Characterization of novel paramyxoviruses isolated from bats in Africa

2020 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 18K15163
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 梶原 将大 北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 助教 (70711894)
• Project Period (FY): 2018-04-01 – 2021-03-31
• Keywords: パラミクソウイルス / コウモリ / アフリカ / 人獣共通感染症 / ブニヤウイルス

Outline of Annual Research Achievements

これまでにザンビアで捕獲した合計325頭のRousettus aegyptiacusの結腸乳剤をVero T2T11D細胞およびZFBK15-137RA細胞に接種し、ウイルス分離を試みた。次世代シークエンサーを用いて、培養上清中のウイルス遺伝子をスクリーニングしたところ、パラミクソウイルス科オルソルブラウイルス属に属するウイルスの遺伝子が得られた。得られた遺伝子配列を用いて分子系統解析を実施したところ、パラインフルエンザウイルス2型に近縁な新規ウイルスが新たに分離されたことがわかった。
また、昨年度ザンビアのコウモリから分離された２株のブニヤウイルスについて、その全ゲノム配列を決定し、遺伝学的な解析を実施した。解析の結果、一方のウイルスはフェヌイウイルス科バンダウイルス属に属し、重症熱性血小板減少症候群ウイルスに近縁であることがわかった。また、他方のウイルスはナイロウイルス科オルソナイロウイルス属に属し、1970年代にウガンダでヒトに熱性疾患を引き起こしたカソケロウイルスであることがわかった。コウモリの脾臓/肝臓RNAを用いてカソケロウイルス遺伝子のスクリーニングを実施したところ、遺伝的に異なる３系統のウイルスがザンビアのコウモリ群において維持されていることが明らかとなった。
これらのコウモリ由来ウイルスの病原性を明らかにするために、マウス、ラット、ハムスター等の齧歯類モデル動物を用いて感染実験を実施した。ウイルス学的解析の結果、いずれのウイルスもコウモリ以外の哺乳類動物に対する感染性を有することがわかった。特に、カソケロウイルスはマウスおよびハムスターに対して致死的な感染を引き起こした。今後、これらのウイルスのヒトに対する感染性、病原性について評価する必要がある。

