2018 Fiscal Year Annual Research Report
Exploring active transposable elements by chromosome addition lines
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17K19361
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| Research Institution | Kyoto Sangyo University |
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Principal Investigator |
河邊 昭 京都産業大学, 総合生命科学部, 准教授 (10582405)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
那須田 周平 京都大学, 農学研究科, 准教授 (10273492)
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| Project Period (FY) |
2017-06-30 – 2019-03-31
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| Keywords | トランスポゾン / 染色体添加系統 / オオムギ / コムギ |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、染色体添加系統を用いて転移活性能のあるトランスポゾン（転移因子）の効率的な単離を目指している。オオムギの染色体を１対持つコムギ系統（染色体添加系統）を用い、添加染色体存在下でトランスポゾンを活性化させ、その後添加染色体を交配によって除去することでホストのゲノムへ転移したトランスポゾンを同定し、単離することを試みる。本年度はオオムギ染色体添加コムギを野生型のコムギ系統に戻し交配をした１染色体添加系統の自殖による添加染色体を失った系統の作成をおこない、PCRとGISH法によりオオムギ染色体を持たない系統を複数個体選抜した。そのようなもともとオオムギ染色体を持っていたが今はコムギ染色体だけを持つ系統に関して薬剤処理によってDNAメチル化を低下させたのちRNAシークンエンスをおこなうことで転写産物の網羅的な解析をおこなった。転写産物の中にはコムギゲノムには存在しないがオオムギゲノムと相同な配列が複数存在した。この結果はオオムギ添加染色体由来のゲノム領域がコムギゲノムに存在することを示唆している。現在そのような配列が染色体構造異常によるものか、トランスポゾンの転移によるものかの確認作業をおこなっている。本研究の目的であった添加染色体を利用したトランスポゾンの転移を一部検出できたと考えることができ、同じような系を利用することで転移活性のあるトランスポゾンの単離とその機能解析を進めることができることが可能であることを示すことができた。
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