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2008 Fiscal Year Annual Research Report

生体情報伝達連鎖機構の単分子力学解析と計算機モデリング

Research Project

Project/Area Number 19GS0418
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

猪飼 篤  Tokyo Institute of Technology, イノベーション研究推進体, 特任教授 (50011713)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岸本 喜久雄  東京工業大学, 大学院・理工学研究科, 教授 (30111652)
長田 俊哉  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (00201997)
大谷 弘之  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (80203826)
REHANA Afrin  東京工業大学, バイオフロンティアセンター, 特任准教授 (70447556)
関口 博史  東京工業大学, 大学院・理生命工学研究科, 助教 (00401563)
Keywords生体情報伝達 / 膜タンパク質 / 細胞骨格 / リンカータンパク質 / ナノ力学 / アクチン繊維 / 原子間力顕微鏡(AFM) / 力学的分光法
Research Abstract

1.ヒト赤血球の脂質膜をリン脂質分解酵素および界面活性剤を用いて除去した後の細胞骨格について、その構造上異なる部位と特異的親和力のあるリガンドを原子間力顕微鏡(AFM)探針に固定したうえで力学的測定を行った。その結果、スペクトリンとアクチンからなる細胞骨格の局所的力学特性を明らかにすることができた。この結果を、ネットワークモデルによって説明する計算機シミュレーションを行った。
2.固体培地での繊維芽細胞の培養中に、その細胞表面にフィブロネクチンで被覆したガラスビーズを載せ、その後、細胞膜を通してガラスビーズの周囲に集まるアクチン繊維による細胞表面の固化とガラスビーズの細胞表面への接着力の増大を接着時間の関数として測定した。ガラスビーズ周囲に集まるアクチン繊維が細胞内にすでに存在する細胞骨格といつ結合するのか、あるいはしないのかを現在追求している。
3.細胞内のアクチン繊維の強度を、AFMの探針により繊維を引張って切る際の破断力測定から見積もった。この実験はアクチン繊維を横方向に引張った場合と縦方向に引張った場合について行い、両者の測定値の違いを細胞内構造との関係から検討した。
4.細胞骨格を形成するスペクトリン、アクチン、ビンキュリン等、多くのタンパク質がαヘリックス構造をとっているので、これらのタンパク質の変形力学を基盤とする本研究ではαヘリックス構造の力学物性が重要である。このことから、人工のαヘリックス構造を持つポリペプチドについての延伸力学を解析し、エネルギー散逸過程を検討した。
5.アクチンとビンキュリンの相互作用をフォース・スペクトロスコピーとして測定した。

  • Research Products

    (19 results)

All 2009 2008 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (12 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Tensile Mechanics of Alanine Based Helical Polypeptide: Force Spectroscopy vs. Computer Simulations2009

    • Author(s)
      Rehana Afrin
    • Journal Title

      Biophys. J. 96

      Pages: 1105-1114

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      猪飼篤
    • Journal Title

      走査型プローブ顕微鏡(共立出版)

      Pages: 123-131

  • [Journal Article] Nanobiomechanics of proteins and biomembrane2008

    • Author(s)
      Atsushi Ikai
    • Journal Title

      Phil. Trans. R. Soc. B 363

      Pages: 2163-2171

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Exploring Transferrin-Receptor Interactions at the Single-Molecule Level2008

    • Author(s)
      Alexandre Yersin
    • Journal Title

      Biophys. J. 94

      Pages: 230-240

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Distribution of olfactory marker protein on a tissue section of vomeronasal organ measured by AFM2008

    • Author(s)
      Hyonchol Kim
    • Journal Title

      Colloids and Surfaces B: Biointerfaces 61

      Pages: 311-314

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 原子間力顕微鏡を用いたヒト赤血球細胞骨格の力学的測定2009

    • Author(s)
      町田真一
    • Organizer
      第56回応用物理学関係連合講演会
    • Place of Presentation
      つくば市
    • Year and Date
      2009-03-31
  • [Presentation] Subunit Unbinding Mechanics of a Dimeric Protein Studied By Atomic force Microscopy2008

    • Author(s)
      Rehana Afrin
    • Organizer
      JPK 7th annual symposium on SPM for the Life Sciences
    • Place of Presentation
      Berlinドイツ
    • Year and Date
      20081208-20081209
  • [Presentation] Lateral force measurement by AFM and applications in cell biology2008

    • Author(s)
      Tomoro Hakari
    • Organizer
      JPK 7th annual symposium on SPM for the Life Sciences
    • Place of Presentation
      Berlinドイツ
    • Year and Date
      20081208-20081209
  • [Presentation] Nano-indentation of Single Protein Investigated by Atomic Force Microscopy2008

    • Author(s)
      Hiroshi Sekiguchi
    • Organizer
      Protein Research International Symposium on "New Approaches to Complexity of Protein Dynamics by Single Molecule Measurements: Experiments and Theories
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      20081207-20081209
  • [Presentation] Applications of AFM Force Measurement for Life-science Field2008

    • Author(s)
      Hiroshi Sekiguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会第46会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20081203-20081205
  • [Presentation] 細胞-細胞外マトリックス結合力のAFMを用いた解析2008

    • Author(s)
      中山隆宏
    • Organizer
      日本生物物理学会第46回年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      20081203-20081205
  • [Presentation] AFM力学測定の生命科学への応用:精度良い測定に向けて2008

    • Author(s)
      関口博史
    • Organizer
      第28回表面科学学術講演会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20081113-20081115
  • [Presentation] 細胞接着に付随する細胞骨格の再構築に関するAFMによる力学解析2008

    • Author(s)
      中山隆宏
    • Organizer
      第28回表面科学学術講演会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20081113-20081115
  • [Presentation] Cellular Level Manipulation by Atomic Force Microscopy2008

    • Author(s)
      Rehana Afrin
    • Organizer
      International Meeting on AFM in Life Sciences and Medicine (AFM BioMed 2008)
    • Place of Presentation
      Monterey米国
    • Year and Date
      20081015-20081018
  • [Presentation] Subunit Unbinding Mechanics of a Dimeric Protein Studied By Atomic force Microscopy2008

    • Author(s)
      Rehana Afrin
    • Organizer
      International Conference on Nanoscience and Technology
    • Place of Presentation
      Denver米国
    • Year and Date
      20080720-20080725
  • [Presentation] High sensitive detection of proteins using gel electrophoresis and atomic force microscopy2008

    • Author(s)
      Hiroshi Sekiguchi
    • Organizer
      10th International Scanning Probe Microscopy Conference
    • Place of Presentation
      Seattle米国
    • Year and Date
      20080622-20080624
  • [Presentation] AFMによるタンパク質分子の圧縮:実験とシミュレーション2008

    • Author(s)
      関口博史
    • Organizer
      日本顕微鏡学会第64回学術講演会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20080521-20080523
  • [Book] タンパク質の事典2008

    • Author(s)
      猪飼篤(編集委員長)
    • Total Pages
      863
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ikai.bio.titech.ac.jp/index.php?FrontPage

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Published: 2010-06-11   Modified: 2016-04-21  

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