analysis of novel transcript variant of tyrosine kinase gene in small cell lung cancer using the NanoString nCounter

2020 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17K09669
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: 高橋 史行 順天堂大学, 医学部, 准教授 (70327823)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 田島 健 順天堂大学, 医学部, 講師 (50384102) ; 茂櫛 薫 順天堂大学, 医学(系)研究科(研究院), 非常勤講師 (60569292) ; 高橋 和久 順天堂大学, 医学部, 教授 (80245711)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: 小細胞肺癌

Outline of Annual Research Achievements

小細胞肺癌(Small cell lung cancer; SCLC)は肺癌全体の約15％を占め、初回の抗癌剤治療にはよく反応するものの、容易に多剤耐性を獲得し再発する極めて予後不良な難治性疾患である。非小細胞肺癌をはじめとした複数の癌腫において、ゲノム網羅的な遺伝子解析により治療標的となる遺伝子異常が同定され、中でもチロシンキナーゼ(Tyrosine kinase; TK)遺伝子異常は、患者の予後を飛躍的に改善させている。しかしSCLCにおいては未だに有効な分子標的治療の臨床応用には至っておらず、その開発は急務である。本研究の目的は、様々なSCLC細胞株や臨床検体を用いて、網羅的なmRNAベース・スクリーニング解析を行い、SCLCの新規治療標的となりうる遺伝子異常を同定することである。NanoString社のnCounter解析では、遺伝子の5’側と3’側にそれぞれ対応するprobeを設定し、そのimbalanceを検出することにより、融合遺伝子あるいは転写変異体の網羅的なmRNAベース・スクリーニング解析が可能である。申請者らはSCLC細胞株においてnCounter解析により、あるTK遺伝子の転写のimbalanceを検出し、次世代シークエンサーを用いたRNA sequencingにより新規の転写変異体であることを同定した。そして現在、そのTK遺伝子のSCLC進展における機能解析を継続中である。

Research Products

• [Journal Article] Activation of insulin-like growth factor-1 receptor confers acquired resistance to osimertinib in non-small cell lung cancer with EGFR T790M mutation (2020)
  • Author(s): Hayakawa D, Takahashi F, Mitsuishi Y, Tajima K, Hidayat M, Winardi W, Ihara H, Kanamori K, Matsumoto N, Asao T, Ko R, Shukuya T, Takamochi K, Hayashi T, Suehara Y, Takeda Nakamura I, Ueno T, Kohsaka S, Mano H, Takahashi K.
  • Journal Title: Thoracic Cancer Volume: 11 Pages: 140-149
  • DOI: 10.1111/1759-7714.13255.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identification of novel CD74-NRG2α fusion from comprehensive profiling of lung adenocarcinoma in Japanese never or light smokers (2020)
  • Author(s): Kohsaka S, Hayashi T, Nagano M, Ueno T, Kojima S, Kawazu M, Shiraishi Y, Suehara Y, Takahashi F, Takahashi K, Suzuki K, Takamochi K, Mano H.
  • Journal Title: J Thorac Oncol Volume: 15 Pages: 948-961
  • DOI: 10.1016/j.jtho.2020.01.021.
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Clinicopathological characteristics of lung adenocarcinoma with compound EGFR mutations. (2020)
  • Author(s): Hayashi T, Kohsaka S, Takamochi K, Hara K, Kishikawa S, Sano K, Takahashi F, Suehara Y, Saito T, Takahashi K, Suzuki K, Yao T.
  • Journal Title: Human Pathology Volume: 14 Pages: 42-51
  • DOI: 10.1016/j.humpath.2020.07.007.
  • Peer Reviewed
• [Presentation] インスリン様成長因子1受容体の活性化はT790M遺伝子変異陽性NSCLCにおけるオシメルチニブ耐性に寄与する (2020)
  • Author(s): 早川乃介、髙橋史行、光石陽一郎、田島健、中村育子、松本直久、金森幸一郎、高遼、朝尾哲彦、宿谷威仁、嶋村尚子、和泉研太、Wira Winardi、白井由紀奈、虎澤匡洋、三浦啓太、藤岡雅大、高橋和久
  • Organizer: 第61回日本肺癌学会学術集会
• [Presentation] 進行EGFR遺伝子変異/ALK融合遺伝子陽性NSCLCにおける、治療開始後5年以降の経過の検討 (2020)
  • Author(s): 嶋村尚子，宿谷威仁，藤岡雅大，朝尾哲彦，白井由紀奈，三浦啓太, 和泉研太, 早川乃介，高遼，光石陽一郎，田島健，柴山里奈，嶋田奈緒子，髙橋史行，高橋和久
  • Organizer: 第61回日本肺癌学会学術集会
• [Presentation] 重複癌の既往と進行非小細胞肺癌に対する1次治療ペムブロリズマブの治療効果との関連の検討 (2020)
  • Author(s): 三浦啓太、宿谷威仁、朝尾哲彦、阿部瞳、白井由紀奈、和泉研太、早川乃介、松本直久、金森幸一郎、嶋村尚子、光石陽一郎、田島健、柴山里奈、嶋田奈緒子、高橋史行、高遼、高橋和久
  • Organizer: 第61回日本肺癌学会学術集会