• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

New development of genome editing technologies and disease models

Research Project

Project/Area Number 18H03974
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

真下 知士  東京大学, 医科学研究所, 教授 (80397554)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 吉見 一人  東京大学, 医科学研究所, 講師 (50709813)
Project Period (FY) 2018-04-01 – 2022-03-31
Keywordsゲノム編集 / 診断薬 / CRISPR-Cas3 / オフターゲット / 受精卵 / 疾患モデル / DNA修復
Outline of Annual Research Achievements

CRISPR-Cas3タンパク質によるDNA切断:CRISPR-Cas3タンパク質を精製して、試験管内でのDNA切断を確認した。CONAN法を利用して、標的配列特異性、PAM配列特異性、ミスマッチ配列切断等を精査することで、Cas3による一本鎖切断と二本鎖切断の違い、およびオフターゲット切断を明らかにした(論文報告)。
マウス・ラット受精卵におけるゲノム編集:マウス・ラット受精卵において、CRISPR-Cas3による最適なゲノム編集プロトコールの作成を行った。マイクロインジェクション、エレクトロポレーションによりCRISPR-Cas3を構成する7種類のmRNAを導入することで、マウスアルビノ遺伝子、ラット免疫不全遺伝子のゲノム編集に成功した(論文準備中)。
CRISPR-Cas3システムによるゲノム編集メカニズムの解明:二箇所のDNA切断ドメインを持つCas9と比較して、一箇所のDNA切断ドメインしか持たないCas3がどのようにPAM上流側の長い二本鎖DNA領域の切断・大規模欠失を導入するメカニズムを明らかにした。高速原子力顕微鏡AFMを利用して、世界で初めてCRISPR-Cas3によるDNA二本鎖切断の可視化に成功した(論文投稿中)。
ヒトHEK細胞、免疫T細胞、線維芽細胞において、B2MやTRAC等の複数遺伝子、リピート配列等を対象にゲノム編集を行った。ヒト疾患遺伝子を対象にCRISPR-Cas3プラスミド、mRNA、タンパク質を利用することで、高効率なゲノム編集プロトコールを作成した(論文準備中)。ハイドロダイナミクス法を用いることでモデルマウスにCRISPR/Cas3を導入して、体細胞in vivoゲノム編集に成功した。
以上のことから、平成30年度から令和3年度まで、開始当初の研究計画に一部の変更はあったものの、おおむね順調に進展したと自己評価する。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (33 results)

All 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 4 results) Presentation (20 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 20 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Int'l Joint Research] ETH Zurich(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      ETH Zurich
  • [Journal Article] CRISPR-Cas3-based diagnostics for SARS-CoV-2 and influenza virus2022

    • Author(s)
      Yoshimi Kazuto、Takeshita Kohei、Yamayoshi Seiya、Shibumura Satomi、Yamauchi Yuko、Yamamoto Masaki、Yotsuyanagi Hiroshi、Kawaoka Yoshihiro、Mashimo Tomoji
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 103830~103830

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.103830

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Study of the CRISPR/Cas3 System for Xenotransplantation2022

    • Author(s)
      Miyagawa Shuji、Watanabe Masahito、Nagashima Hiroshi、Sato Kazuki、Kogata Shuhei、Toyama Chiyoshi、Masahata Kazunori、Kamiyama Masafumi、Yamamoto Riho、Eguchi Hiroshi、Maeda Akira、Yoshimi Kazuto、Mashimo Tomoji、Okuyama Hiroomi
    • Journal Title

      Transplantation Proceedings

      Volume: 54 Pages: 522~524

    • DOI

      10.1016/j.transproceed.2021.09.070

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A humanised rat model of osteosarcoma reveals ultrastructural differences between bone and mineralised tumour tissue2022

    • Author(s)
      Lahr Christoph A.、Landgraf Marietta、Wagner Ferdinand、Cipitria Amaia、Moreno-Jimenez Ines、Bas Onur、Schmutz Beat、Meinert Christoph、Cavalcanti Amanda Dos Santos、Mashimo Tomoji、Miyasaka Yoshiki、Holzapfel Boris M.、Shafiee Abbas、McGovern Jacqui A.、Hutmacher Dietmar W.
    • Journal Title

      Bone

      Volume: 158 Pages: 116018~116018

    • DOI

      10.1016/j.bone.2021.116018

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 受精卵のゲノム編集2022

    • Author(s)
      石田紗恵子、真下知士
    • Journal Title

      HORMONE FRONTIER IN GYNECOLOGY

      Volume: Vol.29 No.1 Pages: 31-36

  • [Journal Article] Impact of GAD65 and/or GAD67 deficiency on perinatal development in rats2021

    • Author(s)
      Jiang Weiru、Kakizaki Toshikazu、Fujihara Kazuyuki、Miyata Shigeo、Zhang Yue、Suto Takashi、Kato Daiki、Saito Shigeru、Shibasaki Koji、Ishizaki Yasuki、Isoda Koji、Yokoo Hideaki、Obinata Hideru、Hirano Touko、Miyasaka Yoshiki、Mashimo Tomoji、Yanagawa Yuchio
    • Journal Title

