2021 Fiscal Year Research-status Report
骨密度関連SNPs近隣由来のmiRNAsによる骨代謝制御の検討
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17K09870
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| Research Institution | Sagami Women's University |
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Principal Investigator |
嶋田 昌子 相模女子大学, 栄養科学部, 教授 (30637369)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
奥村 裕司 相模女子大学, 栄養科学部, 教授 (70294725)
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| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | 骨・カルシウム代謝 / SNPs / miRNA / 骨粗しょう症 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
超高齢化が進む日本の社会背景の中、高齢者特有の疾患、たとえば骨粗鬆症が臨床の現場で増加し、実生活で高齢者の生活の行動範囲を狭め、また介護する家族の負担も増やしてきている。したがって、こうした疾患の新規の病因や治療法を明らかにすることは、今後増大する社会的ニーズを考えると重要である。近年、ゲノムワイド関連解析(GWAS)は遺伝子と疾患の特性を関連付けてきた。しかし、マイクロ(mi)RNAなどの遺伝子コードに関与しないRNAがこの遺伝子と疾患の特性にどのように関与しているのかは未だよくわかっていない。本研究は、GWASデーターベースから得られた骨密度関連の一塩基多型の近隣に由来するmiRNAをゲノムワイドに同定し、これらの骨代謝、特に骨粗鬆症の病態に寄与するメカニズムを解明することを研究目的とする。
課題１.骨密度関連SNPsの近隣に由来し、骨密度を制御する標的遺伝子を持つ可能性が示唆された5種のmiRNAsの評価を行う、については、2018年前半に大規模の骨密度関連のGWASスタディーが追加されたことから、再度ヒトの骨密度関連のGWAS研究論文から385個の一塩基多型を抽出し、それぞれの一塩基多型が内在する136個の遺伝子と、一塩基多型の近隣に由来する37個のmiRNAsを同定した。それら37個のmiRNAsの標的遺伝子を各種データーベースにて検討し、骨粗鬆症関連標的遺伝子でかつ、疾患に関連して作用機序が論文報告されているもの5種を抽出し、今後の研究の優先順位を検討した。次いで、各種System Biological Databaseを用いて、抽出したSNPs、その内在遺伝子、タンパク質の進化、機能性特徴について網羅的解析を行った。課題２については、実験室での研究が遅延していることから、GWAS meta-analysisによる網羅的解析方法のシステム構築の準備も検討した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
4: Progress in research has been delayed.
Reason
2019年度までは、研究協力者を新たに得て、骨密度関連のGWASスタディーを再検討し、2018年度までより、150以上多くのSNPs、SNP内在性遺伝子を追加することができた。さらに、これらの抽出した遺伝子の進化、機能的特徴をまとめるために一連のSystem Biological Databasesを用いた網羅的解析を追加して行った。しかし、2020年春以降の新型コロナウイルス感染症の蔓延に伴い、オンライン授業への切り替えに伴う教育関連の業務が増え、学生の研究協力も全く得ることができず、また、在宅勤務が主体となったことに伴い、課題２の実験室での取り組みが遅延している。
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| Strategy for Future Research Activity |
課題２の遅延を解消するように計画に則って実験に取り組む予定である。GWAS meta-analysisについての検討も継続して進めていく。
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| Causes of Carryover |
課題２の進捗状況が遅れているため、本年度までの残額から次年度使用額が生じている。今後は、これまでの研究成果のまとめ、および実験により研究費を有効に使用していく。
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Research Products
(1 results)
