回折実験を行った。10オングストローム分解能と低分解能な結晶の最適化を行い、3オングストローム分解能のX線回折データを収集することに成功した。また、構造解析に必須のパラメータの一つである空間群、格子定数の決定に成功した。空間群はP21、格子定数はa=122、b=62 、c=131オングストローム、β=93°であり、非対称単位中に約1000アミノ酸残基からなるCAP-G-CAP-Hへテロ二量体が二つ含まれることが推測される。今後は、金や水銀、プラチナなどの重金属やセレノメチオニン置換体を用いたSAD法による位相決定を進める。コンデンシンIのもう一つの制御サブユニットであるCAP-D2-CAP-H複合体に関しては、概ね組換えタンパク質の調製方法を確立したが、現在までに結晶は得られていない。引き続き、結晶化条件の探索を継続して行う。コンデンシンII制御サブユニットの調製についても、ヒト以外の脊椎動物由来の組換えタンパク質発現系を構築とその性状の評価を並行して進める。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

CAP-G-CAP-Hコンデンシン制御サブユニットの結晶の最適化を行い、構造解析可能な分解能のX線回折データを収集することに成功した。CAP-D2-CAP-H複合体に関しても概ね結晶化に適した調製方法を確立することが出来た。

Strategy for Future Research Activity

H30年度はCAP-G-CAP-H複合体の位相決定、及び相互作用解析を行う。また構造解析に基づきデザインした変異体を用いて、再構成系による細胞内機能の評価を行う。他の制御サブユニットの調製方法の確立、及び結晶化条件の探索を引き続き行う。

Causes of Carryover

(理由)H29年度は冷凍機付インキュベーターMIR-154S-PJ(パナソニック製)の購入を予定していたが、共通機器を利用して十分な実験が行えたため、機器を導入する必要性が生じなかった。

(使用計画)H30年度は組換えタンパク質の精製と結晶化を精力的に行っていくため、一般試薬や結晶化試薬等の消耗品費が多くかかることが見込まれる。また、タンパク質の構造解析に使用するPCの導入を現在、検討している。

  • Research Products

    (27 results)

All 2018 2017

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (24 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Structure of proliferating cell nuclear antigen (PCNA) bound to the APIM peptide reveals universality of PCNA interaction2018

    • Author(s)
      Kodai Hara, Masayuki Uchida, Risa Tagata, Hideshi Yokoyama, Yoshinobu Ishikawa, Asami Hishiki, Hiroshi Hashimoto
    • Journal Title

      Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun

      Volume: F74 Pages: 214-221

    • DOI

      10.1107/S2053230X18003242.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural basis for the molecular Interactions in DNA damage tolerances2017

    • Author(s)
      Hiroshi Hashimoto, Asami Hishiki, Kodai Hara, Sotaro Kikuchi
    • Journal Title

      Biophys Physicobiol

      Volume: 14 Pages: 199-205

    • DOI

      10.2142/biophysico.14.0_199.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dynamic feature of mitotic arrest deficient 2-like protein 2 (MAD2L2) and structural basis for its interaction with chromosome alignment maintaining phosphoprotein (CAMP)2017

    • Author(s)
      Kodai Hara, Shota Taharazako, Masanori Ikeda, Hiroki Fujita, Yoshiko Mikami, Sotaro Kikuchi, Asami Hishiki, Hideshi Yokoyama, Yoshinobu Ishikawa, Shin-ichiro Kanno, Kozo Tanaka, Hiroshi Hashimoto
    • Journal Title

      J Biol Chem

      Volume: 292 Pages: 17658-17667

    • DOI

      10.1074/jbc.M117.804237.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] The dimerization domain of the hypertrophy-responsive transcription factor GATA4 is a therapeutic target for heart failure2018

