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2018 Fiscal Year Research-status Report

テルペン環化酵素の遷移状態制御機構の解明とその機能改変

Research Project

Project/Area Number 17KT0095
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

淡川 孝義  東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 講師 (80609834)

Project Period (FY) 2017-07-18 – 2020-03-31
Keywords遷移状態 / テルペン / 二次代謝 / ゲノムマイニング
Outline of Annual Research Achievements

テルペン化合物は多くの医薬品資源を含む。その構造は主にC-Hからなるため、有機合成での調製は通常困難である。生合成酵素を用いて、有用テルペノイド骨格を合成するためには、その鍵反応であるテルペン環化反応への理解が必要不可欠である。一方、テルペン環化反応中の遷移状態のカチオン中間体の解析は困難であり、これまでその反応制御は困難であった。本研究では、新たなテルペン環化酵素の発掘を目指して、ゲノムマイニングによりPenicilliumに広く保存されるテルペン環化酵素PcCSを見出し、それをAspergillus oryzaeにて異種発現することで、その生成物を取得した。生成物の平面構造を各種NMRで決定し、絶対立体配置を結晶スポンジ法にて決定した。その結果、11-5員環カチオン、9-5-5員環カチオン遷移状態を経て6-5-5-5員環型の生成物を与える新規酵素であると判明した(Mitsuhashi et al. Org. Lett. 20, 5606-5609 (2018))。また、多様な生理活性を持ち、医薬品シードとして有望な糸状菌由来メロテルペノイドascofuranone、ascochlorinの環化酵素の解析を行い、6-endo-tet環化反応を触媒するAscF、5-endo-tet環化反応を触媒し、tetrahydrofuran構造を形成するAscIを見出した(Araki, Y. & Awakawa, T. et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2019, in press, Quan, Z. & Awakawa, T. Org. Lett., 2019, 21, 2330-2334.)。また、AscF基質を他の環化酵素Pyr4に作用させ、異なる環化パターンの生成物を与えることを明らかにした。これら酵素の基質特異性、反応性には興味が保たれる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

テルペン環化制御機構の解明とその利用のためには新規触媒の発掘とその反応への理解が重要となる。微生物ゲノムには多数のテルペン環化酵素が存在し、これらは宝の山といえる。本年は、微生物由来テルペン環化触媒の発掘を行い、C25のセスタテルペン環化酵素であるPcCS、メロテルペノイド環化酵素AscI, AscFの反応解析を行った。その結果、PcCSの6-5-5-5員環型生成反応、AscFの6-endo-tet環化反応、AcsIの5-endo-tet環化反応を明らかにした。9-5-5員環カチオンから異なる環化反応を触媒する酵素がEvVS, PaPSと二種知られており、PcCSは異なる遷移状態制御機構が存在すると考えられ、興味がもたれる。AscIはこれまでの環化酵素とは相同性をもたない新規な環化酵素であり、その構造機能相関によってテルペン環化制御への新規な知見が得られる。AscF、Pyr4は同一の基質から異なる環化パターンを触媒する酵素であることを明らかにし、メロテルペン環化反応における新規な知見を取得し、物質生産への可能性を示した。遷移状態の理解と制御のために、様々なテルペン環化反応への理解と生体触媒の機能への理解を深めることは重要であり、本年は遷移状態制御に向けた土台を構築することができたたため、おおむね順調に進行したと判断した。

Strategy for Future Research Activity

EvVS, PaPS, PcCSの配列比較、中間体構造のドッキングにより、それぞれどのアミノ酸によって反応制御されるか明らかにする。見出したアミノ酸に対して相互にアミノ酸変異を加え、それぞれの制御機構に対して知見を得る。変異酵素はAspergillus oryzaeにて異種発現を行い、新規な生成物が得られるか試験する。また、セスタテルペン環化酵素EvQSとドッキングシミュレーションの結果に従い、カチオンの安定化に関わると予想されるF92、Y192にそれぞれアミノ酸変異を加え、それら酵素の異種発現によって生成物を解析する。Ascochlorin生合成とピリピロペン環化酵素Pyr4をA. oryzaeにて共発現することで、人口生合成経路を構築し、新規物質生産系を構築する。テルペン環化酵素とその変異体、非天然型基質を用いることで、テルペン環化反応の制御と物質生産への応用を試み、新規物質生産系を構築する。

