• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2019 Fiscal Year Annual Research Report

Analysis of nucleolus-mitochondria network regulated by epigenetic factors

Research Project

Project/Area Number 18H02618
Research InstitutionKumamoto University

Principal Investigator

中尾 光善  熊本大学, 発生医学研究所, 教授 (00217663)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywordsエピゲノム / 核小体 / ミトコンドリア / 遺伝子 / クロマチン / 代謝
Outline of Annual Research Achievements

細胞のエネルギー代謝恒常性には、多様な環境下におけるエネルギーの合成と消費のバランスが重要である。その大半は、細胞質側のミトコンドリアでATPが合成され、核側の核小体によるリボソーム形成とタンパク質合成でATPが消費されている。このバランスを制御する機序については不明な点が多いが、これらに関わる遺伝子発現がエピゲノムによって協調的に調節されている可能性がある。本研究では、核小体とミトコンドリアの連動性に着目し、新規のエピゲノム制御機構を明らかにすることを目的とした。
具体的には、特異的なsiRNAライブラリーと各種細胞株(がん細胞株、線維芽細胞)を用いて、単独阻害で核小体とミトコンドリアの構造・機能がともに変化する15分子を選出し、その機能解析、相互作用(複合体)の解析、ChIP-Seqによる標的遺伝子の網羅的解析を実施した。とくに、ヒストンH3K36メチル化酵素NSD2/WHSC1/MMSETが細胞老化の防止を担って、細胞周期を促進する遺伝子群の発現を維持し、エピゲノム・代謝リモデリングにおける役割を見出した。NSD2/WHSC1/MMSETを単独阻害すると、細胞死が誘導されることが分かった。また、ヒストンH3K4脱メチル化酵素LSD1が白血病細胞において、細胞系譜特異的な転写因子を制御することで、エピゲノムと分化・代謝活性を連携させる新たな因子であることを発見した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

エピゲノムとミトコンドリアを機能的に連結する因子について、新知見を得ている。とくに、ヒストンH3K36メチル化酵素NSD2/WHSC1/MMSETおよびヒストンH3K4脱メチル化酵素LSD1など、細胞制御と代謝機能に関わる遺伝子群の発現を調節する機序に関する最先端の研究成果が出ているため。

Strategy for Future Research Activity

本研究は、当初の計画以上に進展してきたため、今後も引き続き研究を推進する。最終年度において研究総括を行う。

  • Research Products

    (20 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results) Book (2 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Cologne大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Cologne大学
  • [Int'l Joint Research] Leicester大学/Imperial College, London/Cambridge大学(英国)

    • Country Name
      UNITED KINGDOM
    • Counterpart Institution
      Leicester大学/Imperial College, London/Cambridge大学
  • [Int'l Joint Research] 国立衛生学研究所NIH/Texas大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      国立衛生学研究所NIH/Texas大学
  • [Int'l Joint Research] Khon Kaen大学(タイ)

    • Country Name
      THAILAND
    • Counterpart Institution
      Khon Kaen大学
  • [Int'l Joint Research] Novartis Pharma AG(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      Novartis Pharma AG
  • [Int'l Joint Research]

    • # of Other Countries
      2
  • [Journal Article] Successful generation of epigenetic disease model mice by targeted demethylation of the epigenome2020

    • Author(s)
      Horii Takuro、Morita Sumiyo、Hino Shinjiro、Kimura Mika、Hino Yuko、Kogo Hiroshi、Nakao Mitsuyoshi、Hatada Izuho
    • Journal Title

      Genome Biology

      Volume: 21 Pages: 77

    • DOI

      10.1186/s13059-020-01991-8

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Computational analysis of morphological and molecular features in gastric cancer tissues2020

    • Author(s)
      Y. Yasuda, K. Tokunaga, T. Koga, C. Sakamoto, I.G. Goldberg, N. Saitoh, and M. Nakao.
    • Journal Title

      Cancer Med.

      Volume: 9 Pages: 2223-2234

    • DOI

      10.1002/cam4.2885

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Distinct roles of NAD+-Sirt1 and FAD-LSD1 pathways in metabolic response and tissue development2019

    • Author(s)
      M. Nakao, K. Anan, H. Araki, and S. Hino.
    • Journal Title

      Trends Endocrinol. Metab.

      Volume: 30 Pages: 409-412

    • DOI

      10.1016/j.tem.2019.04.010

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lysine-specific demethylase-2 is distinctively involved in brown and beige adipogenic differentiation2019

    • Author(s)
      R. Takase, S. Hino, K. Nagaoka, K. Anan, K. Kohrogi, H. Araki, Y. Hino, A. Sakamoto, T. B. Nicholson, T. Chen and M. Nakao.
    • Journal Title

      FASEB J.

      Volume: 33 Pages: 5300-5311

    • DOI

      10.1096/fj.201801422RR

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The Eleanor ncRNAs activate the topological domain of the ESR1 locus to balance against apoptosis2019

    • Author(s)
      M.O. Abdalla, T. Yamamoto, K. Maehara, J. Nogami, Y. Ohkawa, H. Miura, R. Poonperm, I. Hiratani, H. Nakayama, M. Nakao, and N. Saitoh.
    • Journal Title

      Nat. Commun.

      Volume: 10 Pages: 3778

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11378-4

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 栄養環境に応答するエピゲノム機構と表現型制御2020

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      第34回日本糖尿病・肥満動物学会年次学術集会
    • Invited
  • [Presentation] LSD1による環境応答性エピゲノムは骨格筋線維型と代謝型の可塑性に関わる2019

    • Author(s)
      荒木裕貴、日野信次朗、阿南浩太郎、興梠健作、高瀬隆太、中尾光善
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会(ワークショップ:外部環境要因によるエピゲノム機構の破綻とその制御戦略)
    • Invited
  • [Presentation] Flavin-dependent histone demethylases link nutrient sensing to metabolic adaptation2019

    • Author(s)
      S. Hino, K. Anan, H. Araki, K. Kohrogi, R. Takase, and M. Nakao
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会(ワークショップ:Molecular mechanism of various nutrients causing biological reaction)
    • Invited
  • [Presentation] エピゲノム機構による表現型制御2019

    • Author(s)
      中尾光善
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第64回大会(シンポジウム:エピゲノムの揺らぎと疾患)
    • Invited
  • [Presentation] LSD1 inhibition compromises subtype-specific metabolism and sensitizes to iron deprivation in acute myeloid leukemia2019

    • Author(s)
      S. Hino, K. Kohrogi, K. Anan, H. Araki, and M. Nakao
    • Organizer
      Nature Conference on Cellular Metabolism
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 早産児,低出生体重児の成長と発達のみかた-出生からAYA世代まで-2019

    • Author(s)
      中尾光善
    • Total Pages
      301
    • Publisher
      東京医学社
  • [Book] 遺伝子医学MOOK別冊(最新遺伝医学研究と遺伝カウンセリング)2019

    • Author(s)
      阿南浩太郎、中尾光善
    • Total Pages
      304
    • Publisher
      メディカル・ドゥ
  • [Remarks] 熊本大学発生医学研究所

    • URL

      http://www.imeg.kumamoto-u.ac.jp

  • [Patent(Industrial Property Rights)] グリセオリンIの作用機序とその利用2019

    • Inventor(s)
      山本達郎;立和田博昭;齋藤典子;中尾光善
    • Industrial Property Rights Holder
      山本達郎;立和田博昭;齋藤典子;中尾光善
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2019/40052
    • Overseas

URL: 

Published: 2021-01-27  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi