Development of DNA markers to identify races of southern root-knot nematode.

2020 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18K05663
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39040:Plant protection science-related
• Research Institution: National Agriculture and Food Research Organization
• Principal Investigator: Tabuchi Hiroaki 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, 上級研究員 (10355571)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 浅水 恵理香 龍谷大学, 農学部, 教授 (00370924) ; 上杉 謙太 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, 主任研究員 (00414798) ; 鈴木 崇之 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 九州沖縄農業研究センター, チーム長 (20414823)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: サツマイモネコブセンチュウ / レース / DNAマーカー / サツマイモ

Outline of Final Research Achievements

Races of the southern root-knot nematode (SRKN) is identified based on their different responses to six differential sweetpotato cultivars. Because this inoculation method is time-comsuming and laboriuos, we intented to develop DNA markers to identify SRKN races easily. At first, we established new single egg-mass isolates of SRKN followed by the race idenfication with inocultaion method. Then we conducted DNA polymorphism analysis of 40 new and already-existing isolates of SRKN, and did not identify the race-specific genome region. However, we suppose that analysis of about 20 isolates of each SRKN race might restrict the race-specific DNA region to several sites out of about fifty thousand polymorphic sites.

Free Research Field

植物遺伝学。分子生物学。

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

線虫レースの分化に関与するゲノム領域の同定は、植物が線虫を異物と認識し、線虫がそれを回避するために分子進化する機構の解明に繋がる。また、簡易なレース判別システムの開発により、抵抗性品種の導入による低コストな線虫被害抑制対策が行える。本研究では各レースにつき約20系統の解析によりレース特異的DNA多型部位を数カ所程度まで絞り込める可能性を示すことで、上記目標に向けた新知見を与えるものである。