• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2022 Fiscal Year Annual Research Report

Antibodies targeting dynamic epitopes generated by posttranslational protein glycosylation

Research Project

Project/Area Number 19H00918
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

西村 紳一郎  北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (00183898)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田中 良和  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (20374225)
比能 洋  北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (70333333)
尾瀬 農之  北海道大学, 先端生命科学研究院, 教授 (80380525)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
KeywordsDynamic epitope theory / Glycopeptidic epitope / Epitope defined antibody / Anti-MUC1 mAb / がん治療用抗体 / X線結晶構造解析 / 機能改変抗体 / 二重特異性抗体
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題は、申請者らが提唱する独創的な「動的エピトープを標的とする新薬開発」という発想と、既にその基盤が完成しており効率的でシームレスな抗体開発までを可能とする実践的な「糖鎖工学プラットフォームを活用する戦略」によって創出されたED抗体(epitope-defined antibody)を用いて、主としてがん領域におけるアンメットメディカルニーズに応え得る新たながん治療薬の開発を目的としている。本研究課題においては、このコンセプトをさらに感染症治療用新規抗体の作成を含めた実証実験までを全期間での到達目標としている。
すでに、多くのがん細胞表面に高発現してがんの増殖や転移の促進などに深く関与することが広く知られるムチンMUC1の細胞外タンデムリピートドメインに生成する多様な動的エピトープ(dynamic epitope)を特異的な標的とするED抗体である抗MUC1モノクローナル抗体の構造改変と低分子化によって高機能化することで標的指向型DDSを実現する新たな創薬モダリティーの創出に成功している。
2022年度は、新型コロナウィルス膜スパイクタンパク質の糖鎖修飾されたN343を含む動的エピトープを認識して強く結合する新しい抗体クローンを複数取得した。それらの中で2つの抗体SN-343aとSN-343bはデルタ株に加えてオミクロン株BA2.75とXBBを含む最新の変異株に対してもナノモル/リットルの強い結合親和性を示すことが明らかになった。
また、研究分担者のチームにおいても、各々の研究計画がほぼ予定通り実施された。

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (23 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 9 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results) Book (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Universidad de La Rioja(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      Universidad de La Rioja
  • [Int'l Joint Research] Ludwig-Maximilians-University Munich(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      Ludwig-Maximilians-University Munich
  • [Journal Article] Quick and Spontaneous Transformation between [3Fe-4S] and [4Fe-4S] Iron-Sulfur Clusters in the tRNA-Thiolation Enzyme TtuA2023

    • Author(s)
      Ishizaka Masato、Chen Minghao、Narai Shun、Tanaka Yoshikazu、Ose Toyoyuki、Horitani Masaki、Yao Min
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 24 Pages: 833~833

    • DOI

      10.3390/ijms24010833

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Altering the Modular Architecture of Galectins Affects its Binding with Synthetic α‐Dystroglycan O‐Mannosylated Core M1 Glycoconjugates In situ2023

    • Author(s)
      Villones Lareno L.、Ludwig Anna-Kristin、Kikuchi Seiya、Ochi Rika、Nishimura Shin-Ichiro、Gabius Hans-Joachim、Kaltner Herbert、Hinou Hiroshi
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1002/cbic.202200783

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Clinical utility of a serum glycome analysis in patients with colorectal cancer2022

    • Author(s)
      Takei Daisuke、Harada Keita、Nouso Kazuhiro、Miyahara Koji、Dohi Chihiro、Matsushita Hiroshi、Kinugasa Hideaki、Hiraoka Sakiko、Nishimura Shin‐Ichiro、Okada Hiroyuki
    • Journal Title

      Journal of Gastroenterology and Hepatology

      Volume: 37 Pages: 727~733

    • DOI

      10.1111/jgh.15781

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective reaction monitoring approach using structure-defined synthetic glycopeptides for validating glycopeptide biomarkers pre-determined by bottom-up glycoproteomics2022

    • Author(s)
      Shiratori Kouta、Yokoi Yasuhiro、Wakui Hajime、Hirane Nozomi、Otaki Michiru、Hinou Hiroshi、Yoneyama Tohru、Hatakeyama Shingo、Kimura Satoshi、Ohyama Chikara、Nishimura Shin-Ichiro
    • Journal Title

      RSC Advances

      Volume: 12 Pages: 21385~21393

    • DOI

      10.1039/D2RA02903K

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Generation 6 Polyamidoamine Dendrimer Provides an Ideal Nanoparticular Platform for Enzyme-assisted Synthesis of Glycopeptides Having Bulky and Complex Glycans2022

    • Author(s)
      Matsushita Takahiko、Hinou Hiroshi、Nishimura Shin-Ichiro
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 51 Pages: 1044~1048

    • DOI

      10.1246/cl.220344

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mouse tissue glycome atlas 2022 highlights inter-organ variation in major N-glycan profiles2022

    • Author(s)
      Otaki Michiru、Hirane Nozomi、Natsume-Kitatani Yayoi、Nogami Itoh Mari、Shindo Masanori、Kurebayashi Yoichi、Nishimura Shin-Ichiro
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 17804

