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2018 Fiscal Year Research-status Report

3D ultrastructural analysis of plant endomembrane with high pressure freezing and correlative array tomography

Research Project

Project/Area Number 17K07477
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

豊岡 公徳  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 上級技師 (10360596)

Project Period (FY) 2017-04-01 – 2020-03-31
Keywords高圧凍結技法 / アレイトモグラフィー / 植物細胞 / 3次元超微形態 / 光電子相関顕微鏡 / 細胞内輸送 / 膜交通 / 電子顕微鏡
Outline of Annual Research Achievements

通常の化学固定で良好な光電子相関顕微鏡(CLEM)解析の結果を得ているERボディGFP及びペルオキシソームGFP発現株、エンドメンブレン系分子のSCAMP2-YFPや SYP41-YFP形質転換体シロイヌナズナの芽生え(発芽7-10日の根、葉)を用いて、高圧凍結固定・凍結置換を行った。アクリル系樹脂包埋のあとに、ダイヤモンドナイフを用いてウルトラミクロトームにより500nmまたは1000nmの準超薄切片を作製し、カバーガラスに貼付け、共焦点レーザー顕微鏡を用いて蛍光撮影を行った。いくつかのGFP退色防止剤等を含め、最も自家蛍光が少なく、蛍光色素の蛍光強度が強い処理条件を検討したが良好な結果を得られなかった。そこで、低pHに強い緑色蛍光タンパク質または赤色蛍光タンパク質RFPで標識したゴルジ体やエンドソームなどのエンドソーム系のコンストラクト作製および形質転換体の作製を進めた。RFP結合SCAMP2形質転換タバコ培養細胞を用いて、分泌に関与する小胞塊のCLEM解析を進めた。日立ハイテク社とともに、光顕で撮影した部位と同一箇所をFE-SEMで撮影し、正確かつ容易に画像が重ね合わせることができるCLEM解析システムMirrorCLEMの改良を進め、ソフトウェアのグラフィックユーザーインターフェイスを改良し、利便性を向上させた。
これらの成果はオーストラリアで開催された国際顕微鏡会議(IMC19)や日本顕微鏡学会などで発表を行った。また、退色防止剤を用いた蛍光復帰によりCLEM法を国際誌に投稿した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

一部の蛍光タンパク質を結合させた細胞内輸送系の形質転換体作製が遅れているが概ね順調に進展している。新しい高圧凍結装置を導入し、その技術検討が加わり時間を要しが、概ね順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

今までより3倍凍結面積が大きい試料を凍結固定できる新しい高圧凍結装置を用いて、シロイヌナズナなどの植物個体の凍結技術の検討を行う。Z軸方向の相関を取るのが難しいため、準超薄切片の蛍光撮影とFE-SEM観察での相関法を検討する。アライメントマークをつけたカバーガラス等用い、最新の共焦点レーザー顕微鏡で広域かつZ方向に撮影するとともに、FE-SEMでも連続切片を撮影するなど工夫する。 100nmなど可能な限り薄い切片を作製し、最新の高感度共焦点レーザー顕微鏡により微弱な蛍光を検出かつ自家蛍光を取り除き、さらにFE-SEMで連続切片撮影することで細胞内膜系の3次元超微形態を明らかにする。

  • Research Products

    (16 results)

All 2019 2018 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 4 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] A Rho-actin signaling pathway shapes cell wall boundaries in Arabidopsis xylem vessels2019

    • Author(s)
      Sugiyama Yuki、Nagashima Yoshinobu、Wakazaki Mayumi、Sato Mayuko、Toyooka Kiminori、Fukuda Hiroo、Oda Yoshihisa
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 08396-7

    • DOI

      10.1038/s41467-019-08396-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Keeping the shape of plant tissue for visualizing metabolite features in segmentation and correlation analysis of imaging mass spectrometry in Asparagus officinalis2019

    • Author(s)
      Nakabayashi Ryo、Hashimoto Kei、Toyooka Kiminori、Saito Kazuki
    • Journal Title

      Metabolomics

      Volume: 15 Pages: 24

    • DOI

      10.1007/s11306-019-1486-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Plastid translation is essential for lateral root stem cell patterning in Arabidopsis thaliana2018

    • Author(s)
      Nakata Miyuki T.、Sato Mayuko、Wakazaki Mayumi、Sato Nozomi、Kojima Koji、Sekine Akihiko、Nakamura Shiori、Shikanai Toshiharu、Toyooka Kiminori、Tsukaya Hirokazu、Horiguchi Gorou
    • Journal Title

