2019 Fiscal Year Annual Research Report
Genetics of chronic rhinosinusitis and related phyenotypes
| Project/Area Number |
17K11371
|
|---|
| Research Institution | Jikei University School of Medicine |
|---|
Principal Investigator |
廣田 朝光 東京慈恵会医科大学, 医学部, 講師 (50435674)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2020-03-31
|
| Keywords | 慢性副鼻腔炎 / 遺伝子多型 / GWAS / 関連解析 / メタ解析 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
慢性副鼻腔炎は、その一部に、気管支喘息の合併や、難治性の好酸球性副鼻腔炎、NSAID 不耐症などの重篤な症状を呈することから、アレルギーの関与が示唆される。研究代表者は、独立の2集団を用いた関連解析により、慢性副鼻腔炎の病態に関連する6箇所のゲノム領域 (5q22.1, KIF3A/IL13; 2q12, IL1RL1/IL18R1/IL18RAP; MHC領域; 5q35, LTC4S; 9p24.1, IL33; 2p25.1, LINC00299)を同定した。関連を認めた6箇所のゲノム領域のうち、IL1RL1、IL18R1、IL18RAPなどの遺伝子を含む2q12のゲノム領域は、米国を中心としたGWASにおいて、慢性副鼻腔炎と密接に関わりのある鼻ポリープとの関連が報告されている。慢性副鼻腔炎と最も強い関連を示した2q12のゲノム領域のrs1420101は、気管支喘息、鼻ポリープなどのGWASの報告と同じリスクアレルの方向性を示した。in silicoの解析で、rs1420101及び、これと強い連鎖不平衡をもつ複数の遺伝子多型は、DNase I高感受性領域に含まれること、ヒストン修飾の情報からプロモーター、エンハンサーとしての機能が予測されること、IL1RL1、IL18R1の遺伝子発現量と相関を持つこと (eQTL: expression quantitative trait loci)、転写因子などのDNAへの結合能を変化させること、などが種々の細胞、臓器において示された。
また、慢性副鼻腔炎患者の血液を約100検体、新たに収集し、このうち、54検体についてゲノムDNAの抽出を行った。新たな候補遺伝子として、近年、欧米で報告された真菌のcolonizationに密接に関与する遺伝子のrare variantについて、日本人の慢性副鼻腔炎患者を用いて探索を行った。
|
-
[Journal Article] A genetic variant near TSLP is associated with chronic rhinosinusitis with nasal polyps and aspirin-exacerbated respiratory disease in Japanese populations2020
Author(s)
1.Nakayama T, Hirota T, Asaka D, Sakashita M, Ninomiya T, Morikawa T, Okano M, Haruna S, Yoshida N, Takeno S, Tanaka Y, Yoshikawa M, Ishitoya J, Hizawa N, Isogai S, Mitsui C, Taniguchi M, Kojima H, Fujieda S, Tamari M.
-
Journal Title
Allergology International
Volume: 69
Pages: 138-140
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
[Journal Article] A cis-eQTL allele regulating reduced expression of CHI3L1 is associated with late-onset adult asthma in Japanese cohorts2019
Author(s)
Kanazawa J, Kitazawa H, Masuko H, Yatagai Y, Sakamoto T, Kaneko Y, Iijima H, Naito T, Saito T, Noguchi E, Konno S, Nishimura M, Hirota T, Tamari M, Hizawa N
-
Journal Title
BMC Medical Genetics
Volume: 20
Pages: 58
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