    • DOI

      10.1038/s41598-022-21758-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Exploring the In situ pairing of human galectins toward synthetic O-mannosylated core M1 glycopeptides of α-dystroglycan2022

    • Author(s)
      Villones Lareno L.、Ludwig Anna-Kristin、Kumeta Hiroyuki、Kikuchi Seiya、Ochi Rika、Aizawa Tomoyasu、Nishimura Shin-Ichiro、Gabius Hans-Joachim、Hinou Hiroshi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Pages: 17800

    • DOI

      10.1038/s41598-022-22758-0

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] BOA/DHB/Na: An Efficient UV-MALDI Matrix for High-Sensitivity and Auto-Tagging Glycomics2022

    • Author(s)
      Barada Erina、Hinou Hiroshi
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 23 Pages: 12510~12510

    • DOI

      10.3390/ijms232012510

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Direct MALDI Glycotyping of Glycoproteins toward Practical Subtyping of Biological Samples2022

    • Author(s)
      Urakami Shogo、Hinou Hiroshi
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 7 Pages: 39280~39286

    • DOI

      10.1021/acsomega.2c05429

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An ancestral function of strigolactones as symbiotic rhizosphere signals2022

    • Author(s)
      Kodama Kyoichi、Rich Mlanie K.、Xie Xiaonan、Akiyama Kohki、Mizuno Yohei、Komatsu Aino、Luo Yi、Suzuki Hidemasa、Kameoka Hiromu、Libourel Cyril、Keller Jean、Sakakibara Keiko、Tanaka Yoshikazu、Delaux Pierre-Marc、Nomura Takahito、Kyozuka Junko
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 3974

    • DOI

      10.1038/s41467-022-31708-3

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Functional Characterization of 12 Dihydropyrimidinase Allelic Variants in Japanese Individuals for the Prediction of 5-Fluorouracil Treatment-Related Toxicity2022

    • Author(s)
      Hishinuma Eiji、Narita Yoko、Rico Evelyn Marie Gutierrez、Ueda Akiko、Obuchi Kai、Tanaka Yoshikazu、Saito Sakae、Tadaka Shu、Kinoshita Kengo、Maekawa Masamitsu、Mano Nariyasu、Nakayoshi Tomoki、Oda Akifumi、Hirasawa Noriyasu、Hiratsuka Masahiro
    • Journal Title

      Drug Metabolism and Disposition

      Volume: 51 Pages: 165~173

    • DOI

      10.1124/dmd.122.001045

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A marine sponge-derived lectin reveals hidden pathway for thrombopoietin receptor activation2022

    • Author(s)
      Watari Hiromi、Kageyama Hiromu、Masubuchi Nami、Nakajima Hiroya、Onodera Kako、Focia Pamela J.、Oshiro Takumi、Matsui Takashi、Kodera Yoshio、Ogawa Tomohisa、Yokoyama Takeshi、Hirayama Makoto、Hori Kanji、Freymann Douglas M.、Imai Misa、Komatsu Norio、Araki Marito、Tanaka Yoshikazu、Sakai Ryuichi
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Pages: 7262

    • DOI

      10.1038/s41467-022-34921-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Glycotyping: Old and New Concept of Glycoscience2023

    • Author(s)
      比能洋
    • Organizer
      108th Indian Science Congress
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] エクソソームのユニークな構造と機能に学ぶ新しい創薬研究への展開2023

    • Author(s)
      西村紳一郎
    • Organizer
      官民研究開発投資拡大プログラム(PRISM)「新薬創出を加速する人工知能の開発」令和4年度成果報告会
  • [Presentation] 血中エクソソームの由来臓器を糖鎖解析により推定する基盤技術の開発2022

    • Author(s)
      西村紳一郎
    • Organizer
      官民研究開発投資拡大プログラム(PRISM)「新薬創出を加速する人工知能の開発」令和3年度成果報告会
  • [Presentation] ストップコドンリードスルーの分子機構解明2022

    • Author(s)
      田中良和
    • Organizer
      第22回日本蛋白質科学会年会
  • [Presentation] タンパク質立体構造解析と質量分析の融合研究2022

    • Author(s)
      田中良和
    • Organizer
      日本プロテオーム学会2022年大会
    • Invited
  • [Presentation] 前転移ニッチェを標的とする革新的薬物輸送システムの創製 / Creation of an innovative drug delivery system targeting pre-metastatic niche2022

    • Author(s)
      西村紳一郎
    • Organizer
      第9回日本細胞外小胞学会
    • Invited
  • [Presentation] ヘモリシンの立体構造解析と構造情報を生かしたデザイン2022

    • Author(s)
      田中良和
    • Organizer
      分子ロボティクス研究会
    • Invited
  • [Presentation] MALDI Glycotyping of Glycoproteins, Biofluids, and Bacterial O-antigens2022

    • Author(s)
      比能洋
    • Organizer
      International Congress on Pure and Applied Chemistry (ICPAC) Kota Kinabalu 2022
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] クライオ電子顕微鏡ハンドブック2023

    • Author(s)
      難波 啓一、加藤 貴之、牧野 文信、伴野 詢太,田中 良和,横山 武司
    • Total Pages
      460
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • ISBN
      978-4-86043-804-3

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi