2021 Fiscal Year Annual Research Report
Development of a new meaningful clinical bacteriological test based on metagenomic and DNA methylation analysis
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18K07408
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
西村 基 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (80400969)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
佐藤 守 千葉大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (20401002) [Withdrawn]
田中 知明 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (50447299)
別府 美奈子 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (70623669) [Withdrawn]
松下 一之 千葉大学, 医学部附属病院, 准教授 (90344994)
土田 祥央 日本大学, 医学部, 助手 (90410422)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 臨床検査 / 細菌検査 / メタゲノム / メチル化解析 / 新型コロナウイルス感染症 / COVID-19 / SARS-CoV-2 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
前年度における本報告では、「今後の研究の推進方策」において、「研究成果の英文査読付き雑誌への論文投稿」、「本研究課題を細菌分野において発展させたい。前年度までに述べた通り細菌種横断的にepigeneticsとして広くDNAメチル化を解析できるため、研究代表者の所属する病院検査部のような日々、大量に（年間数万件の単位で）細菌同定検査の検査後廃棄物が排出される即ち分離培養・同定された菌株が日常的に手に入る環境においては、未だ知られざるDNAメチル化や、その責任新規酵素、そして薬剤耐性など臨床的な表現型との関係など、科学的にも知財の面からも大いにその発展は期待できると考える。」などと述べた。
本年度においては、頭書の通り「研究成果の英文査読付き雑誌への論文投稿」を行い、BioRxivにて公開(https://doi.org/10.1101/2022.02.15.480630)すると同時に現在雑誌社によるreviewを受けている状態であり、上記の推進方策は達成されたものと考える。
さらに述べると、推進方策で述べた内容のうち、DNAメチル化の責任新規酵素を同定していることは前年度で述べたが、今年度においては、さらに、この酵素の薬剤耐性など臨床的な表現型との関係について検討を進めており、一部の抗生物質への耐性に促進的な性格を持つことを示すことができた。病原性を持つ菌においてのDNAメチル化と臨床的な表現型の関連性の検討は、まさにこれからの分野であり、その端緒の一つとなれる実績であることを確信している。
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