    • Author(s)
      Satoshi Shimizu, Kodai hara, Yoichi Sunagawa, Asami Hishiki, Masafumi Funamoto, Yusuke Miyazaki, Yasufumi Katanasaka, Hiromichi Wada, Koji Hasegawa, Hiroshi Hashimoto, Tatsuya Morimoto
    • Organizer
      第82回日本循環器学会学術集会
  • [Presentation] PsoFのメチルトランスフェラーゼドメインの構造解析2018

    • Author(s)
      松下拓磨、岸本真治、山本剛、原幸大、恒松雄太、橋本博、渡辺賢二
    • Organizer
      2017年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] 新規構造を持つ環化酵素CghAのX線結晶構造解析とその立体選択的反応機構2018

    • Author(s)
      横山葵、前田直哉、岸本真治、佐藤道大、原幸大、恒松雄太、橋本博、渡辺賢二
    • Organizer
      2017年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] PCNAとAPIMの複合体の構造と機能2018

    • Author(s)
      内田雅之、原幸大、田形梨紗、横山英志、石川吉伸、菱木麻美、橋本博
    • Organizer
      2017年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] 染色体凝縮を担うコンデンシン制御サブユニットの精製と結晶化2018

    • Author(s)
      右田智子、原幸大、清水研一郎、平野達也、橋本博
    • Organizer
      2017年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] キネトコアと微小管の接着を制御するMAD2L2-CAMP複合体の構造解析2018

    • Author(s)
      原幸大、田原迫奨大、菱木麻美、石川吉伸、菅野新一郎、田中耕三、橋本博
    • Organizer
      2017年度量子ビームサイエンスフェスタ
  • [Presentation] The dimerization domain of GATA4 plays an important role in the development cardiomyocyte hypertrophy2018

    • Author(s)
      Satoshi Shimizu, Kodai Hara, Yoichi Sunagawa, Asami Hishiki, Masafumi Funamoto, Yusuke Miyazaki, Yasufumi Katanasaka, Hiromichi Wada, Koji Hasegawa, Hiroshi Hashimoto, Tatsuya Morimoto
    • Organizer
      第1回日本循環器基礎研究フォーラム
  • [Presentation] 心肥大応答を司る転写因子GATA4の二量体形成・DNA結合部位の同定と結晶化2018

    • Author(s)
      清水聡史、原幸大、砂川陽一、菱木麻美、宮崎雄輔、刀坂泰史、船本雅文、Nurmila Sari、清水果奈、和田啓道、長谷川浩二、橋本博、森本達也
    • Organizer
      日本薬学会第138年会
  • [Presentation] CYCLOPENASE, HEMOCYANIN-LIKE ENZYME CONVERTING 6,7-BICYCLO RING OF CYCLOPENIN TO FORM 6,6-QUINOLONE CORE OF VIRIDICATIN-TYPE FUNGAL ALKALOID2017

    • Author(s)
      Shinji Kishimoto, Yuta Tsunematsu, Kodai Hara, Hiroshi Hashimoto, Kenji Watanabe
    • Organizer
      IUMS 2017, IUMS2017-1219
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Crystallographic structure of Mad2L2-CAMP complex, a regulator of kinetochore-microtubule attachment2017

    • Author(s)
      Kodai Hara, Shota Taharazako, Asami Hishiki, Yoshinobu Ishikawa, Shin-ichiro Kanno, Kozo Tanaka, Hiroshi Hashimoto
    • Organizer
      SMC proteins 2017 “chromosomal organizers from bacteria to human"
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Structure and interaction of PCNA-APIM complex2017

    • Author(s)
      Kodai Hara, Masayuki Uchida, Risa Tagata, Hideshi Yokoyama, Yoshinobu Ishikawa, Asami Hishiki, Hiroshi Hashimoto
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
  • [Presentation] The dimerization domain of GATA4 is a therapeutic target for heart failure2017

    • Author(s)
      Satoshi Shimizu, Kodai Hara, Yoichi Sunagawa, Asami Hishiki, Masafumi Funamoto, Yusuke Miyazaki, Yasufumi Katanasaka, Hiromichi Wada, Koji Hasegawa, Hiroshi Hashimoto, Tatsuya Morimoto
    • Organizer
      第22回静岡健康・長寿学術フォーラム
  • [Presentation] 染色体凝縮を担うコンデンシン制御サブユニットの精製と結晶化2017

