慢性腎臓病の石灰化冠動脈病変を標的とした新規microRNAsの探索

2020 Fiscal Year Research-status Report

• Project/Area Number: 17K09563
• Research Institution: Kanazawa Medical University
• Principal Investigator: 赤尾 浩慶 金沢医科大学, 医学部, 准教授 (50398997)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: 石灰化冠動脈病変 / 慢性腎臓病 / microRNAs / エクソソーム / 次世代シーケンサ―

Outline of Annual Research Achievements

慢性腎臓病患者の予後を規定する冠動脈硬化症に対する新たな治療戦略策定を目指し、動脈石灰化の発生と進展の機序解明を目的とする。冠動脈rotablator治療後に冠循環から体循環に流出する動脈硬化血管壁由来分子を含む血液検体を用い、in vivoのアテローム性動脈硬化に関わるエクソソーム内miRNAを同定し、治療前後の動態ならびにその機能を解明し、治療法開発への発展を目指す。本年度も高感度が期待できる次世代シーケンサーを用いた解析で、前年度に引き続き慢性腎臓病患者の石灰化冠動脈に対するRotablator治療前後4ポイントで採取した検体の測定を予定した。和光純薬Wako exosome Isolation kit PSを用いて血清からエクソソームを抽出し、得られたエクソソームからWako マイクロRNAエキストラクターSPキットを使用してRNAを抽出、得られたサンプルについて、ライブラリ調製をIllumina社SMARTer smRNA-Seq kitで行う予定であったが、COVID-19の影響にて、条件があった症例の検体収集が出来なかった。前回ライブラリが作成できた1症例のNextSeqによりシーケンスを実施して、得られた読み取り結果をリファレンスゲノムHuman genome hg19を選択してStrand NGS ver3.1ソフトにて解析し治療前後で変化したエクソソーム内miRNAを同定できているため、今後さらに症例を追加し測定を行い、治療前後で変化したエクソソーム内miRNAを確認する予定である。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

COVID-19の影響で追加症例検体の収集困難と、測定キットの入手が困難となっているため。追加症例検体を用いてライブラリ作成を行ったところ、必要量のライブラリが作成できないことが多く、引き続き追加症例の収集と測定を予定している。 研究協力者の助言や実質的な助けを得て、研究計画に基づいた計画と方法で検討を進めている。

Strategy for Future Research Activity

基礎実験で次世代シーケンサーを用いて解析を行なうことにより十分なリードが得られ様々なRNA分子種が検出され、感度、精度共に満足のいく実験条件を設定できたので、今後はこの実験系で追加サンプルとして用意できた慢性腎臓病患者の石灰化冠動脈に対するRotablator治療前後で採取した検体を用いアテローム性動脈硬化に関わるmiRNAを同定し、そのmiRNAの治療前後の動態ならびにその機能を解明することを目指す。また候補miRNAのvalidationをRNAサンプルを用いてreal-time PCRで行い、再現性を確認する予定である。

Causes of Carryover

症例検体を用いてライブラリ作成を行ったところ、必要量のライブラリが作成できず、測定が困難であった事とCOVID-19の影響で、症例収集が困難であった為。現在、さらに症例収集を行い測定を予定している。NextSeqによるシーケンスの実施及び解析、real time PCRの施行時の費用として使用を計画している。