2020 Fiscal Year Annual Research Report
Development and application of new biomarkers of malignant bone and soft tissue tumors (sarcomas) using the method of proteogenomics analysis
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18H02933
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| Research Institution | National Cancer Center Japan |
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Principal Investigator |
川井 章 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 科長 (90252965)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
近藤 格 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (30284061)
市川 仁 国立研究開発法人国立がん研究センター, 先端医療開発センター, ユニット長 (30201924)
吉田 朗彦 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 医員 (80574780)
野口 玲 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 特任研究員 (30779682)
吉松 有紀 国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 特任研究員 (60808632)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | プロテオゲノミクス / 肉腫 / バイオマーカー / 患者由来がんモデル / 細胞株 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
本研究では、肉腫のゲノム・プロテオームの背景を理解することで、転移・再発・治療抵抗性といった臨床的に重要な事象の分子背景を解明しようとしている。本研究の最終的な目的は、鑑別診断や治療効果予測のためのバイオマーカーの開発を通じて、肉腫の治療成績を向上させることにある。国立がん研究センター中央病院を受診した肉腫症例のうち、典型的な組織像と特徴的な遺伝子異常によって確定診断されている症例を対象とし、腫瘍組織を使用した研究を行った。令和元年にゲノムデータと質量分析のデータを得て、国立がん研究センターで開発されたソフトウェアを用いて、プロテオゲノミクスのデータを作成した。令和２年度は、組織型が異なる肉腫、転移再発や治療抵抗性について異なる病像を示す症例などを対象として、差分解析を行った。比較解析は、質的な比較に加えて定量的な比較も行った。インフォマティクスの解析にはバイオコンダクターなど既存の手法を使用し、クラスター解析や主成分分析によってデータを可視化することで、群間比較によるタンパク質の差分解析に加えて、発現差がもたらすサンプルのグループ化にも注目した。また、抗がん剤の標的となるリン酸化酵素の活性を網羅的に調べるプロテオーム解析を実施した。酵素の発現量と活性は必ずしも比例しないことから、活性そのものを調べることで、従来の解析では同定することができなかった事象を捉えることができるかどうかを検討した。また、肉腫の悪性度に相関すると考えられるバイオマーカー候補となるタンパク質の機能解析を目的として、患者由来がんモデル（ゼノグラフトや細胞株）の樹立を試みた。限られた症例数しか網羅的解析の対象とすることができないという希少がん研究の難しい点を、モデル系を用いた機能解析によって補完することを試みる。複数の肉腫組織型について樹立に成功した。
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| Research Progress Status |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和2年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] PATIENT-DERIVED SARCOMA MODELS TOWARDS NOVEL BIOLOGY AND TREATMENT.2020
Author(s)
Kondo T, Noguchi R, Yoshimatsu Y, Tsuchiya R, Ono T, Sin Y, Sei A,Takayashi M, Sugaya J, Yoshida A, Hirabayashi K, Ozawa I, Kosako H,Ichikawa H, Kikuta K, Kawai A.
Organizer
Connective Tissue Oncology Society: CTOS2020
Int'l Joint Research
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[Presentation] Kinetic feature on NCC-aRMS1-C1, a novel alveolar rhabdomyosarcoma cell line, offers new treatment strategy to ARMS.2020
Author(s)
Sin Y, Yoshimatsu Y, Noguchi R, Tsuchiya R, Sei A, Ono T, Toki S, Kobayashi E, Arakawa A, Sugiyama M, Yoshida A, Kawai A, Kondo T.
Organizer
19th Human Proteome Organization World Congress
Int'l Joint Research
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