2018 Fiscal Year Research-status Report
頭頸部扁平上皮癌におけるFGFR遺伝子異常の解明と検出
Project/Area Number |
18K09328
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Research Institution | Juntendo University |
Principal Investigator |
肥後 隆三郎 順天堂大学, 医学部, 教授 (10301110)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大峡 慎一 順天堂大学, 医学部, 准教授 (20549274)
山内 宏一 順天堂大学, 医学部, 准教授 (70407047)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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Keywords | FGFR / 頭頸部癌 |
Outline of Annual Research Achievements |
FGFRは、受容体型チロシンキナーゼファミリーに属しているキナーゼで、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4によりFGFRファミリーを構成している。リガンドは線維芽細胞増殖因子(FGF)であり、22種の構造的に類似したタンパク質がファミリーを構成している。FGFRを介して伝達されるシグナルはMAPK経路やPI3K/AKT経路に流れ、このシグナル伝達は、癌においては、細胞増殖、血管新生、細胞遊走、浸潤、転移などに関わっている。またFGFRは、過剰発現、遺伝子過増幅、変異、転座によって活性化することが報告されている。本研究ではFGFR阻害薬のターゲットとなる頭頸部扁平上皮癌に生じたFGFRドライバー遺伝子異常を明らかにすることを目的とし、頭頸部癌の臨床検体よりFGFR遺伝子における塩基置換、遺伝子コピー数の変化、他の遺伝子との融合などの異常のプロファイリングを明らかとし、頭頸部癌のタイプごとに対するFGFR遺伝子変異の検討を進めている。頭頸部扁平上皮癌では同じ扁平上皮癌であっても上咽頭癌ではEBウイルス、中咽頭癌ではHPVウイルスの関与が原因としてあがり、下咽頭癌では喫煙、アルコールによる発癌機序が推測されており遺伝子異常のプロファイリングは異なる。FGFR阻害薬については、FGFRドライバー遺伝子異常のプロファイリングが必須である。本研究計画では、口腔、上咽頭、中咽頭、下咽頭、喉頭の各亜部位別より得られた頭頸部癌臨床検体を用いてFGFR遺伝子の配列をサンガー法による遺伝子解析を用いて調べて正常な遺伝子配列と比較することにより、頭頸部扁平上皮癌におけるFGFR遺伝子の変異を解析する。また、ならびにFISH法を用いてFGFR遺伝子の遺伝子融合を解析する。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
頭頸部扁平上皮癌を対象とし、口腔、上咽頭、中咽頭、下咽頭、喉頭の5亜部位からサンプルを採取している。サンプル採取は順天堂浦安病院において耳鼻咽喉・頭頸科の肥後、山内が行っている。各亜部位別に10症例計50例を目標とし、サンプル採取のため2018年に順天堂浦安病院でのIRBに申請し当研究の承認を受けた。現在各亜部位におけるサンプル採取を進めているところである。2018年はサンプル採取を中心に行なっており、遺伝子解析を2019年度より開始する予定である。
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Strategy for Future Research Activity |
遺伝子解析に関しては腫瘍内科の加藤を研究協力者とし、適宜耳鼻咽喉・頭頸科の肥後、大峡が検査を行う予定である。癌の病理検査のために行った生検サンプルあるいは手術の際に採取した組織サンプルを用いて、ホルマリン固定パラフィン包埋(FFPE)切片を作成し病理判定を行う。FFPE切片の残余サンプルから切片サンプルのがんを一定割合以上含む部分を削りだし、削り取った組織サンプルから核酸(DNA+RNA)を抽出精製する。抽出精製した核酸よりFGFR遺伝子配列をサンガー法による遺伝子解析を用いて調べて正常な遺伝子配列と比較することにより、頭頸部扁平上皮癌におけるFGFR遺伝子の変異を解析する。また、FISH法を用いてFGFR遺伝子の遺伝子融合を解析する。これまでに報告されている論文などの情報を基に、見出された変異の候補において 1)FGFR2、FGFR3における発がんに関連すると考えられる1塩基置換の検出 2)FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4における遺伝子コピー数の変化 3)FGFR1、FGFR2、FGFR3における遺伝子融合 をターゲットとする。本研究は、研究代表者の肥後が中心となって全般的に研究計画を主導する。肥後は研究統括を行うとともに遺伝子解析を行う。標本の採取に関しては順天堂浦安病院において肥後ならびに山内が行い、本学においては大峡があたる。分担者である同科の大峡、山内は遺伝子解析においてもその実行を担う。また、遺伝子変異のデータ解析については、肥後が実施する一方で、本学の遺伝子解析部門の長である加藤のサポートを受けフィードバックを受ける。
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Causes of Carryover |
2018年度はサンプル採取を中心に行った。最も金額を投入することになる遺伝子解析を2019年度に行うため、2018年の研究費の一部を2019年度へ移動させることとした。
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