Identification of bioactive peptides producing by A. actinomycetemcomitans

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 17K11618
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Research Field: Morphological basic dentistry
• Research Institution: Kagoshima University
• Principal Investigator: Oogai Yuichi 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 助教 (40511259)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 松尾 美樹 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 准教授 (20527048) ; 小松澤 均 鹿児島大学, 医歯学域歯学系, 教授 (90253088)
• Project Period (FY): 2017-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: 歯周病原因菌 / 生理活性ペプチド

Outline of Final Research Achievements

Aggregatibacter actinomycetemcomitans (Aa) is a periodontal pathogen. To identify new small ORF and small RNA in Aa, we performed a systematic search using RNAseq and identified 18 sORF and 120 sRNA. None of the sORFs exhibited the homology with known bioactive-peptides. The cytotoxicity and antimicrobial activity of the fractions extracted from supernatants of Aa strains containing clinically isolates were not detected. The target prediction of sRNAs showed the potential to regulate several virulence genes containing leukotoxin and cytolethal distending toxin.

Free Research Field

細菌学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

過去に行われたsORF解析の多くはバイオインフォマティクス手法によるものである。本研究はsORFの同定を次世代シークエンサーを用いたRNA-seq解析によって行うことにおいて学術的な意義をも有する。また、Aaにおいて、sRNAの同定は一部なされているが、多くの菌株においては不明である。遺伝子発現制御を担う因子として注目されているsRNAの解析は、Aaの病原性への理解においても有意義な情報となると考えられる。