      The FASEB Journal

      Volume: 36 Pages: -

    • DOI

      10.1096/fj.202101389R

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Aberrant accumulation of TMEM43 accompanied by perturbed transmural gene expression in arrhythmogenic cardiomyopathy2021

    • Author(s)
      Shinomiya Haruki、Kato Hisakazu、・・・・・・・・Mashimo Tomoji、・・・・・・・・・・・・・・・・Sakata Yasushi、Asano Yoshihiro
    • Journal Title

      The FASEB Journal

      Volume: 35 Pages: -

    • DOI

      10.1096/fj.202100800R

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Response to correspondence on “Reproducibility of CRISPR-Cas9 methods for generation of conditional mouse alleles: a multi-center evaluation”2021

    • Author(s)
      Gurumurthy Channabasavaiah B.、O’Brien Aidan R.、・・・・・・・・・・・・・・・・・・Mashimo Tomoji、・・・・・・・・・・・・・・・Burgio Gaetan
    • Journal Title

      Genome Biology

      Volume: 22 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s13059-021-02320-3

    • Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Deletion of B-cell translocation gene 2 (BTG2) alters the responses of glial cells in white matter to chronic cerebral hypoperfusion2021

    • Author(s)
      Suzuki Kaoru、Shinohara Mitsuru、Uno Yoshihiro、Tashiro Yoshitaka、Gheni Ghupurjan、Yamamoto Miho、Fukumori Akio、Shindo Akihiko、Mashimo Tomoji、Tomimoto Hidekazu、Sato Naoyuki
    • Journal Title

      Journal of Neuroinflammation

      Volume: 18 Pages: -

    • DOI

      10.1186/s12974-021-02135-w

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] CRISPR技術を用いた核酸検出2021

    • Author(s)
      吉見一人、真下知士
    • Journal Title

      実験医学

      Volume: 2021年5月号 Vol.39 No.8 Pages: 1214-1218

  • [Presentation] ゲノム編集技術とその医療応用/ゲノム編集を応用した毒性病理学の新展開2022

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第38回日本毒性病理学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] A genome editing technology CRISPR-Cas3 in gene therapy, Institute for the Advanced Study of Human Biology2022

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      WPI-ASHBi Seminar.
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集CRISPR-Cas3の現状と展開2022

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第127回日本解剖学会全国学術集会
    • Invited
  • [Presentation] CRISPR-Cas3 の遺伝子治療応用と今後の可能性について2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      JBA創薬モダリティ基盤研究会
    • Invited
  • [Presentation] 新型コロナウイルスの迅速診断法を語る2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      サイエンス映像学会(SVS)月例研究会
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集が拓く疾患モデル研究の最先端2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第68回日本実験動物学会総会
    • Invited
  • [Presentation] A novel genome editing tool CRISPR Cas32021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      48 th IMSUT Founding Commemorative Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新規国産ゲノム編集技術 CRISPR-Cas3 の開発と医療応用/Development of a Novel Genome Editing Tool CRISPR-Cas32021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      日本ゲノム編集学会第6回大会
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集技術の最新動向2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第21回日本抗加齢医学会総会
    • Invited
  • [Presentation] 次世代型ゲノム編集技術の開発2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第73回日本細胞生物学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 新規ゲノム編集技術CRISPR-Cas3の開発と応用2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      シンポジウム2021-維新の地から挑む革新的医療技術の創出ー文部科学省
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集が拓く疾患モデル研究2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第17 回 北海道実験動物研究会(HALAS)学術集会 特別講演
    • Invited
  • [Presentation] 脳神経疾患・モデルの開発2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      日中ハイレベル研究者交流会~パブリックヘルスと生命システム科学~
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] CRISPR-Cas3を用いたゲノム編集の可能性2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第38回日本植物バイオテクノロジー学会(つくば)大会
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集とヒト化動物2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      実験動物に感謝する集い
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集技術の開発や新しいモデル動物の開発動向などについて2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      日本実験動物協同組合(JCALA)の研修会
    • Invited
  • [Presentation] 創薬モダリティの進化2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      Bio Japan 2021セミナー
    • Invited
  • [Presentation] Application of genome editing technology CRISPR-Cas3 in gene therapy2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第27回東アジアシンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] CRISPER-Cas3によるゲノム編集と医療応用2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第15回iPS細胞産学合同研究会
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム編集技術概論と新規国産ゲノム編集技術について2021

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第 427 回 CBI 学会講演会
    • Invited
  • [Remarks] 東京大学医科学研究所実験動物研究施設先進動物ゲノム研究分野

    • URL

      https://www.ims.u-tokyo.ac.jp/animal-genetics/index.html

  • [Remarks] 東京大学医科学研究所システム疾患モデル研究センター先進モデル動物作製コア

    • URL

      https://www.ims.u-tokyo.ac.jp/cemsb/public_html/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 試料中の特定のDNAを検出する方法2021

    • Inventor(s)
      真下知士、吉見一人、渋村里美
    • Industrial Property Rights Holder
      大阪大学、C4U株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      6940086

URL: 

Published: 2022-12-28  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi