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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of gradient sensing mechanism in chemotactic signaling system

Research Project

Project/Area Number 19H00982
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

上田 昌宏  大阪大学, 大学院生命機能研究科, 教授 (40444517)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2024-03-31
Keywords走化性 / GPCR / 三量体G蛋白質 / アレスチン / 適応 / 細胞性粘菌
Outline of Annual Research Achievements

真核細胞の走化性は,細胞性粘菌からヒト白血球に至るまで,走化性シグナル伝達系の構成分子がよく保存されている.粘菌細胞は走化性のモデル生物であることから,走化性シグナル伝達の仕組みに関する知見が多く得られてきた.粘菌細胞が誘引物資濃度勾配を認識する仕組みとして,二つの分子回路の組み合わせが重要であることがわかってきた.一つは細胞の両端における誘引物資の空間的な濃度差を10の5乗から6乗倍の広い濃度レンジにわたって検出する分子回路(適応-差分検出系)である。もう一つは濃度勾配シグナルをデジタル的な1/0のシグナルに増幅する分子回路(興奮系)である.適応-差分検出系の仕組みについては,GPCR型の誘引物資受容体と三量体G蛋白質,それらの調節分子(Gip1, Ric8, RGS,アレスチン)の細胞内時空間動態を解析することで,3つのメカニズムが働くことが明らかになった。10 nM以下の低濃度領域では,GPCR型走化性受容体,RGSs,非受容体型GEFのRic8による三量体G蛋白質の活性化調節によって,濃度勾配に応じたG蛋白質の活性化反応の勾配が形成される.10-300 nMの中濃度領域では,Gip1による三量体G蛋白質の細胞質-細胞膜間局在調節によって,活性型G蛋白質の濃度勾配シグナルが形成される.100 nM以上の高濃度領域では,活性型G蛋白質と受容体の複合体形成,およびアレスチンによるG蛋白質非依存性シグナル伝達によって濃度勾配シグナルが伝達される.これらの機構により誘引物資の濃度勾配が検出される.こうした知見に加えて,濃度勾配シグナルの増幅に働く興奮系についても新規の知見が得られ,「ダイナミックパーティショニング」と名付けた細胞極性形成機構を提唱した.走化性シグナル伝達系は真核生物で広く保存されていることから,他の細胞種においても同様の制御機構が働く可能性が示唆される.

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (34 results)

All 2024 2023 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 7 results) Presentation (19 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Invited: 2 results) Remarks (5 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ジョンズホプキンス大学/NIH(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      ジョンズホプキンス大学/NIH
  • [Journal Article] Cholesterol suppresses spontaneous activation of EGFR-mediated signal transduction2024

    • Author(s)
      Takayama Miri、Maeda Sakura、Watanabe Daisuke、Takebayashi Kazutoshi、Hiroshima Michio、Ueda Masahiro
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 704 Pages: 149673~149673

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2024.149673

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Left-right Myosin-Is, Myosin1C, and Myosin1D exhibit distinct single molecule behaviors on the plasma membrane of Drosophila macrophages2024

    • Author(s)
      Utsunomiya Sosuke、Takebayashi Kazutoshi、Yamaguchi Asuka、Sasamura Takeshi、Inaki Mikiko、Ueda Masahiro、Matsuno Kenji
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: - Pages: 1-17

    • DOI

      10.1111/gtc.13110

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Spontaneous signal generation by an excitable system for cell migration2024

    • Author(s)
      Matsuoka Satomi、Iwamoto Koji、Shin Da Young、Ueda Masahiro
    • Journal Title

      Frontiers in Cell and Developmental Biology

      Volume: 12 Pages: 1373609

    • DOI

      10.3389/fcell.2024.1373609

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Automated single-molecule imaging for drug discovery2024

    • Author(s)
      Hiroshima Michio、Ueda Masahiro
    • Journal Title

      Proc. SPIE 12853 High-Speed Biomedical Imaging and Spectroscopy IX

      Volume: 12853 Pages: 128530

    • DOI

      10.1117/12.3009718

  • [Journal Article] Sphingomyelin metabolism underlies Ras excitability for efficient cell migration and chemotaxis2023

    • Author(s)
      Shin Da Young、Takagi Hiroaki、Hiroshima Michio、Matsuoka Satomi、Ueda Masahiro
    • Journal Title

      Cell Structure and Function

      Volume: 48 Pages: 145~160

    • DOI

      10.1247/csf.23045

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A dynamic partitioning mechanism polarizes membrane protein distribution2023

    • Author(s)
      Banerjee Tatsat、Matsuoka Satomi、Biswas Debojyoti、Miao Yuchuan、Pal Dhiman Sankar、Kamimura Yoichiro、Ueda Masahiro、Devreotes Peter N.、Iglesias Pablo A.
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Pages: 7909

    • DOI

      10.1038/s41467-023-43615-2

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Single-molecule tracking-based drug screening2023

    • Author(s)
      Watanabe Daisuke、Hiroshima Michio、Ueda Masahiro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2023.11.12.566743

    • Open Access
  • [Journal Article] RasGEFX triggers spontaneous Ras excitation with RasGEFB/M/U for random cell migration2023

    • Author(s)
      Iwamoto Koji、Matsuoka Satomi、Ueda Masahiro
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1101/2023.08.13.553116