  • Research Products

    (25 results)

All 2019 2018 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (14 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 14 results,  Open Access: 3 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ピッツバーグ大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ピッツバーグ大学
  • [Int'l Joint Research] Jinan大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Jinan大学
  • [Int'l Joint Research] 上海有機化学研究所(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      上海有機化学研究所
  • [Journal Article] Complete biosynthetic pathways of ascofuranone and ascochlorin in Acremonium egyptiacum2019

    • Author(s)
      Araki Yasuko、Awakawa Takayoshi、Matsuzaki Motomichi、Cho Rihe、Matsuda Yudai、Hoshino Shotaro、Shinohara Yasutomo、Yamamoto Masaichi、Kido Yasutoshi、Inaoka Daniel Ken、Nagamune Kisaburo、Ito Kotaro、Abe Ikuro、Kita Kiyoshi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 116 Pages: 8269~8274

    • DOI

      10.1073/pnas.1819254116

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Multidomain P450 Epoxidase and a Terpene Cyclase from the Ascochlorin Biosynthetic Pathway in Fusarium sp.2019

    • Author(s)
      Quan Zhiyang、Awakawa Takayoshi、Wang Dongmei、Hu Yue、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 21 Pages: 2330~2334

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.9b00616

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aminoacyl sulfonamide assembly in SB-203208 biosynthesis2019

    • Author(s)
      Hu Zhijuan、Awakawa Takayoshi、Ma Zhongjun、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 10 Pages: 184

    • DOI

      10.1038/s41467-018-08093-x

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Involvement of β‐Alkylation Machinery and Two Sets of Ketosynthase‐Chain‐Length Factors in the Biosynthesis of Fogacin Polyketides in Actinoplanes missouriensis2019

    • Author(s)
      Sato Kei、Katsuyama Yohei、Yokota Kousuke、Awakawa Takayoshi、Tezuka Takeaki、Ohnishi Yasuo
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 20 Pages: 1039~1050

    • DOI

      10.1002/cbic.201800640

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total Enzyme Syntheses of Napyradiomycins A1 and B12018

    • Author(s)
      McKinnie Shaun M. K.、Miles Zachary D.、Jordan Peter A.、Awakawa Takayoshi、Pepper Henry P.、Murray Lauren A. M.、George Jonathan H.、Moore Bradley S.
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 140 Pages: 17840~17845

    • DOI

      10.1021/jacs.8b10134

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Elucidation and Heterologous Reconstitution of Chrodrimanin B Biosynthesis2018

    • Author(s)
      Bai Tongxuan、Quan Zhiyang、Zhai Rui、Awakawa Takayoshi、Matsuda Yudai、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 20 Pages: 7504~7508

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.8b03268

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Crystalline Sponge Method Enabled the Investigation of a Prenyltransferase-terpene Synthase Chimeric Enzyme, Whose Product Exhibits Broadened NMR Signals2018

    • Author(s)
      Mitsuhashi Takaaki、Kikuchi Takashi、Hoshino Shotaro、Ozeki Masahiro、Awakawa Takayoshi、Shi She-Po、Fujita Makoto、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Organic Letters

      Volume: 20 Pages: 5606~5609

    • DOI

      10.1021/acs.orglett.8b02284

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reprogramming of the antimycin NRPS-PKS assembly lines inspired by gene evolution2018

    • Author(s)
      Awakawa Takayoshi、Fujioka Takuma、Zhang Lihan、Hoshino Shotaro、Hu Zhijuan、Hashimoto Junko、Kozone Ikuko、Ikeda Haruo、Shin-Ya Kazuo、Liu Wen、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Pages: 3534

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05877-z

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Catenulobactins A and B, Heterocyclic Peptides from Culturing Catenuloplanes sp. with a Mycolic Acid-Containing Bacterium2018

    • Author(s)
      Hoshino Shotaro、Ozeki Masahiro、Awakawa Takayoshi、Morita Hiroyuki、Onaka Hiroyasu、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Journal of Natural Products

      Volume: 81 Pages: 2106~2110

    • DOI

      10.1021/acs.jnatprod.8b00261

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mirilactams C-E, Novel Polycyclic Macrolactams Isolated from Combined-Culture of Actinosynnema mirum NBRC 14064 and Mycolic Acid-Containing Bacterium2018

