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2020 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of the process of membrane protein insrtion and folding.

Research Project

Project/Area Number 18KK0197
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

塚崎 智也  奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (80436716)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 塩田 拓也  宮崎大学, キャリアマネジメント推進機構, 准教授 (20819304)
西山 賢一  岩手大学, 農学部, 教授 (80291334)
Project Period (FY) 2018-10-09 – 2021-03-31
Keywordsタンパク質 / 輸送
Outline of Annual Research Achievements

本研究では病原性大腸菌等の細菌の膜タンパク質形成過程を解明すべく研究を進めた。大腸菌内膜へのタンパク質膜挿入には糖脂質MPIaseと膜タンパク質 YidCが重要な役割を担う。これまでに開発した再構成系を用いて、タンパク質の膜挿入だけでなく、フォールディング、さらには高次複合体形成過程について、F0F1-ATPaseのcサブユニット(F0c)を基質に用いて解析を進めた。F0cは糖脂質MPIaseとYidCに依存して膜挿入した後、YidCと膜シャペロンUncIの作用により11量体の形成が観察され、これらの過程を試験管内で完全再構成することに成功した。大腸菌の外膜へのタンパク質挿入にはBAM複合体が関わる。In vivoでのBAM複合体の構造機能解析を行うべく、過去の論文に基づき純化したサンプルを得ることに成功した。共同研究により膜挿入中間体を電子顕微鏡観察でとらえるべく研究を行った。また、前年度までに見出した外膜タンパク質に広く存在する新規シグナルがアセンブリーにどのように寄与するかを調べるため、輸送装置であるBAM複合体と、シグナル変異体の相互作用について解析してきた。2020年3月にJ-parcにおいて、国際共同研究者を招聘し共同で実施した中性子反射律法の測定結果の解析を行った。その結果、シグナル変異体はアセンブリーが完遂されず、BAM複合体に詰まった状態を取ることを明らかにした。現在、これらの結果を投稿すべく準備を進めている。

  • Research Products

    (16 results)

All 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Int'l Joint Research] モナッシュ大学(Shen研究室, Lithgow研究室)(オーストラリア)

    • Country Name
      AUSTRALIA
    • Counterpart Institution
      モナッシュ大学(Shen研究室, Lithgow研究室)
  • [Journal Article] Substrate-dependent arrangements of the subunits of the BAM complex determined by neutron reflectometry2021

    • Author(s)
      Chen Xiaoyu、Ding Yue、Bamert Rebecca S.、Le Brun Anton P.、Duff Anthony P.、Wu Chun-Ming、Hsu Hsien-Yi、Shiota Takuya、Lithgow Trevor、Shen Hsin-Hui
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes

      Volume: ー Pages: ー

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2021.183587

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Ring assembly of c subunits of F0F1‐ATP synthase in Propionigenium modestum requires YidC and UncI following MPIase‐dependent membrane insertion2021

    • Author(s)
      Nishikawa Hanako、Kanno Kotoka、Endo Yuta、Nishiyama Ken‐ichi
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 595 Pages: 647~654

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14036

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Crystal structure of a YeeE/YedE family protein engaged in thiosulfate uptake2020

    • Author(s)
      Tanaka Yoshiki、Yoshikaie Kunihito、Takeuchi Azusa、Ichikawa Muneyoshi、Mori Tomoyuki、Uchino Sayaka、Sugano Yasunori、Hakoshima Toshio、Takagi Hiroshi、Nonaka Gen、Tsukazaki Tomoya
    • Journal Title

      Science Advances

      Volume: 6 Pages: eaba7637

    • DOI

      10.1126/sciadv.aba7637

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Reversible autoinhibitory regulation ofEscherichia colimetallopeptidase BepA for selective β-barrel protein degradation2020

    • Author(s)
      Daimon Yasushi、Narita Shin-ichiro、Miyazaki Ryoji、Hizukuri Yohei、Mori Hiroyuki、Tanaka Yoshiki、Tsukazaki Tomoya、Akiyama Yoshinori
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 117 Pages: 27989~27996

    • DOI

      10.1073/pnas.2010301117

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 構造解析からみえてきたタンパク質膜透過駆動モーター膜タンパク質SecDFの仕組み2020

    • Author(s)
      塚崎 智也
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 92 Pages: 717~721

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2020.920717

  • [Journal Article] Characterization of BamA reconstituted into a solid-supported lipid bilayer as a platform for measuring dynamics during substrate protein assembly into the membrane2020

    • Author(s)
      Ding Yue、Shiota Takuya、Le Brun Anton P.、Dunstan Rhys A.、Wang Bo、Hsu Hsien-Yi、Lithgow Trevor、Shen Hsin-Hui
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes

      Volume: 1862 Pages: 183317~183317

    • DOI

      10.1016/j.bbamem.2020.183317

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Biosynthesis of glycolipid MPIase (membrane protein integrase) is independent of the genes for ECA (enterobacterial common antigen)2020

    • Author(s)
      Kamemoto Yuki、Funaba Nanaka、Kawakami Mayu、Sawasato Katsuhiro、Kanno Kotoka、Suzuki Sonomi、Nishikawa Hanako、Sato Ryo、Nishiyama Ken-ichi
    • Journal Title

      The Journal of General and Applied Microbiology

      Volume: 66 Pages: 169~174

    • DOI

      10.2323/jgam.2019.05.001

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] In vitro Assay for Bacterial Membrane Protein Integration into Proteoliposomes2020

    • Author(s)
      Nishikawa Hanako、Sasaki Masaru、Nishiyama Ken-ichi
    • Journal Title

      BIO-PROTOCOL

      Volume: 10 Pages: e3626

    • DOI

      10.21769/BioProtoc.3626

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 高速原子間顕微鏡による膜輸送装置Secの動態観察2021

    • Author(s)
      長池航,板家成良,春山隆充,塚﨑智也,内橋貴之
    • Organizer
      令和2年度中部支部講演会および総会
  • [Presentation] 高速原子間力顕微鏡によるタンパク質膜輸送装置Secの動態観察2020

    • Author(s)
      長池航,板家成良,春山隆充,塚崎智也,内橋貴之
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第46回討論会
  • [Presentation] Observation of Substrate Binding Sec Translocon and Structural Change of SecA with HS-AFM2020

    • Author(s)
      長池航,春山隆充,塚崎智也,内橋貴之
    • Organizer
      The 58th Annual Meeting of the BSJ
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] タンパク質膜挿入・膜透過に必須の糖脂質MPIaseの構造と機能2020

    • Author(s)
      西山賢一
    • Organizer
      2020年度東北支部シンポジウム「いまホットな脂質研究」
    • Invited
  • [Book] 膜タンパク質工学ハンドブック2020

    • Author(s)
      浜窪隆雄, 津本浩平
    • Total Pages
      538(307-315)
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
  • [Remarks] 奈良先端大 構造生命科学 研究業績

    • URL

      https://bsw3.naist.jp/tsukazaki/publication.html

  • [Remarks] 岩手大学 農学部 西山賢一研究室

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~sec/

URL: 

Published: 2021-12-27  

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