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2019 Fiscal Year Annual Research Report

Innovation of genome editing technology as the basis to develop molecular subtype panels of intractable cancer

Research Project

Project/Area Number 18K19575
Research InstitutionTokyo Medical and Dental University

Principal Investigator

田中 真二  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 教授 (30253420)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 島田 周  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 助教 (20609705)
秋山 好光  東京医科歯科大学, 大学院医歯学総合研究科, 講師 (80262187)
Project Period (FY) 2018-06-29 – 2020-03-31
Keywords癌 / 多様性 / ゲノム医療 / ゲノム編集 / 免疫治療 / エキソンスキッピング / 分子サブタイプ分類 / プレシジョンメディシン
Outline of Annual Research Achievements

近年の癌ゲノム研究によって分子サブタイプ分類が進み、ゲノム医療・プレシジョンメディシンへの応用が期待されている。消化器癌においてもARID2変異肝癌、KDM6A/TP53変異膵癌、CDH1/RHOA変異胃癌など難治性サブタイプの存在が明らかになったが、その分子生物学的意義が不明なため治療標的の開発には至っていない。我々はゲノム編集技術を用いてARID2変異ヒト肝癌を解析し、DNA修復異常によってhypermutatorとなることを証明した(J Hepatol 2017)。本研究では、多重ゲノム編集を可能とする新規レンチウイルスベクターの開発を目的とする。癌細胞には多くの遺伝子変異が蓄積しており、多重ゲノム編集技術によって分子サブタイプの解明のみならず、同系マウスがん細胞パネルの構築が可能となり、免疫チェックポイント阻害剤との併用療法など新規治療開発へも応用できる。実臨床を目指したプレシジョンメディシン実装化のブレークスルーとなる挑戦的かつ戦略的研究課題である。
新規多重ゲノム編集ウイルス LentiGuide-multiplex systemを改良し、4遺伝子を標的とするシステムを構築した。高効率ゲノム編集解析を用いて、ARID1A変異癌の分子生物学的、臨床的特性を解明した(Carcinogenesis, in press)。さらにβカテニンをコードするCTNNB1遺伝子のイントロン2とイントロン3を同時に2重ゲノム編集し、GSK3βリン酸化領域を含むエキソン3をスキッピングした変異株を作成した結果、βカテニンシグナル増強による抗免疫作用を新たに見出し、計画以上の成果が得られている。我々は臨床検体解析にてβカテニン変異癌がcold tumorを呈することを明らかにしており(EBioMedicine 2019)、新たな治療標的の同定により免疫複合療法を開発する重要な基盤となる。

Remarks

分子腫瘍医学研究室ホームページ
http://www.tmd.ac.jp/grad/monc/

  • Research Products

    (22 results)

All 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 2 results) Presentation (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Brown University/MD Anderson Cancer Center(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Brown University/MD Anderson Cancer Center
  • [Int'l Joint Research] Institut Cochin INSERM(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      Institut Cochin INSERM
  • [Int'l Joint Research] Peking University(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      Peking University
  • [Int'l Joint Research] Seoul National University/Korea Res Inst Biosci Biotech/Seoul ASAN Medical Center(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      Seoul National University/Korea Res Inst Biosci Biotech/Seoul ASAN Medical Center
  • [Journal Article] Reticular pattern around SMA in CT imaging predicting poor prognosis of pancreatic head cancer.2020

    • Author(s)
      Kato T, Ban D, Tateishi U, Ogura T, Ogawa K, Ono H, Mitsunori Y, Kudo A, Tanaka S, Tanabe M.
    • Journal Title

      Journal of Hepato-Biliary-Pancreatic Sciences

      Volume: 27 Pages: 114-123

    • DOI

      10.1002/jhbp.700

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Position of the pancreas division line and postoperative outcomes after distal pancreatectomy.2020

    • Author(s)
      Matsui S, Ogura T, Ban D, Ogawa K, Ono H, Mitsunori Y, Kudo A, Tanaka S, Tanabe M.
    • Journal Title

      World Journal of Surgery, 2020 Apr;44(4):. doi: .

      Volume: 44 Pages: 1244-1251

    • DOI

      10.1007/s00268-019-05305-3

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Combination of weekly streptozocin and oral S-1 treatment for patients of unresectable or metastatic pancreatic neuroendocrine neoplasms.2020

    • Author(s)
      Ono H, Kudo A, Akahoshi K, Ogura T, Ogawa K, Ban D, Tanaka S, Tanabe M.
    • Journal Title

      Journal of Cancer Research and Clinical Oncology

      Volume: 146 Pages: 793-799

    • DOI

      10.1007/s00432-019-03109-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Downregulated pancreas beta cells genes decide poor prognosis in patients with pancreatic neuroendocrine neoplasms.2020

    • Author(s)
      Kudo A, Akahoshi K, Ito S, Akashi T, Shimada S, Ogura T, Ogawa K, Ono H, Mitsunori Y, Ban D, Tateishi U, Tanaka S, Tanabe M.
    • Journal Title

      Annals of Surgery

      Volume: 271 Pages: 732-739

    • DOI

      10.1097/SLA.0000000000002911

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Classification of primary liver cancer with immunosuppression mechanisms and correlation with genomic alterations.2020

    • Author(s)
      Fujita M, Yamaguchi R, Hasegawa T, Shimada S, Arihiro K, Hayashi S, Maejima K, Nakano K, Fujimoto A, Ono A, Aikata H, Ueno M, Hayami S, Tanaka H, Miyano S, Yamaue H, Chayama K, Kakimi K, Tanaka S, Imoto S, Nakagawa H.
    • Journal Title