Research Products

• [Int'l Joint Research] ザンビア大学獣医学部/大学教育病院/国立公園・野生動物局(ザンビア)
  • Country Name: ZAMBIA
  • Counterpart Institution: ザンビア大学獣医学部/大学教育病院/国立公園・野生動物局
  • # of Other Institutions: 3
• [Journal Article] First COVID-19 case in Zambia ? Comparative phylogenomic analyses of SARS-CoV-2 detected in African countries (2021)
  • Author(s): Simulundu E, Mupeta F, Chanda-Kapata P, Saasa N, Changula K, Muleya W, Chitanga S, Mwanza M, Simusika P, Chambaro H, Mubemba B, Kajihara M, Chanda D, Mulenga L, Fwoloshi S, Shibemba AL, Kapaya F, Zulu P, Musonda K, Monze M, Sinyange N, Mazaba ML, Kapin’a M, Chipimo PJ, Hamoonga R, Simwaba D, Ngosa W, et al.
  • Journal Title: International Journal of Infectious Diseases Volume: 102 Pages: 455～459
  • DOI: 10.1016/j.ijid.2020.09.1480
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Prevalence and genetic diversity of Shibuyunji virus, a novel tick-borne phlebovirus identified in Zambia (2021)
  • Author(s): Simulundu E, Mbambara S, Chambaro HM, Sichibalo K, Kajihara M, Nalubamba KS, Sawa H, Takada A, Changula K, Chitanga S
  • Journal Title: Archives of Virology Volume: 166 Pages: 915～919
  • DOI: 10.1007/s00705-020-04924-9
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Purification of Crimean?Congo hemorrhagic fever virus nucleoprotein and its utility for serological diagnosis (2021)
  • Author(s): Lombe BP, Miyamoto H, Saito T, Yoshida R, Manzoor R, Kajihara M, Shimojima M, Fukushi S, Morikawa S, Yoshikawa T, Kurosu T, Saijo M, Tang Q, Masumu J, Hawman D, Feldmann H, Takada A
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 11 Pages: 2324
  • DOI: 10.1038/s41598-021-81752-0
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Detection of B.1.351 SARS-CoV-2 Variant Strain ? Zambia, December 2020 (2021)
  • Author(s): Mwenda M, Saasa N, Sinyange N, Busby G, Chipimo PJ, Hendry J, Kapona O, Yingst S, Hines JZ, Minchella P, Simulundu E, Changula K, Nalubamba KS, Sawa H, Kajihara M, Yamagishi J, Kapin’a M, Kapata N, Fwoloshi S, Zulu P, Mulenga LB, Agolory S, Mukonka V, Bridges DJ
  • Journal Title: MMWR. Morbidity and Mortality Weekly Report Volume: 70 Pages: 280～282
  • DOI: 10.15585/mmwr.mm7008e2
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] An African tick flavivirus forming an independent clade exhibits unique exoribonuclease-resistant RNA structures in the genomic 3′-untranslated region (2021)
  • Author(s): Harima H, Orba Y, Torii S, Qiu Y, Kajihara M, Eto Y, Matsuta N, Hang’ombe BM, Eshita Y, Uemura K, Matsuno K, Sasaki M, Yoshii K, Nakao R, Hall WW, Takada A, Abe T, Wolfinger MT, Simuunza M, Sawa H
  • Journal Title: Scientific Reports Volume: 11 Pages: 4883
  • DOI: 10.1038/s41598-021-84365-9
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] 新たな問題となりうるコウモリ・節足動物媒介性ウイルス (2021)
  • Author(s): 梶原将大, 大場靖子, 高田礼人
  • Journal Title: Pharma Medica Volume: 39(1) Pages: 43-47
  • DOI: 10.34449/J0001.39.01_0043-0047
• [Journal Article] Potential Role of Nonneutralizing IgA Antibodies in Cross-Protective Immunity against Influenza A Viruses of Multiple Hemagglutinin Subtypes (2020)
  • Author(s): Okuya K, Yoshida R, Manzoor R, Saito S, Suzuki T, Sasaki M, Saito T, Kida Y, Mori-Kajihara A, Kondoh T, Sato M, Kajihara M, Miyamoto H, Ichii O, Higashi H, Takada A
  • Journal Title: Journal of Virology Volume: 94 Pages: e00408-20
  • DOI: 10.1128/JVI.00408-20
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Evidence for exposure of asymptomatic domestic pigs to African swine fever virus during an inter‐epidemic period in Zambia (2020)
  • Author(s): Chambaro HM, Sasaki M, Sinkala Y, Gonzalez G, Squarre D, Fandamu P, Lubaba C, Mataa L, Shawa M, Mwape KE, Gabriel S, Chembensofu M, Carr MJ, Hall WW, Qiu Y, Kajihara M, Takada A, Orba Y, Simulundu E, Sawa H.
  • Journal Title: Transboundary and Emerging Diseases Volume: 67 Pages: 2741～2752
  • DOI: 10.1111/tbed.13630
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Isolation of Candidatus Bartonella rousetti and Other Bat-associated Bartonellae from Bats and Their Flies in Zambia (2020)
  • Author(s): Qiu Y, Kajihara M, Nakao R, Mulenga E, Harima H, Hang’ombe BM, Eto Y, Changula K, Mwizabi D, Sawa H, Higashi H, Mweene A, Takada A, Simuunza M, Sugimoto C
  • Journal Title: Pathogens Volume: 9 Pages: 469～469
  • DOI: 10.3390/pathogens9060469
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Comparative Analyses of the Antiviral Activities of IgG and IgA Antibodies to Influenza A Virus M2 Protein (2020)
  • Author(s): Okuya K, Eguchi N, Manzoor R, Yoshida R, Saito S, Suzuki T, Sasaki M, Saito T, Kida Y, Mori-Kajihara A, Miyamoto H, Ichii O, Kajihara M, Higashi H, Takada A.
  • Journal Title: Viruses Volume: 12 Pages: 780～780
  • DOI: 10.3390/v12070780
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Characterization of mammalian orthoreoviruses isolated from faeces of pigs in Zambia (2020)
  • Author(s): Harima H, Sasaki M, Kajihara M, Gonzalez G, Simulundu E, Bwalya EC, Qiu Y, Okuya K, Isono M, Orba Y, Takada A, Hang’ombe BM, Mweene AS, Sawa H
  • Journal Title: Journal of General Virology Volume: 101 Pages: 1027～1036
  • DOI: 10.1099/jgv.0.001476
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Avian Influenza Viruses Detected in Birds in Sub-Saharan Africa: A Systematic Review (2020)
  • Author(s): Kalonda A, Saasa N, Nkhoma P, Kajihara M, Sawa H, Takada A, Simulundu E
  • Journal Title: Viruses Volume: 12 Pages: 993～993
  • DOI: 10.3390/v12090993
  • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
• [Journal Article] A biaryl sulfonamide derivative as a novel inhibitor of filovirus infection (2020)
  • Author(s): Isono M, Furuyama W, Kuroda M, Kondoh T, Igarashi M, Kajihara M, Yoshida R, Manzoor R, Okuya K, Miyamoto H, Feldmann H, Marzi A, Sakaitani M, Nanbo A, Takada A
  • Journal Title: Antiviral Research Volume: 183 Pages: 104932～104932
  • DOI: 10.1016/j.antiviral.2020.104932
  • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
• [Journal Article] Receptor-Mediated Host Cell Preference of a Bat-Derived Filovirus, Lloviu Virus (2020)
  • Author(s): Takadate Y, Manzoor R, Saito T, Kida Y, Maruyama J, Kondoh T, Miyamoto H, Ogawa H, Kajihara M, Igarashi M, Takada A
  • Journal Title: Microorganisms Volume: 8 Pages: 1530～1530
  • DOI: 10.3390/microorganisms8101530
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] アフリカにおけるウイルス探索 (2020)
  • Author(s): 梶原 将大
  • Organizer: 金沢大学グローバルサイエンスキャンパス事業 国際ゼミ
  • Invited
• [Presentation] アフリカでのウイルスハンティング -出血熱ウイルスから未知のウイルスまで- (2020)
  • Author(s): 梶原 将大
  • Organizer: 第19回みちのくウイルス塾
  • Invited
• [Presentation] ボレリア感染症におけるコウモリの生態学的役割に関する研究. (2020)
  • Author(s): 梶原 将大
  • Organizer: “回帰熱を主とした節足動物媒介性感染症に関する総合的対策のための研究” キックオフシンポジウム
  • Invited
• [Book] ザンビアを知るための55章 (2020)
  • Author(s): 島田周平, 大山修一, 荒木茂, 石本雄大, 伊藤千尋, 梅津千恵子, 遠藤貢, 興津妙子, 奥村正裕, 小倉充夫, 梶原将大, 川畑一朗, 姜明江, 児玉谷史朗, 真常仁志, 杉山祐子, 大門碧, 髙田礼人, 高橋基樹, 立山由紀子, ら.
  • Total Pages: 376
  • Publisher: 明石書店
  • ISBN: 9784750350622