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2018 Fiscal Year Annual Research Report

A Study of Exploratory Meta-Analysis Based on Analytic Meta-Analysis and SDA

Research Project

Project/Area Number 18H03207
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

水田 正弘  北海道大学, 情報基盤センター, 教授 (70174026)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 南 弘征  北海道大学, 情報基盤センター, 教授 (80261395)
松井 佑介  名古屋大学, 医学系研究科(保健), 准教授 (90761495)
清水 信夫  統計数理研究所, データ科学研究系, 助教 (00332130)
飯島 弘章  北海道大学, 大学病院, 特定専門職員 (00776015) [Withdrawn]
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2023-03-31
KeywordsSDA / コンセプト / データ統合
Outline of Annual Research Achievements

本年度は、以下の事項について研究を推進した。
(1)研究代表者、各研究分担者がそれぞれ有するメタ解析およびシンボリックデータ解析の専門的知識を共有化するとともに、本研究課題に関係する研究成果の調査を実施した。そのために、北海道大学において情報交換会を実施すると共に、それ以外の機会を用いて情報の共有を進めた。(2)メタ解析における基本的な情報である分割表について、シンボリックデータ解析の立場から総合的に検討した。すなわち、分割表内の構造分析のみならず、複数の分割表を総合的に取り扱う方法を扱った。特に、これまでほとんど研究がなされていなかった分割表間の非類似度(距離)の適切な定義を検討した。(3)シンボリックデータ解析における分布値データの解析について検討した。分割表を典型とするメタデータとしての取り扱い手順を開発した。さらに、分割表を含めたメタデータについても、類似度の定義を検討した。(4)研究(メタデータ)間の類似度を利用したシンボリック多次元尺度構成法およびシンボリッククラスター分析の適用方法を検討した。これにより、複数の研究に対する関係性や外れ値の存在を見つけることができる。(5)実際のシステマティック・レビューに対して、上記の成果を適用し、その有効性を評価した。(2)-(5)の成果については、論文投稿準備中である。(6)さらに、シンボリック回帰法、シンボリック判別分析法などの適用可能性についての検討を着手した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

8本の学術論文を投稿し、採録された。さらに、投稿準備中の研究もある。
研究途中であるにもかかわらず、国際的な評価を受け、ECDA(European Conference on Data Analysis)で招待講演をした。

Strategy for Future Research Activity

本年度の活動により、研究代表者および研究分担者における本研究課題のイメージの共通化が可能となった。今後とも、それぞれの専門性を活かした多面的なアプローチを継続する。
特に、「異質性」の検討、多変量メタ解析、ネットワークメタ解析に対して、SDAの考え方・手法を適用することを検討する。

  • Research Products

    (17 results)

All 2019 2018

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 8 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Evaluation of hotspot cluster detection using spatial scan statistic based on exact counting2019

    • Author(s)
      Fumio Ishioka,Jun Kawahara, Masahiro Mizuta, Shin-ichi Minato, Koji Kurihara
    • Journal Title

      Japanese Journal of Statistics and Data Science

      Volume: 1 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1007/s42081-018-0030-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A network of networks approach for modeling interconnected brain tissue-specific networks2019

    • Author(s)
      Kawakubo Hideko、Matsui Yusuke、Kushima Itaru、Ozaki Norio、Shimamura Teppei
    • Journal Title

      Bioinformatics

      Volume: btz032 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btz032

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tumor Subclonal Progression Model for Cancer Hallmark Acquisition2019

    • Author(s)
      Matsui Yusuke、Miyano Satoru、Shimamura Teppei
    • Journal Title

      Lecture Notes in Bioinformatics

      Volume: LNBI1384 Pages: 115-123

    • DOI

      10.1007/978-3-030-14160-8_12

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] GIMLET: Identifying Biological Modulators in Context-Specific Gene Regulation Using Local Energy Statistics2019

    • Author(s)
      Shimamura Teppei、Matsui Yusuke、Kajino Taisuke、Ito Satoshi、Takahashi Takashi、Miyano Satoru
    • Journal Title

      Lecture Notes in Bioinformatics

      Volume: LNBI1384 Pages: 124-137

    • DOI

      10.1007/978-3-030-14160-8_13

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Determination of Serum 25-Hydroxyvitamin D<sub>3</sub> by LC/MS/MS and Its Monthly Variation in Sapporo Indoor Workers2018

