Development of a comprehensive analysis of cytosine variants for cellular evaluation

2019 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18K14258
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 34020:Analytical chemistry-related
• Research Institution: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• Principal Investigator: Kurinomaru Takaaki 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員 (50769693)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2020-03-31
• Keywords: イムノアッセイ / DNA / エピジェネティクス / シトシンバリアント

Outline of Final Research Achievements

DNA methylation is considered to be an important epigenetic modification for controlling gene expression. Since the discovery of the active DNA demethylation pathway in mammals, numerous efforts have been made to distinguish epigenetic cytosine variants, including 5-methylcytosine (5mC), 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), 5-formylcytosine (5fC), and 5-carboxylcytosine (5caC). In this project, we developed a technique for the sequential multiple assessment of cytosine variants by a surface-plasmon-resonance (SPR)-based immunochemical assay.

Free Research Field

分析化学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ELISA法などの従来のイムノアッセイでは、一つのDNAに含まれる2種類以上の標的を評価できないため、4種のシトシンバリアントを一度に識別することが困難であった。本研究で開発したSPRイムノアッセイでは、同一DNAに含まれる4種のシトシンバリアントを連続して検出することに成功した。本研究で開発した手法は、シトシンバリアントの生物学的意義や産業的価値を明らかにする有用なツールになると期待できる。