Phylogeny of uncultured bacteria possessing pmoA gene and rRNA approach

2020 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 18K14777
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
• Research Institution: Kanazawa University
• Principal Investigator: Matsuura Norihisa 金沢大学, 地球社会基盤学系, 助教 (90771585)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: 16S rRNA遺伝子 / pmoA遺伝子 / メタン酸化細菌 / 遺伝子結合PCR

Outline of Final Research Achievements

We developed an emulsion fusion PCR to link between 16S rRNA gene and functional gene. The fusion PCR was evaluated using a pure cultures experiment. And an uncultured methanotroph is discovered in forest soils as high population. We applied the developed tool to the sample and determined the phylogeny of the uncultured methanotroph.

Free Research Field

微生物生態学、環境工学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

温室効果ガスであるメタンは地球上の至るところから発生している。一方で、メタンを温室効果ポテンシャルの低い二酸化炭素に変換する微生物（メタン酸化細菌）も地球上に数多く存在する。このメタン酸化細菌の多くは未知微生物として知られている。本研究では、これらの微生物を検出し、その生態系を解明することを目的としている。本研究の成果は、未知微生物の生態を明らかにし、地球上の未だ不明なメタン循環の理解に貢献できる。