2020 Fiscal Year Annual Research Report
Molecular signature of head and neck squamous cell carcinoma after treatment failure based on functional RNA analysis
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18K09338
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Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
関 直彦 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (50345013)
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Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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Keywords | マイクロRNA / 頭頸部扁平上皮癌 / 癌抑制遺伝子 / 癌遺伝子 / miR-30e-5p / TCGA |
Outline of Annual Research Achievements |
ヒトゲノムプロジェクトの成果を受けて、ヒトゲノム中には当初の予想に反して、蛋白をコードしないRNA分子が多数存在しており、これらRNA分子は、実際に転写されて機能している(機能性RNA)事が明らかになってきた。マイクロRNAは、僅か19塩基から22塩基程度の1本鎖RNA分子であり、その機能は、蛋白コード遺伝子の発現を、配列依存的に負に制御する事である。マイクロRNA特徴としては、1種類のマイクロRNAが制御する遺伝子は、数十種類から数百種類におよぶ事である。そのため、マイクロRNAの発現異常は、細胞内の標的遺伝子や遺伝子ネットワークの破綻を促進する。これまでに、マイクロRNAの発現異常は、様々な癌種で報告されており、癌細胞の悪性化、転移、薬剤耐性に深く関与している事が明らかとなっている。本研究の目的は、癌抑制型マイクロRNAを探索する事。更に、癌抑制型マイクロRNAが制御する分子ネットワークの探索から、癌細胞の薬剤耐性に関わる標的分子を見つけ出す事である。本研究では、頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)患者・臨床検体より作成したマイクロRNA発現プロファイルに基づき、癌抑制型マイクロRNAの同定と、マイクロRNAが制御する癌促進型遺伝子の探索を行った。探索可能であった標的分子については、The Cancer Genome Atlas(TCGA)データベース解析を行い、各遺伝子の発現と患者の臨床病理学的な検討を行った。本年度は、プロファイルに基づき、癌組織で発現が抑制されているmiR-30-familyに着目し、その臨床病理学的な解析と、マイクロRNAが制御する遺伝子の探索を行った。
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