    • Author(s)
      右田智子、原幸大、清水研一郎、平野達也、橋本博
    • Organizer
      平成29年度日本結晶学会年会
  • [Presentation] 心肥大応答を司る転写因子GATA4の結晶構造解析2017

    • Author(s)
      清水 聡史、原 幸大、砂川 陽一、菱木 麻美、宮崎 雄輔、刀坂 泰史、和田 啓道、 長谷川 浩二、橋本 博、森本 達也
    • Organizer
      第三回J-ISCP学術集会
  • [Presentation] 特異な反応を触媒する新規酵素シクロペナーゼの発見と触媒機構の解明2017

    • Author(s)
      岸本真治、原幸大、橋本博、Kendall N. Houk、恒松雄太、渡辺賢二
    • Organizer
      第7回食品薬学シンポジウム
  • [Presentation] 立体選択的な環化反応を触媒する酵素CghAの反応機構解析2017

    • Author(s)
      横山葵、岸本真治、佐藤道大、原幸大、恒松雄太、橋本博、渡辺賢二
    • Organizer
      日本生薬学会第64回年会
  • [Presentation] シクロペナーゼAsqIが触媒する反応機構の解明2017

    • Author(s)
      岸本真治、原幸大、 橋本博、Kendall N. Houk、恒松雄太、渡辺賢二
    • Organizer
      日本生薬学会第64回年会
  • [Presentation] 染色体分配に関わるMAD2L2-CAMP複合体の構造基盤と相互作用機構の解明2017

    • Author(s)
      原幸大、田原迫奨大、池田真教、藤田拡樹、三上嘉子、菊池壮太郎、菱木麻美、横山英志、石川吉伸、菅野新一郎、田中耕三、橋本博
    • Organizer
      第35回染色体ワークショップ
  • [Presentation] テンプレートスイッチに関わるZRANB3のAlkB homolog 2 PCNA-binding motif (APIM)とPCNAの複合体の構造基盤と相互作用機構の解明2017

    • Author(s)
      原幸大、内田雅之、田形梨紗、横山英志、石川吉伸、菱木麻美、橋本博
    • Organizer
      第24回DNA複製・組換え・修復ワークショップ
  • [Presentation] 心筋細胞肥大に関わる転写因子GATA4の二量体形成部位の同定と結晶化2017

    • Author(s)
      清水聡史、原幸大、砂川陽一、菱木麻美、清水果奈、船本雅文、宮崎雄輔、刀坂泰史、和田啓道、 長谷川浩二、橋本博、森本達也
    • Organizer
      日本病院薬剤師会東海ブロック・日本薬学会東海支部 合同学術大会2017
  • [Presentation] 細胞分裂におけるMAD2L2-CAMP複合体の構造と相互作用機構の解明2017

    • Author(s)
      原幸大、田原迫奨大、菱木麻美、石川吉伸、菅野新一郎、田中耕三、橋本博
    • Organizer
      第63回 日本薬学会東海支部 総会・大会
  • [Presentation] 染色体凝縮を担うコンデンシン制御サブユニットの精製と結晶化2017

    • Author(s)
      右田智子、原幸大、清水研一郎、平野達也、橋本博
    • Organizer
      第63回 日本薬学会東海支部 総会・大会
  • [Presentation] PCNAとHLAペプチドの結晶学的研究2017

    • Author(s)
      鈴木麻里子、原幸大、菱木麻美、石川吉伸、橋本博
    • Organizer
      第63回 日本薬学会東海支部 総会・大会
  • [Presentation] 細胞分裂に関わるMAD2L2-CAMP複合体の構造解析2017

    • Author(s)
      原幸大
    • Organizer
      2017年度 遺伝研研究会「染色体構築と安定化を担う分子機構」
    • Invited

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Published: 2018-12-17  

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