2019 Fiscal Year Annual Research Report
Genome-wide identification and characterization of circular RNA in resected hepatocellular carcinoma and background liver tissue
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18K16303
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
高見 秀樹 名古屋大学, 医学部附属病院, 病院助教 (40723028)
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2020-03-31
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| Keywords | 肝細胞癌 / circular RNA / non-coding RNA / 予後因子 / バイオマーカー |
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| Outline of Annual Research Achievements |
Non-coding RNAの一種であるmicro RNA(miRNA)は癌の発生や進展への関与が多数報告されているが、近年新たに注目されている「circular RNA(circRNA)」は、このmiRNAを抑制的に制御する。circRNAは癌の発生に重要な役割を果たすさまざまな転写因子にも影響することが知られ、直線状のlong non-coding RNA(lncRNA)と比較して安定した環状構造のため、血液中の癌関連バイオマーカーとしての応用が非常に期待できる。我々はhigh-throughput sequencing (HTS)の手法を用い、肝細胞癌（HCC)で発現するバイオマーカーとして有望な7つのcircRNAを抽出した。(hsa_circ_0041150, hsa_circ_0025624, hsa_circ_0001020, hsa_circ_0028129, hsa_circ_0008558, hsa_circ_0036683, hsa_circ_0058087)これらは非腫瘍部の肝組織と比較してHCCで発現が低下していた。233例のHCC症例でPCRにより、hsa_circ_0041150, hsa_circ_0025624, hsa_circ_0001020, hsa_circ_0008558, hsa_circ_0036683の発現がHCCで有意に低下しており、hsa_circ_0001020, hsa_circ_0036683, hsa_circ_0058087の発現低下はHCCの予後と有意に関連していることが示された。背景の非腫瘍部においては肝炎ウイルスの種類や肝硬変の状況で抽出されたcircRNAの発現に有意差は認められなかった。これら抽出されたcircRNAは根治術後のHCC患者の予後について有望なバイオマーカーとなり得ることが示唆された。
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