2018 Fiscal Year Research-status Report
動物モデルを用いた精神疾患様行動に関与するLINE-1制御分子機構の解明
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18K15520
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| Research Institution | Kumamoto University |
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Principal Investigator |
村田 唯 熊本大学, 大学院生命科学研究部(医), 厚労科研研究員 (10802077)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Keywords | LINE-1 / エピゲノム / DNAメチル化 / 行動解析 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
poly(I:C)投与マウスにおける行動異常に関連するLINE-1サブファミリーを同定するため、成体poly(I:C)投与マウスについて行動解析を行い、その後前頭葉組織を採取した。行動解析では、poly(I:C)投与群における行動異常を特定できた。現在、同一検体脳を用いたLINE-1コピー数を測定し行動スコアと相関するLINE-1サブファミリーを抽出するため、DNAサンプルの準備を進めている。LINE-1コピー数アッセイについては、公開データベースよりマウスLINE-1のコンセンサス配列を入手し、転移活性を保持しているサブファミリー特異的なPCRプライマーを設計することに成功した。作製できたプライマーを用いてPCRを行った産物について、電気泳動およびサンガーシーケンス法によって非特異的な増幅の有無を確認し、作製した複数のプライマーセットから本研究に用いる候補を選出した。
胎生期に転移活性の増大を示すLINE-1の分子メカニズムを同定するため、胎仔poly(I:C)投与マウス脳組織からDNA・RNA精製を行った。時期依存的なLINE-1のエピゲノム動態についてより広範囲に調べるため、当初予定していた解析法を発展させ、次世代シーケンサーを用いたDNAメチル化解析法を樹立中である。樹立でき次第、胎仔poly(I:C)投与マウス脳組織を供し、解析を進める。また、LINE-1関連遺伝子群・分子経路を同定するために用いるRNA sequencing解析においても、ライブラリー作製・解析方法の樹立を確認しており、順次poly(I:C)投与マウスサンプルを用いた解析を進めていく。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
LINE-1サブファミリー特異的な測定アッセイの樹立に成功した上、エピゲノム解析については当初の計画をさらに発展させる実験系の確立を進めている。行動解析が完了し、解析サンプルの準備も整いつつあり、順調に計画が進捗していると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
成体期の行動異常と関連するLINE-1動態を同定していくとともに、現在樹立中のエピゲノム解析、そして発現量解析を通し、胎生期LINE-1活性異常の分子基盤についての解析を推し進める。
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| Causes of Carryover |
予測よりも少ないボリュームで実験が実施できたため。
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[Journal Article] DNA methylation analyses of the candidate genes identified by a methylome-wide association study revealed common epigenetic alterations in schizophrenia and bipolar disorder2018
Author(s)
Sugawara H, Murata Y, Ikegame T, Sawamura R, Shimanaga S, Takeoka Y, Saito T, Ikeda M, Yoshikawa A, Nishimura F, Kawamura Y, Kakiuchi C, Sasaki T, Iwata N, Hashimoto M, Kasai K, Kato T, Bundo M, Iwamoto K
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Journal Title
Psychiatry and Clinical Neurosciences
Volume: 72(4)
Pages: 245-254
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] DNA methylation analyses of the candidate genes identified by a methylome-wide association study revealed common epigenetic alterations in schizophrenia and bipolar disorder2018
Author(s)
Sugawara H, Murata Y, Ikegame T, Sawamura R, Sasaki T, Iwata N, Hashimoto M, Kasai K, Kato T, Bundo M, Iwamoto K
Organizer
31st CINP World congress of neuropsychopharmacology
Int'l Joint Research
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