2017 Fiscal Year Research-status Report
遺伝環境交互作用を考慮した新規頭頸部がん予後予測モデルの構築
| Project/Area Number |
17K18006
|
|---|
| Research Institution | Nagoya City University |
|---|
Principal Investigator |
川北 大介 名古屋市立大学, 大学院医学研究科, 助教 (70584506)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2017-04-01 – 2019-03-31
|
| Keywords | 頭頸部がん / HPV / DNA修復酵素 / 遺伝環境交互作用 / 予後 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、臨床的予後因子に生活習慣・遺伝子情報を加えることで個別化頭頸部がん予後予測モデルを構築することを目的としている。
具体的な目的は、1)喫煙との交互作用が知られているDNA修復酵素遺伝子多型の頭頸部がん予後への影響を検討する、2)中咽頭がん症例の血清抗体を用いて、ヒト乳頭腫ウイルス抗体価をELISA法で測定し予後予測への有効性について検討することである。
研究計画の進め方は以下の内容である。①愛知県がんセンター病院疫学研究の枠組みの中で作成した頭頸部がん患者コホート437症例のうち血液サンプルのある267例よりゲノムDNAを抽出する、②DNA修復酵素のうちヌクレオチド除去修復酵素の遺伝子多型をTaqman法で調べる、③中咽頭がん症例の血清検体よりHPV抗体価をELISA法を用いて測定する、④中咽頭がん症例のHPV感染の有無について、パラフィン包埋検体に対してp16を用いた免疫組織化学的検討を行い、その結果とHPV抗体価の相関関係について検証を行うことである。
本年度の研究計画では、a)頭頸部がん患者DNAの抽出、b)ヌクレオチド除去修復酵素の候補遺伝子多型の選定、c)Taqman法を用いた遺伝子多型の同定、d)血清検体を用いたHPV抗体価の測定を研究目標に挙げていた。
まず本年度に行った重要な点として、愛知県がんセンター病院疫学研究における頭頸部がん患者コホートの拡充が挙げられる。疫学研究においてコホートの拡充は研究結果の妥当性を高めることになり優先すべきであると考えた。そのため従来の437症例に662症を追加することができ、1099症例の頭頸部がん患者コホートを作成することができた。遺伝子研究に同意のある中咽頭がん症例も当初の47例に59例を追加でき106症例となった。そのため当初の研究計画にあったDNA修復酵素遺伝子多型の同定、血清検体を用いたHPV抗体価の測定は次年度に引き続き行うこととなった。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
本年度は従来の目標には挙げていなかったが、疫学研究において重要であると考えられる、頭頸部がん患者コホートの拡充に研究を費やすこととなった。そのため当初の研究計画にあったDNA修復酵素遺伝子多型の同定、血清検体を用いたHPV抗体価の測定は次年度に引き続き行うことになり研究計画は遅れていると判断した。
|
| Strategy for Future Research Activity |
今年度は引き続いてヌクレオチド修復酵素遺伝子多型の同定、血清検体を用いたHPV抗体価の測定を行っていく。また当初の研究計画に予定していた中咽頭がん症例のホルマリン固定パラフィン包埋祖組織検体を用いたp16の免疫組織学的検討、それらの研究結果と生活習慣をふまえた生存解析を行っていく。頭頸部がん患者コホートにおける生活習慣や臨床情報については集積をすでに行っており、研究計画の推進につながるものと考えている。
|
| Causes of Carryover |
本年度研究目標で予定していたヌクレオチド修復酵素遺伝子多型の同定や中咽頭がん症例における血清検体を用いたHPV抗体価の測定が次年度に行うこととなったために次年度使用額が生じた。次年度に上記研究目標を行い使用する予定である。
|
-
[Journal Article] Mutation analysis of the EGFR pathway genes, EGFR, RAS, PIK3CA, BRAF, and AKT1, in salivary gland adenoid cystic carcinoma.2018
Author(s)
Saida K, Murase T, Ito M, Fujii K, Takino H, Masaki A, Kawakita D, Ijichi K, Tada Y, Kusafuka K, Iida Y, Onitsuka T, Yatabe Y, Hanai N, Hasegawa Y, Shinomiya H, Nibu KI, Shimozato K, Inagaki H.
-
Journal Title
Ｏｎｃｏｔａｒｇｅｔ
Volume: 9(24)
Pages: 17043-17055
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] Prognostic and histogenetic roles of gene alteration and the expression of key potentially actionable targets in salivary duct carcinomas.2017
Author(s)
Shimura T, Tada Y, Hirai H, Kawakita D, Kano S, Tsukahara K, Shimizu A, Takase S, Imanishi Y, Ozawa H, Okami K, Sato Y, Sato Y, Fushimi C, Takahashi H, Okada T, Sato H, Otsuka K, Watanabe Y, Sakai A, Ebisumoto K, Togashi T, Ueki Y, Ota H, Ando M, Kohsaka S, Hanazawa T, Chazono H, Kadokura Y, Kobayashi H, Nagao T.
-
Journal Title
Oncotarget
Volume: 9(2)
Pages: 1852-1867
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
[Journal Article] Impact of oral hygiene on head and neck cancer risk in a Chinese population.2017
Author(s)
Kawakita D, Lee YA, Li Q, Chen Y, Chen CJ, Hsu WL, Lou PJ, Zhu C, Pan J, Shen H, Ma H, Cai L, He B, Wang Y, Zhou X, Ji Q, Zhou B, Wu W, Ma J, Boffetta P, Zhang ZF, Dai M, Hashibe M.
-
Journal Title
Head and Neck
Volume: 39(12)
Pages: 2549-2557
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
-
[Journal Article] Biomarker immunoprofile in salivary duct carcinomas: clinicopathological and prognostic implications with evaluation of the revised classification.2017
Author(s)
Takase S, Kano S, Tada Y, Kawakita D, Shimura T, Hirai H, Tsukahara K, Shimizu A, Imanishi Y, Ozawa H, Okami K, Sato Y, Sato Y, Fushimi C, Okada T, Sato H, Otsuka K, Watanabe Y, Sakai A, Ebisumoto K, Togashi T, Ueki Y, Ota H, Hanazawa T, Chazono H, Osamura RY, Nagao T.
-
Journal Title
Oncotarget
Volume: 8(35)
Pages: 59023-59035
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
[Journal Article] Dietary fiber intake and head and neck cancer risk: A pooled analysis in the International Head and Neck Cancer Epidemiology consortium.2017
Author(s)
Kawakita D, Lee YA, Turati F, Parpinel M, Decarli A, Serraino D, Matsuo K, Olshan AF, Zevallos JP, Winn DM, Moysich K, Zhang ZF, Morgenstern H, Levi F, Kelsey K, McClean M, Bosetti C, Garavello W, Schantz S, Yu GP, Boffetta P, Chuang SC, Hashibe M, Ferraroni M, La Vecchia C, Edefonti V.
-
Journal Title
International Journal of Cancer
Volume: 141(9)
Pages: 1811-1821
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
-
-
-
-
-
-
-
-