    • Open Access
  • [Presentation] RasGEFX は Ras の自発的興奮を誘発し、RasGEFB/M/U とともにランダムな細胞運動を駆動する2024

    • Author(s)
      岩本浩司、松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      生体運動研究2024合同班会議
  • [Presentation] 真核生物の走化性においてβ-arrestinは三量体G蛋白質シグナルに抑制的に働く2024

    • Author(s)
      室本匡希、松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      生体運動研究2024合同班会議
  • [Presentation] Automated single-molecule imaging for drug discovery2024

    • Author(s)
      Michio Hiroshima, Masahiro Ueda
    • Organizer
      SPIE 2024 Photonics West BiOS
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Field model for multistate lateral diffusion of various transmembrane proteins observed in living Dictyostelium cells2023

    • Author(s)
      Kazutoshi Takebayashi, Yoichiro Kamimura, Masahiro Ueda
    • Organizer
      Imaging Cell Dynamics Meeting
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Signal generation by an excitable system for cell migration”, STATPHYS28 Satellite Meeting: Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems,2023

    • Author(s)
      Satomi Matsuoka, Masahiro Ueda
    • Organizer
      STATPHYS28 Satellite Meeting: Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] RasGEFX triggers spontaneous Ras excitation with RasGEFB/M/U for random cell migration2023

    • Author(s)
      Koji Iwamoto, Satomi Matsuoka, Masahiro Ueda
    • Organizer
      Dicty 2023, Annual International Dictyostelium Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Beta-arrestin orchestrates the extension of the concentration ranges in eukaryotic chemotaxis2023

    • Author(s)
      Masaki Muromoto, Satomi Matsuoka, Masahiro Ueda
    • Organizer
      Dicty 2023, Annual International Dictyostelium Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] ield model for multistate lateral diffusion of various transmembrane proteins observed in living cells2023

    • Author(s)
      Kazutoshi Takebayashi, Yoichiro Kamimura, Masahiro Ueda
    • Organizer
      Dicty 2023, Annual International Dictyostelium Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Sphingomyelin metabolism underlies Ras excitability for efficient cell migration and chemotaxis2023

    • Author(s)
      Satomi Matsuoka, Da Young Shin, Masahiro Ueda
    • Organizer
      Dicty 2023, Annual International Dictyostelium Conference
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 1分子動態を指標とした薬剤スクリーニング法の開発2023

    • Author(s)
      渡邉大介、廣島通夫、上田昌宏
    • Organizer
      研究会「理論と実験」2023
  • [Presentation] 真核生物の走化性におけるβ-arrestinの役割2023

    • Author(s)
      室本匡希、松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      第13回日本細胞性粘菌学会例会
  • [Presentation] RasGEFX triggers spontaneous Ras excitation with RasGEFB/M/U for random cell migration2023

    • Author(s)
      岩本浩司、松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      第13回日本細胞性粘菌学会例会
  • [Presentation] The Dictyostelium chemotaxis receptor cAR1 more tightly gathers on the front side of the cell2023

    • Author(s)
      三井敦弘、松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Identification of GAP that suppresses the excitatory Ras in spontaneous cell motility2023

    • Author(s)
      Guangyu Cheng, Satomi Matsuoka, Masahiro Ueda
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] β-arrestin acts as an inhibitor of trimeric G protein signaling in eukaryotic chemotaxis2023

    • Author(s)
      室本匡希、松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] RasGEFX triggers spontaneous Ras excitation with RasGEFB/M/U for random cell migration2023

    • Author(s)
      岩本浩司、松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Single-molecule analysis of EGFR behavior inducing signal transduction in the plasma membrane2023

    • Author(s)
      Michio Hiroshima, Masahiro Ueda
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Phosphatidylserine is an essential regulator of Ras excitability and cell motility2023

    • Author(s)
      Satomi Matsuoka, Da Young Shin, Hyeyun Jung, Hiroaki Takagi, Michio Hiroshima, Masahiro Ueda
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] 細胞運動における興奮系による前後極性の自己組織化2023

    • Author(s)
      松岡里実、上田昌宏
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
  • [Remarks] 大阪大学大学院生命機能研究科1分子生物学研究室

    • URL

      https://www.fbs.osaka-u.ac.jp/ja/research_group/detail/2

  • [Remarks] 大阪大学大学院生命機能研究科1分子生物学研究室

    • URL

      https://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/ueda/

  • [Remarks] 理化学研究所生命機能科学研究センター細胞シグナル動態研究チーム

    • URL

      http://www.qbic.riken.jp/csd/ja/index.html

  • [Remarks] Laboratory for Cell Signaling Dynamics, RIKEN BDR

    • URL

      https://www.bdr.riken.jp/en/research/labs/ueda-m/index.html

  • [Remarks] 命名“Dynamic partitioning” 膜タンパク質が局在化するしくみを解明

    • URL

      https://resou.osaka-u.ac.jp/ja/research/2024/20240110_2

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 受容体型チロシンキナーゼの活性評価方法2024

    • Inventor(s)
      上田昌宏、廣島通夫、渡邉 大介
    • Industrial Property Rights Holder
      上田昌宏、廣島通夫、渡邉 大介
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2024/007599
    • Overseas

URL: 

Published: 2024-12-25  

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