      Biology Open

      Volume: 7 Pages: 028175

    • DOI

      10.1242/bio.028175

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Stress granule formation is induced by a threshold temperature rather than a temperature difference inArabidopsis2018

    • Author(s)
      Hamada Takahiro、Yako Mako、Minegishi Marina、Sato Mayuko、Kamei Yasuhiro、Yanagawa Yuki、Toyooka Kiminori、Watanabe Yuichiro、Hara-Nishimura Ikuko
    • Journal Title

      Journal of Cell Science

      Volume: 131 Pages: 216051

    • DOI

      10.1242/jcs.216051

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A whole-cell electron tomography model of vacuole biogenesis in Arabidopsis root cells2018

    • Author(s)
      Cui Yong、Cao Wenhan、He Yilin、Zhao Qiong、Wakazaki Mayumi、Zhuang Xiaohong、Gao Jiayang、Zeng Yonglun、Gao Caiji、Ding Yu、Wong Hiu Yan、Wong Wing Shing、Lam Ham Karen、Wang Pengfei、Ueda Takashi、Rojas-Pierce Marcela、Toyooka Kiminori、Kang Byung-Ho、Jiang Liwen
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 5 Pages: 95~105

    • DOI

      10.1038/s41477-018-0328-1

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Abscisic Acid Acts as a Regulator of Molecular Trafficking through Plasmodesmata in the Moss Physcomitrella patens2018

    • Author(s)
      Kitagawa Munenori、Tomoi Takumi、Fukushima Tomoki、Sakata Yoichi、Sato Mayuko、Toyooka Kiminori、Fujita Tomomichi、Sakakibara Hitoshi
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 60 Pages: 738~751

    • DOI

      10.1093/pcp/pcy249

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 植物試料切片を用いたYAG-BSE走査電顕観察法の検討2019

    • Author(s)
      佐藤繭子、若崎眞由美、宮彩子、武田紀子、豊岡公徳
    • Organizer
      日本顕微鏡学会 第43回関東支部講演会
  • [Presentation] 光電子相関顕微鏡法を用いた植物メリステムの形態観察2018

    • Author(s)
      宮彩子、佐藤繭子、成川苗子、前田躍、許斐麻美、星野吉延、豊岡公徳
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第74回学術講演会
  • [Presentation] シロイヌナズナ根端分裂組織のQCの形態的特徴2018

    • Author(s)
      宮彩子、佐藤繭子、若崎眞由美、豊岡公徳
    • Organizer
      日本植物形態学会 第29回大会
  • [Presentation] 高分解能走査電顕を用いた細胞内小器官の光電子相関顕微鏡解析2018

    • Author(s)
      豊岡公徳, 成川苗子,宮彩子,佐藤繭子,前田躍,許斐麻美,星野吉延
    • Organizer
      第74回日本顕微鏡学会総会・学術講演会
  • [Presentation] 光-電子相関顕微鏡法(CLEM):再生医療研究への応用に向けて2018

    • Author(s)
      豊岡公徳
    • Organizer
      第74回日本顕微鏡学会総会・学術講演会
  • [Presentation] メリステムの超微形態を光電子相関顕微鏡法を用いて捉える2018

    • Author(s)
      宮彩子、佐藤繭子、齋藤夕子、前田躍、許斐麻美、星野吉延、豊岡公徳
    • Organizer
      日本植物学会第82回大会
  • [Presentation] 高圧凍結技法を用いた藻類・植物の電子顕微鏡解析2018

    • Author(s)
      佐藤繭子, 豊岡公徳
    • Organizer
      日本植物学会第82回大会
  • [Presentation] Development of rapid and accurate correlative light and electron microscopy for fluorescence-labeled organelles using light microscopes and FE-SEM2018

    • Author(s)
      Kiminori Toyooka, Naeko Narikawa, Ayako Miya, Mayuko Sato, Yaku Maeda, Mami Konomi, Yoshinobu Hoshino
    • Organizer
      19th International Microscopy Congress (IMC19)
    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 理研CSRS 質量分析・顕微鏡解析ユニット 顕微鏡解析室

    • URL

      http://bioem.riken.jp

  • [Patent(Industrial Property Rights)] アライメントシステム及び位置合わせ用シール2018

    • Inventor(s)
      前田躍・星野吉延・豊岡公徳
    • Industrial Property Rights Holder
      前田躍・星野吉延・豊岡公徳
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      197708

URL: 

Published: 2019-12-27  

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