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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Illuminating new biological mechanisms by multiomics approach with mass spectrometry cheminformatics

Research Project

Project/Area Number 18H02432
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

津川 裕司  東京農工大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (30647235)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中林 亮  国立研究開発法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 研究員 (30586160)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywords統合オミクス / メタボロミクス / リピドミクス / 質量分析 / インフォマティクス
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、新規代謝産物の同定を含むノンターゲットメタボローム解析を基軸とした統合オミクス研究を行う。今年度は、マウスの老化に着目して研究を行った。具体的には、2か月齢から2年齢にかけて脂質メタボローム解析を行った。これにより、臓器特異的な脂質変化(リン脂質の加齢に伴う減少やトリアシルグリセロールの増加など)を捉えることに成功したことに加え、その一部は腸内細菌の有無や雌雄差に影響されることが分かった。本研究で着目した臓器の中では、腎臓に最も明確な差異を認めたことから、腎臓における統合オミクス解析を行った。これにより、加齢依存的な糖脂質の変動が、特定の遺伝子によって制御されている可能性が明らかとなった。現在、この研究の論文化を行っているところである。また、本年度にはまとめきることができなかったが、生薬がヒト細胞にもたらす作用メカニズムを解明するため、トランスクリプトーム、プロテオーム、そしてメタボローム解析データの統合解析を行っており、近い将来論文としてまとめる予定である。また、今年度は本科研費課題の最終年度であることから、これまでの研究の総説執筆を行った(Natural Product Reports 38, 1729-1759, 2021)。これは、植物科学におけるノンターゲットメタボロミクスやその統合解析の最新技術をレビューしたものである。特に、代表者の研究の中核を成す質量分析インフォマティクス(英語ではcomputational mass spectrometry)について、詳細に記載した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2021 Other

All Journal Article (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Global profiling of gut microbiota-associated lipid metabolites in antibiotic-treated mice by LC-MS/MS-based analyses2021

    • Author(s)
      Okahashi Nobuyuki、Ueda Masahiro、Yasuda Shu、Tsugawa Hiroshi、Arita Makoto
    • Journal Title

      STAR Protocols

      Volume: 2 Pages: 100492~100492

    • DOI

      10.1016/j.xpro.2021.100492

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Stage-Specific De Novo Synthesis of Very-Long-Chain Dihydroceramides Confers Dormancy to Entamoeba Parasites2021

    • Author(s)
      Mi-ichi Fumika、Ikeda Kazutaka、Tsugawa Hiroshi、Deloer Sharmina、Yoshida Hiroki、Arita Makoto
    • Journal Title

      mSphere

      Volume: 6 Pages: e00174-21

    • DOI

      10.1128/mSphere.00174-21

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Food Lipidomics for 155 Agricultural Plant Products2021

    • Author(s)
      Matsuzawa Yuki、Higashi Yasuhiro、Takano Kouji、Takahashi Mikiko、Yamada Yutaka、Okazaki Yozo、Nakabayashi Ryo、Saito Kazuki、Tsugawa Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Agricultural and Food Chemistry

      Volume: 69 Pages: 8981~8990

    • DOI

      10.1021/acs.jafc.0c07356

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Metabolomics and complementary techniques to investigate the plant phytochemical cosmos2021

    • Author(s)
      Tsugawa Hiroshi、Rai Amit、Saito Kazuki、Nakabayashi Ryo
    • Journal Title

      Natural Product Reports

      Volume: 38 Pages: 1729~1759

    • DOI

      10.1039/D1NP00014D

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Remarks] RIKEN PRIMe

    • URL

      http://prime.psc.riken.jp/

URL: 

Published: 2022-12-28  

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