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2020 Fiscal Year Annual Research Report

翻訳ダイナミクス制御によるタンパク質機能発現機構

Research Project

Project/Area Number 18H03984
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

田口 英樹  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (40272710)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Keywordsセントラルドグマ / 翻訳 / シャペロン / タンパク質フォールディング / 無細胞翻訳系 / プロテオミクス / RAN翻訳
Outline of Annual Research Achievements

近年、我々の研究成果を含めて非典型的な翻訳が続々と明らかになってきており、翻訳周辺には未開の分野が拡がっていることがわかってきた。例えば、我々は、負電荷アミノ酸に富んだアミノ酸配列を翻訳する際にリボソームが不安定化され(Intrinsic ribosome destabilization: IRD)、結果として翻訳が途中終了する現象を世界に先んじて見出した(Chadani et al, Mol Cell 2017)。そこで本研究では、IRDや、疾患に関わる非典型的な翻訳(塩基リピートに関連した非ATG翻訳:RAN翻訳)などを中心に翻訳ダイナミクス制御について、プロテオーム解析なども含めながら包括的に理解することを目的とした。2020年度は、非典型的な翻訳動態に付随したいくつかの現象に関して大きな成果を得た。【研究1】1)翻訳の連続性を保証するリボソームトンネル内の新生鎖の役割(大腸菌)(Chadani et al EMBO J 2021)、2)不連続な遺伝子読み枠から一本のポリペプチドが合成される翻訳バイパスにおけるIRDの関与(大腸菌)、3)大腸菌で見つかったIRDの真核生物での解析、などである。【研究2】疾患に関連した塩基リピートmRNAの一部で開始コドンがないにも関わらず複数のフレームが翻訳され、疾患に関連するRAN翻訳をヒト因子由来の再構築型無細胞翻訳系で解析する準備を行った。【研究3】熱ストレス時にタンパク質が不可逆に凝集するのを防ぐ低分子量熱ショックタンパク質(small Hsp)が自らをコードするmRNAに結合して翻訳抑制をするという新規の翻訳レベルでの遺伝子発現制御を発見した(Miwa et al, Mol Microbiol 2021)。【その他】本科研費で稼働した質量分析によるプロテオーム解析にて多くの共同研究を行い、多数の論文発表に貢献した。

Research Progress Status

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和2年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2021 2020

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results)

  • [Journal Article] Nascent polypeptide within the exit tunnel stabilizes the ribosome to counteract risky translation2021

    • Author(s)
      Chadani Yuhei、Sugata Nobuyuki、Niwa Tatsuya、Ito Yosuke、Iwasaki Shintaro、Taguchi Hideki
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 40 Pages: 1-13

    • DOI

      10.15252/embj.2021108299

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] C9orf72-derived arginine-rich poly-dipeptides impede phase modifiers2021

    • Author(s)
      Nanaura Hitoki、Kawamukai Honoka、Fujiwara Ayano、et al.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 12 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41467-021-25560-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Acetate overflow metabolism regulates a major metabolic shift after glucose depletion in <i>Escherichia</i> ? <i>coli</i>2021

    • Author(s)
      Shimada Tomohiro、Nakazawa Kohta、Tachikawa Tomoyuki、Saito Natsumi、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Tanaka Kan
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 595 Pages: 2047~2056

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14151

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proximity Histidine Labeling by Umpolung Strategy Using Singlet Oxygen2021

    • Author(s)
      Nakane Keita、Sato Shinichi、Niwa Tatsuya、Tsushima Michihiko、Tomoshige Shusuke、Taguchi Hideki、Ishikawa Minoru、Nakamura Hiroyuki
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 143 Pages: 7726~7731

    • DOI

      10.1021/jacs.1c01626

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel self-regulation strategy of a small heat shock protein for prodigious and rapid expression on demand2021

    • Author(s)
      Miwa Tsukumi、Taguchi Hideki
    • Journal Title

      Current Genetics

      Volume: 67 Pages: 723~727

    • DOI

      10.1007/s00294-021-01185-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Thioredoxin pathway in <i>Anabaena</i> sp. PCC 7120: activity of NADPH-thioredoxin reductase C2021

    • Author(s)
      Deschoenmaeker Frederic、Mihara Shoko、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Wakabayashi Ken-Ichi、Toyoshima Masakazu、Shimizu Hiroshi、Hisabori Toru
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 169 Pages: 709~719

    • DOI

      10.1093/jb/mvab014

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The evolutionary conserved iron-sulfur protein TCR controls P700 oxidation in photosystem I2021

    • Author(s)
      Luu Trinh Mai Duy、Miyazaki Daichi、Ono Sumire、Nomata Jiro、Kono Masaru、Mino Hiroyuki、Niwa Tatsuya、Okegawa Yuki、Motohashi Ken、Taguchi Hideki、Hisabori Toru、Masuda Shinji
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 24 Pages: 102059~102059

    • DOI

      10.1016/j.isci.2021.102059

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] <i>Escherichia coli</i> small heat shock protein IbpA is an aggregation‐sensor that self‐regulates its own expression at posttranscriptional levels2020

    • Author(s)
      Miwa Tsukumi、Chadani Yuhei、Taguchi Hideki
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 115 Pages: 142~156

    • DOI

      10.1111/mmi.14606

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] G-quadruplex-proximity protein labeling based on peroxidase activity2020

    • Author(s)
      Masuzawa Tatsuki、Sato Shinichi、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Nakamura Hiroyuki、Oyoshi Takanori
    • Journal Title

      Chemical Communications

      Volume: 56 Pages: 11641~11644

    • DOI

      10.1039/d0cc02571b

    • Peer Reviewed

URL: 

Published: 2022-12-28  

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