    • Author(s)
      Hoshino Shotaro、Ozeki Masahiro、Wong Chin Piow、Zhang Huiping、Hayashi Fumiaki、Awakawa Takayoshi、Morita Hiroyuki、Onaka Hiroyasu、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Chemical and Pharmaceutical Bulletin

      Volume: 66 Pages: 660~667

    • DOI

      10.1248/cpb.c18-00143

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthesis of the teleocidin-type terpenoid indole alkaloids2018

    • Author(s)
      Awakawa Takayoshi、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 16 Pages: 4746~4752

    • DOI

      10.1039/c8ob00803e

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biosynthetic pathway for furanosteroid demethoxyviridin and identification of an unusual pregnane side-chain cleavage2018

    • Author(s)
      Wang Gao-Qian、Chen Guo-Dong、Qin Sheng-Ying、Hu Dan、Awakawa Takayoshi、Li Shao-Yang、Lv Jian-Ming、Wang Chuan-Xi、Yao Xin-Sheng、Abe Ikuro、Gao Hao
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Pages: 1838

    • DOI

      10.1038/s41467-018-04298-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Molecular Insight into the Mg2+-Dependent Allosteric Control of Indole Prenylation by Aromatic Prenyltransferase AmbP12018

    • Author(s)
      Awakawa Takayoshi、Mori Takahiro、Nakashima Yu、Zhai Rui、Wong Chin Piow、Hillwig Matthew L.、Liu Xinyu、Abe Ikuro
    • Journal Title

      Angewandte Chemie International Edition

      Volume: 57 Pages: 6810~6813

    • DOI

      10.1002/anie.201800855

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Umezawamides, new bioactive polycyclic tetramate macrolactams isolated from a combined-culture of Umezawaea sp. and mycolic acid-containing bacterium2018

    • Author(s)
      Hoshino Shotaro、Wong Chin Piow、Ozeki Masahiro、Zhang Huiping、Hayashi Fumiaki、Awakawa Takayoshi、Asamizu Shumpei、Onaka Hiroyasu、Abe Ikuro
    • Journal Title

      The Journal of Antibiotics

      Volume: 71 Pages: 653~657

    • DOI

      10.1038/s41429-018-0040-4

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Reprogramming of the antimycin NRPS-PKS assembly lines inspired by gene evolution2019

    • Author(s)
      Takayoshi Awakawa
    • Organizer
      2nd China-Japanese Joint Symposium on the Biosynthesis of Natural Products
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] S-N結合形成に関わる新規多段階型酸化酵素の同定2019

    • Author(s)
      淡川孝義, 胡志娟, 阿部郁朗
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
  • [Presentation] 微生物からの新規医薬品骨格生合成酵素の発掘と利用2019

    • Author(s)
      淡川孝義
    • Organizer
      日本薬学会第139年会
    • Invited
  • [Presentation] 放線菌由来スルホンアミド含有アルカロイドの生合成研究2018

    • Author(s)
      淡川孝義、胡志娟、阿部郁朗
    • Organizer
      第33回日本放線菌学会
  • [Presentation] NRPS-PKSモジュール酵素リプログラミング による新規デプシペプチド生産2018

    • Author(s)
      淡川孝義、藤岡拓真、張驪駻、星野翔太郎、胡志娟、橋本絢子、小曽根郁子、池田治生、新家一男、劉文、阿部郁朗
    • Organizer
      第60回天然有機化合物討論会
  • [Presentation] NRPS-PKSモジュール酵素リプログラミング による新規デプシペプチド生産2018

    • Author(s)
      淡川孝義、藤岡拓真、張驪駻、星野翔太郎、胡志娟、橋本絢子、小曽根郁子、池田治生、新家一男、劉文、阿部郁朗
    • Organizer
      第22回 天然薬物の開発と応用シンポジウム
  • [Presentation] 微生物アルカロイド生合成経路の開拓と物質生産への応用2018

    • Author(s)
      淡川孝義
    • Organizer
      高磁場・高感度NMR利活用促進のための天然物分野シンポジウム2018
    • Invited
  • [Remarks] 東京大学大学院薬学系研究科天然物化学教室ホームページ

    • URL

      http://www.f.u-tokyo.ac.jp/~tennen/head.htm

URL: 

Published: 2019-12-27  

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