      EBioMedicine

      Volume: 53 Pages: 102659

    • DOI

      10.1016/j.ebiom.2020.102659

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Loss of ARID1A induces a stemness gene ALDH1A1 expression with histone acetylation in the malignant subtype of cholangiocarcinoma.2020

    • Author(s)
      Yoshino J, Akiyama Y, Shimada S, Ogura T, Ogawa K, Ono H, Mitsunori Y, Ban D, Kudo A, Yamaoka S, Tanabe M, Tanaka S.
    • Journal Title

      Carcinogenesis

      Volume: - Pages: in press

    • DOI

      10.1093/carcin/bgz179

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A new era for understanding genetic evolution of multistep carcinogenesis.2019

    • Author(s)
      Shimada S, Tanaka S.
    • Journal Title

      Journal of Gastroenterology

      Volume: 54 Pages: 667-668

    • DOI

      10.1007/s00535-019-01576-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Orotate phosphoribosyltransferase as a predictor of benefit from S-1 adjuvant chemotherapy for cholangiocarcinoma patients.2019

    • Author(s)
      Akahoshi K, Ban D, Kuboki R, Oba A, Ono H, Mitsunori Y, Kudo A, Tanaka S, Tanabe M.
    • Journal Title

      Journal of Gastroenterology and Hepatology

      Volume: 34 Pages: 1108-1115

    • DOI

      10.1111/jgh.14477

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The clinical implications of peripancreatic fluid collection after distal pancreatectomy.2019

    • Author(s)
      Yoshino J, Ban D, Ogura T, Ogawa K, Ono H, Mitsunori Y, Kudo A, Tanaka S, Tanabe M.
    • Journal Title

      World Journal of Surgery

      Volume: 43 Pages: 2069-2076

    • DOI

      10.1007/s00268-019-05009-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Does sunitinib have a patient-specific dose without diminishing its antitumor effect on advanced pancreatic neuroendocrine neoplasms?2019

    • Author(s)
      Matsui S, Kudo A, Ogura T, Ogawa K, Ono H, Mitsunori Y, Ban D, Tanaka S, Tanabe M.
    • Journal Title

      Journal of Cancer Research and Clinical Oncology

      Volume: 145 Pages: 2097-2104

    • DOI

      10.1007/s00432-019-02947-7

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A simple and practical index predicting the prognoses of the patients with well-differentiated pancreatic neuroendocrine neoplasms.2019

    • Author(s)
      Liu B, Kudo A, Kinowaki Y, Ogura T, Ogawa K, Ono H, Mitsunori Y, Ban D, Tanaka S, Akashi T, Tanabe M.
    • Journal Title

      Journal of Gastroenterology

      Volume: 54 Pages: 819-828

    • DOI

      10.1007/s00535-019-01570-0

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] E-cad-Fc-matrix enhances cancer stem-like properties and induces mesenchymal features in colon cancer cells.2019

    • Author(s)
      Qian Y, Wu X, Yokoyama Y, Okuzaki D, Taguchi M, Hirose H, Wang J, Hata T, Inoue A, Hiraki M, Ohtsuka M, Takahashi H, Haraguchi N, Mizushima T, Tanaka S, Mori M, Yamamoto H.
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 110 Pages: 3520-3532

    • DOI

      10.1111/cas.14193

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Upregulation of cancer-associated gene expression in activated fibroblasts in a mouse model of non-alcoholic steatohepatitis.2019

    • Author(s)
      Asakwawa M, Itoh M, Suganami T, Sakai T, Kanai S, Shirakawa I, Yuan X, Hatayama T, Shimada S, Akiyama Y, Fujiu K, Inagaki Y, Manabe I, Yamaoka S, Yamada T, Tanaka S, Ogawa Y.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 9 Pages: 19601

    • DOI

      10.1038/s41598-019-56039-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 外科臨床に基づいた癌多様性の解明と治療開発(特別企画:指定講演)2019

    • Author(s)
      田中真二
    • Organizer
      第119回日本外科学会定期学術集会
    • Invited
  • [Presentation] ゲノム医療・ゲノム編集時代におけるプレシジョン免疫複合療法WS-25-6(ワークショップ:基調講演)2019

    • Author(s)
      田中真二、島田周、秋山好光、大庭篤志、渡辺秀一、奥野圭祐、水野裕貴、上田浩樹、吉野潤、菅原了子、小倉俊郎、小川康介、光法雄介、小野宏晃、伴大輔、工藤篤、大久保憲一、小嶋一幸、絹笠祐介、田邉稔
    • Organizer
      第119回日本外科学会定期学術集会
    • Invited
  • [Presentation] Novel genetic and immunological classification of hepatocellular carcinoma for the subtype-specific precision immunotherapy (International Symposium)2019

    • Author(s)
      Shinji Tanaka, Shuichi Watanabe, Minoru Tanabe
    • Organizer
      The 17th Annual Meeting of the Japanese Society of Gastroenterological Surgery
    • Int'l Joint Research
  • [Book] 実験医学増刊「新・腫瘍免疫学」免疫療法のリバーストランスレーショナル研究ー消化器がん(肝・胆・膵がん)2019

    • Author(s)
      島田周、田中真二
    • Total Pages
      8/270
    • Publisher
      羊土社
    • ISBN
      978-4-7581-0381-7
  • [Remarks] ARID1A欠失は胆管癌の悪性化を促し、ヒストン修飾を介して幹細胞遺伝子の発現亢進に働く

    • URL

      http://www.tmd.ac.jp/archive-tmdu/kouhou/20191106_1.pdf

URL: 

Published: 2021-01-27  

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