2018 Fiscal Year Annual Research Report
Development of detection schemes for endangered and invasive animals based on pan-animalia enviromental DNA analysis
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17K19298
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| Research Institution | University of the Ryukyus |
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Principal Investigator |
佐藤 行人 琉球大学, 戦略的研究プロジェクトセンター, 特命講師 (20566418)
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| Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2019-03-31
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| Keywords | 環境DNA / 大量DNA分析 / 次世代シークエンサー / バイオインフォマティクス / 希少種 / 外来種 / メタバーコーディング |
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| Outline of Annual Research Achievements |
海・川・湖沼などの環境水に懸濁している動物由来のDNAを分析することで、希少種や外来種を含む脊椎動物（魚類・四足類）の存在を高感度で検出する環境DNA分析の研究開発を進めた。前年度に続いて、沖縄県をモデルとした動物の環境DNA分析を進めた結果、すでに検出に成功していた県内の希少動物（ヤンバルクイナ、ホルストガエル、メダカなど）に加えて、新たにタイワンキンギョ（在来トウギョ）、カラスバト、ケナガネズミ、タウナギ、ドジョウを検出することが出来た。また、外来種ミシシッピアカミミガメ、コウタイ、プラティ、マングースも検出することが出来た。以上から、研究代表者らが開発してきた次世代シークエンサーとメタバーコーディング技術による環境DNA分析によって、脊椎動物全般（魚類、両生類、爬虫類、鳥類、哺乳類）の希少種・外来種を検出・評価することの実現可能性が支持されたと考える。さらに、人獣共通感染症の病原細菌であるレプトスピラについて、河川水の環境DNから分析し、その宿主候補となる動物（イノシシ、オオコウモリなど）の検出と相関解析を行った。この成果を論文として出版することが出来た（Sato Y, Mizuyama M, Sato M, Minamoto T, Kimura R, and Toma C. 2019. Environmental DNA metabarcoding to detect pathogenic Leptospira and associated organisms in leptospirosis-endemic areas of Japan. Scientific Reports, 9, 6575）。以上から、本研究で掲げた動物全般の環境DNA検出と生態疫学への応用という目的について、技術面と成果面の両方で、予定していた内容のうちかなりの部分を達成できたと考える。
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Research Products
(7 results)
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[Presentation] Preliminary study on eDNA of the coelacanth's habitat around deep sea conservation areas of North Sulawesi, Indonesia2018
Author(s)
Kawilarang W.A. Masengi, I.F. Mandagi, H. Manengkey, P.N.I. Kalangi, A. Luasunaung, F.P.T. Pangalila, M. Iwata, Y. Abe, Y. Sato, R. Kimura, K. Yamahira
Organizer
第10回世界水族館会議
Invited
