Noncoding RNA FTX expression in colorectal cancer

2019 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 17K10646
• Research Institution: Iwate Medical University
• Principal Investigator: 秋山 有史 岩手医科大学, 医学部, 講師 (10405798)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 大腸癌 / noncoding RNA / FTX

Outline of Annual Research Achievements

大腸癌原発巣の組織部位別のFTX発現状況とその意義を検討するため、大腸癌原発巣3か所より組織を採取し、それぞれについて151遺伝子を標的としたPan-Cancer panelにより次世代sequencerを用いた変異解析、294のタンパクを標的とした逆相タンパクによる網羅的タンパク発現解析を行った。3か所で共通するFounder 変異に対し、1, 2か所のみで検出されるNon-founder変異は倍程度見られ、その変異アリル頻度はFounder変異のそれに比べ有意に低かった。変異情報にもとづく系統樹解析では、少数の原発巣部位および中等度の遺伝子パネルによる少数の変異情報でも、進化過程の初期に生じたtrunk mutationと後期に加わってきたと考えられるbranch mutationに分けられ、部位別の時間的情報も得られる可能性が考えられた。また対応するタンパク発現解析では、多くの症例で同一腫瘍内でも採取部位によりタンパク発現状況が異なることを示した。これらの腫瘍組織内の遺伝子変異およびタンパク発現のheterogeneityとFTX発現の比較を試みたが、通常のreal time PCRでは大腸癌症例のほとんどがFTX発現検出感度以下であり解析不能であったため、高感度技術であるdigital PCRを用いた解析を試みた。既存の解析で発現が検出されなかった症例でも、FTX発現陽性が確認され、また採取部位による発現差も比較可能であることを示した。大腸癌におけるFTX発現の意義をより正確に解明するためのシステムを構築した。これはnoncoding RNAのみでなく、微量発現の遺伝子やサンプル間での微量な差の検討など広く応用可能な手法である。

Research Products

• [Journal Article] Safety of thoracoscopic esophagectomy after induction chemotherapy for locally advanced unresectable esophageal squamous cell carcinoma (2020)
  • Author(s): Akiyama Yuji、Iwaya Takeshi、Endo Fumitaka、Nikai Haruka、Baba Shigeaki、Chiba Takehiro、Kimura Toshimoto、Takahara Takeshi、Otsuka Koki、Nitta Hiroyuki、Mizuno Masaru、Kimura Yusuke、Koeda Keisuke、Sasaki Akira
  • Journal Title: Asian Journal of Endoscopic Surgery Volume: 13 Pages: 152～159
  • DOI: 10.1111/ases.12731
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Frequent tumor burden monitoring of esophageal squamous cell carcinoma with circulating tumor DNA using individually designed digital PCR (2020)
  • Author(s): Iwaya Takeshi、Endo Fumitaka、Yaegashi Mizunori、Sasaki Noriyuki、Fujisawa Ryosuke、Hiraki Hayato、Akiyama Yuji、Sasaki Akira、Suzuki Yuji、Masuda Mari、Yamada Tesshi、Takahashi Fumiaki、Tokino Takashi、Sasaki Yasushi、Nishizuka Satoshi S
  • Journal Title: medRxiv Volume: NA Pages: NA
  • DOI: https://doi.org/10.1101/2020.05.01.20087106
• [Presentation] 当科におけるcT4b結腸癌に対する腹腔鏡下手術の検討(会議録) (2019)
  • Author(s): 木村 聡元, 大塚 幸喜, 松尾 鉄平, 藤井 仁志, 高清水 清治, 中村 侑哉, 八重樫 瑞典, 畑中 智貴, 長谷川 康, 高原 武志, 秋山 有史, 岩谷 岳, 新田 浩幸, 肥田 圭介, 佐々木 章
  • Organizer: 日本内視鏡外科学会
• [Presentation] 右半結腸切除D3リンパ節郭清の手術手技 進行右側結腸癌に対する安全なアプローチ法 進行右側結腸癌に対する腹腔鏡下結腸右半切除術における安全なアプローチ法 (2019)
  • Author(s): 松尾 鉄平, 大塚 幸喜, 木村 聡元, 藤井 仁志, 高清水 清治, 中村 侑哉, 茂木 はるか, 長谷川 康, 高原 武志, 秋山 有史, 岩谷 岳, 新田 浩幸, 肥田 圭介, 佐々木 章
  • Organizer: 日本内視鏡外科学会
• [Presentation] 消化管癌の新規バイオマーカーとしてのCirculating tumor DNAの有用性 (2019)
  • Author(s): 岩谷 岳, 遠藤 史隆, 八重樫 瑞典, 千葉 丈広, 佐々木 教之, 佐藤 慧, 秋山 有史, 佐々木 章, 西塚 哲
  • Organizer: 日本消化器外科学会総会
• [Presentation] Patient-specific circulating tumor DNA monitoring using esophageal squamous cell cancer gene panel and digital PCR. (2019)
  • Author(s): Iwaya T, Endo F, Sasaki Y, Sasaki N, Yaegashi M, Akiyama Y, Sasaki A, Masuda M, Yamada T, Tokino T, Nishizuka S.
  • Organizer: American Association for Cancer Research
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] The clinical utility of ctDNA in colorectal cancer validated by multiregional sequencing and protein analysis. (2019)
  • Author(s): Yaegashi M, Iwaya T, Fujita M, Zhenlin Ju, Doris Siwak, Sato K, Endo F, Sugimoto R, Sugai T, Lance Liotta, Yiling Lu, Gordon Mills, Nakagawa H, Nishizuka S.
  • Organizer: American Association for Cancer Research
  • Int'l Joint Research