2018 Fiscal Year Annual Research Report
HLA-omics-based pharmacogenomics for adverse drug reactions in genome cohort studies
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17K19804
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
細道 一善 金沢大学, 医学系, 准教授 (50420948)
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2017-06-30 – 2019-03-31
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| Keywords | HLA / 薬剤副作用 / コホート研究 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
主要組織適合遺伝子複合体 (Human leukocyte antigen; HLA)は免疫応答の入り口として自己と非自己を認識する分子であり、コードする遺伝子はヒトゲノムの中でも極めて高度な多様性を有することが知られている。さらにHLA遺伝子はその多型と薬剤副作用リスクとの強い関連から、個人のゲノム情報の中でも予防医学上重要な課題の一つである。本研究はHLA遺伝子の多型情報からHLA関連薬剤副作用を予測し、予防診断システムを構築することを最終的なゴールとして進めた。実施には、申請者の所属する金沢大学で進めている能登地域を対象にした1万人規模のゲノムコホートのサンプルの一部を用いた。2012年より始動したこのコホート研究は連携病院の電子カルテ情報を含み、薬剤副作用の情報を含むデータベースが稼働している。これら大規模ゲノムコホートのDNAサンプルを用いて、申請者がこれまでに開発してきたNGSを用いたHLA遺伝子の解析手法(Hirata et al. Nature Genetics 2019, Hosomichi et al. BMC Genomics 2014, Hosomichi et al.BMC Genomics 2013)を用いることによって、33のHLA遺伝子ならびに非HLA遺伝子(HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DMA、HLA-DMB、HLA-DOA、HLA-DOB、HLA-DPA1、HLA-DPB1、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DRA、HLA-DRB1、HLA-DRB2、HLA-DRB3、HLA-DRB4、HLA-DRB5、HLA-DRB6、HLA-DRB7、HLA-DRB8、HLA-DRB9、HLA-E、HLA-F、HLA-G、HLA-H、HLA-J、HLA-K、HLA-L、HLA-V、MICA、MICB、TAP1およびTAP2)の遺伝子の完全長配列を1187検体について決定した。
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[Journal Article] Genetic and phenotypic landscape of the major histocompatibilty complex region in the Japanese population.2019
Author(s)
Hirata Jun, Hosomichi Kazuyoshi, Sakaue Saori, Kanai Masahiro, Nakaoka Hirofumi, Ishigaki Kazuyoshi, Suzuki Ken, Akiyama Masato, Kishikawa Toshihiro, Ogawa Kotaro, Masuda Tatsuo, Yamamoto Kenichi, Hirata Makoto, Matsuda Koichi, Momozawa Yukihide, Inoue Ituro, Kubo Michiaki, Kamatani Yoichiro, Okada Yukinori
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Journal Title
Nature genetics
Volume: 51
Pages: 470-480
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Aire Controls in Trans the Production of Medullary Thymic Epithelial Cells Expressing Ly-6C/Ly-6G.2018
Author(s)
Morimoto Junko, Nishikawa Yumiko, Kakimoto Takumi, Furutani Kohei, Kihara Naoki, Matsumoto Minoru, Tsuneyama Koichi, Kozono Yuko, Kozono Haruo, Hozumi Katsuto, Hosomichi Kazuyoshi, Nishijima Hitoshi, Matsumoto Mitsuru
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Journal Title
Journal of immunology
Volume: 201
Pages: 3244-3257
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Oligogenic familial hypercholesterolemia, LDL cholesterol, and coronary artery disease.2018
Author(s)
Tada Hayato, Kawashiri Masa-aki, Nomura Akihiro, Teramoto Ryota, Hosomichi Kazuyoshi, Nohara Atsushi, Inazu Akihiro, Mabuchi Hiroshi, Tajima Atsushi, Yamagishi Masakazu
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Journal Title
Journal of clinical lipidology
Volume: 12
Pages: 1436-1444
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] 尿酸トランスポーター遺伝子ABCG2のレアバリアントはコモンバリアントと同様に痛風を引きおこす2018
Author(s)
松尾 洋孝, 東野 俊英, 高田 龍平, 中岡 博史, 豊田 優, 清水 聖子, 川口 真, 中山 昌喜, 青柳 有香, 中嶌 真由子, 河村 優輔, 中村 好宏, 若井 建志, 岡田 理恵子, 山本 健, 細道 一善, 市田 公美, 大山 博司, 井ノ上 逸朗, 四ノ宮 成祥
Organizer
日本人類遺伝学会第63回大会
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[Presentation] 北海道船泊遺跡の高深度縄文人ゲノムから2018
Author(s)
神澤 秀明, ティモシー ジナム, 河合 洋介, 佐藤 丈寛, 細道 一善, 田嶋 敦, 安達 登, 松村 博文, キリル クリュコフ, 斎藤 成也, 篠田 謙一
Organizer
日本人類遺伝学会第63回大会
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[Presentation] Loss-of-Function Mutations in HLA-Class I Alleles in Acquire Aplastic Anemia: Evidence for the Involvement of Limited Class I Alleles in the Auto-Antigen Presentation of Aplastic Anemia2018
Author(s)
Hiroki Mizumaki, Kazuyoshi Hosomichi, Tanabe Mikoto, Takeshi Yoroidaka, Tatsuya Imi, Yoshitaka Zaimoku, Kohei Hosokawa, Takamasa Katagiri, Hiroyuki Takamatsu, Tatsuhiko Ozawa, Fumihiro Azuma, Hiroyuki Kishi, Atsushi Tajima, Shinji Nakao
Organizer
第60回米国血液学会ASH
Int'l Joint Research
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