    • Author(s)
      OKABE Hiroaki、SHIMIZU Chikara、YAMAMOTO Maiko、KIKUCHI Rei、MINAMI Akiko、CHEN Yi-Fan、IMAI Hideyuki、MIZUTA Masahiro、CHEN Zhen、CHIBA Hitoshi、HUI Shu-Ping
    • Journal Title

      Analytical Sciences

      Volume: 34 Pages: 1043-1047

    • DOI

      10.2116/analsci.18P193

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Early prediction of lenvatinib treatment efficacy by using18F-FDG PET/CT in patients with unresectable or advanced thyroid carcinoma that is refractory to radioiodine treatment: a protocol for a non-randomized single-arm multicenter observational study2018

    • Author(s)
      Takeuchi Satoshi、Shiga Tohru、Hirata Kenji、Taguchi Jun、Magota Keiichi、Ariga Shin、Gouda Tomohiro、Ohhara Yoshihito、Homma Rio、Shimizu Yasushi、Kinoshita Ichiro、Tsuji Yasushi、Homma Akihiro、Iijima Hiroaki、Tamaki Nagara、Dosaka-Akita Hirotoshi
    • Journal Title

      BMJ Open

      Volume: 8 Pages: e021001-e021001

    • DOI

      10.1136/bmjopen-2017-021001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A temporal shift of the evolutionary principle shaping intratumor heterogeneity in colorectal cancer2018

    • Author(s)
      Saito Tomoko、Niida Atsushi、Uchi Ryutaro、Matsui Yusuke, et.al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 9 Pages: 1-10

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05226-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 集約的シンボリックデータのカイ2乗統計量を用いた非類似度とその不動産情報デー タへの適用2018

    • Author(s)
      清水信夫, 中野純司, 山本由和
    • Journal Title

      統計数理

      Volume: 66(2) Pages: 279-294

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Meta-Analysis and Symbolic Data Analysis2019

    • Author(s)
      Masahiro Mizuta
    • Organizer
      European Conference on Data Analysis
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Analyses of serum fatty acids and vitamin D with dimension reduction methods2019

    • Author(s)
      Yifan Chen, Rojeet Shrestha, Zhen Chen, Hitoshi Chiba, Shu-Ping Hui, Emiko Okada, Shigekazu Ukawa, Takafumi Nakagawa, Koshi Nakamura, Akiko Tamakoshi, Yuriko Komiya, Hiroyuki Minami, Masahiro Mizuta
    • Organizer
      European Conference on Data Analysis
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Big Data and Post Big Data2018

    • Author(s)
      Masahiro Mizuta
    • Organizer
      Big Data Conferencia Latinoamericana
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Statistical and Mathematical Models for Radiotherapy2018

    • Author(s)
      Masahiro Mizuta
    • Organizer
      7th German-Japanese Symposium at TU Dortmund University
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] シンボリックデータ解析と探索的メタアナリシスについて2018

    • Author(s)
      水田正弘
    • Organizer
      2018年度統計関連学会連合大会
  • [Presentation] Exploratory Meta-Analysis with SDA2018

    • Author(s)
      Masahiro Mizuta
    • Organizer
      Symbolic Data Analysis Workshop (SDA 2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 集約的シンボリックデータの変数選択2018

    • Author(s)
      清水信夫, 中野純司, 山本由和
    • Organizer
      2018年度統計関連学会連合大会
  • [Presentation] Dissimilarity between aggregated symbolic data using chi-squared statistics2018

    • Author(s)
      Shimizu, N., Nakano, J. and Yamamoto, Y.
    • Organizer
      Symbolic Data Analysis Workshop (SDA 2018)
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 遺伝統計学と疾患ゲノムデータ解析 : 病態解明から個別化医療, ゲノム創薬まで phyC- がん進化を推定・分類するためのデータ駆動型数理アプローチ2018

    • Author(s)
      松井佑介・島村徹平
    • Total Pages
      242-247
    • Publisher
      メディカルドゥ
    • ISBN
      4944157630

URL: 

Published: 2019-12-27  

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