2019 Fiscal Year Research-status Report
Extensive characterization of domestication-related genes in buckwheat by utilizing the genetic resource of Yunnan province, China
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18KK0172
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
安井 康夫 京都大学, 農学研究科, 助教 (70293917)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
水野 信之 京都大学, 農学研究科, 特定研究員 (30829180)
FAWCETT JEFFREY 国立研究開発法人理化学研究所, 数理創造プログラム, 上級研究員 (50727394)
大迫 敬義 京都府立大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (80363969)
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| Project Period (FY) |
2018-10-09 – 2021-03-31
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| Keywords | 栽培ソバ / 野生ソバ / 雲南省 / ソバの起原 / 栽培化 / 栽培化関連遺伝子 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
【研究の目的】
野生ソバ（Fagopyrum esculentum ssp. ancestrale）は雲南省を中心とする中国南部にのみ自生し、栽培ソバ（F. esculentumssp. esculentum）と交配可能な重要な植物遺伝資源である。しかし世界のどこにも野生ソバ遺伝資源は構築されておらず、中国の急速な発展とともにその遺伝資源は失われようとしている。そこで本研究では共同研究先の雲南農業大学（YAU）において野生ソバを中心としたソバ遺伝資源の維持管理システムを構築する。また、遺伝資源に含まれる野生お
よび栽培ソバの全ゲノム配列決定から、ソバの栽培化に関与した育種上重要な遺伝子群を網羅的に同定し、最終的にソバの栽培化プロセスを解明する。このような学術的かつ応用的にもインパクトの高い成果を挙げることにより、YAUでのソバ遺伝資源研究の拠点形成と強化を図る。
【本年度の成果】
本年度はYAUにおいて、①栽培ソバと野生ソバのF2作成、②既存遺伝資源の確認と栽培実験、③栽培および野生ソバのDNA抽出とNGS解析を実施した。これらの実験はすべてYAUの学生とスタッフと共に実施し、YAUにおけるソバ研究拠点の基盤を確立できた。また、日本から３名、YAUから１名、およびケンブリッジ大学（イギリス）から１名の研究者からなる野生ソバ調査隊を組織し、雲南省の野生ソバおよびその他のFagopyrum属植物の探索を行った。さらに京都府立大学の学内競争的資金を利用することにより、YAUから２人のスタッフを日本に招き、京都府立大学で合同セミナーを実施した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
YAUでの分子実験と交配実験を実施し、予定通りの成果を上げることができた。NGSによる野生種のデータ取得もほぼ終了し、順調である。また、３カ国の共同調査隊では、野生ソバ以外のFagopyrum属植物の収集にも成功した。収集植物の中でも、自殖性を有する野生ソバ (f. homotropicum) は今後の遺伝子育種学的研究の重要な材料となる。さらに中国雲南省の現地での学術交流のみでなく、京都府立大学へYAUのスタッフを招聘することもでき、二国間での研究者の連携をさらに深化させることができた。また、ケンブリッジ大学との交流も実施しており、満足できる成果を残すことができたと考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
本年度は栽培および野生ソバのNGS解析を実施し、さらにF2の表現型解析と遺伝子型解析を実施する。また、本年度も中国での野生ソバ調査を実施し、遺伝資源の拡充を行う。
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| Causes of Carryover |
2020年2月に次年度のNGS解析を実施する予定であったが、コロナウイルスのパンデミックにより雲南農業大学での実施が不可能であった。現在、YAUのスタッフとインターネットやWechatで連絡が取れており、本年度に予定通りにNGS解析の実施が可能であることを確認している。
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Research Products
(8 results)
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[Presentation] ソバ属植物におけるゲノムの進化2019
Author(s)
FAWCETT Jeffrey, 上野まりこ, 大澤良, 大田竜也, 齊藤大樹, 齊藤大樹, 白澤健太, 竹島亮馬, 中崎鉄也, 西村和紗, 原尚資, 原尚資, 平川英樹, 松井勝弘, 水野信之, 安井康夫
Organizer
日本遺伝学会
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[Presentation] ソバにおける異型花型自家不和合性遺伝子座のゲノム解析2019
Author(s)
大田竜也, 相井城太郎, 上野まりこ, 大澤良, 齊藤大樹, 齊藤大樹, 白澤健太, 竹島亮馬, 中崎鉄也, 西村和紗, 原尚資, 原尚資, 平川英樹, FAWCETT J, 松井勝弘, 水野信之, 安井康夫
Organizer
日本育種学会
