2022 Fiscal Year Annual Research Report
Controlling mechanisms of epigenome by silencing and anti-silencing
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19H00995
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
角谷 徹仁 東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 教授 (20332174)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2023-03-31
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| Keywords | DNAメチル化 / ヒストン修飾 / トランスポゾン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
課題１「遺伝子内抗抑制修飾はどのように制御され、どのように表現型に貢献するか」
抑制修飾に必要な因子の変異体にその因子を相補する系を構築し、CGメチル化酵素の変異体を用いることで、この修飾が抑制/抗抑制の確立に大きく影響することを明らかにしていた（To et al 2020 Nature Plants; To et al 2022 Nature Communications）。さらに、H2A.WとH2A.Zの変異体を用いて、これらが正と負に抑制修飾確立に影響することを明らかにした（Oda et al 未発表）。また、ヒストンH3リジン４の脱メチル化酵素であるLDL2およびFLD（Inagaki et al 2017 EMBO J; Inagaki et al 2021 Nature Plants）に加え、LDL3の標的配列特異性、およびH3リジン４メチル化酵素の局在特異性から、転写がこの修飾を双方向に制御することを見出した（Ishihara et al 2019 Nature Communications; Oya et al 2022 Nature Communications; Mori et al bioRxiv）。
課題２「配列特異的抗抑制因子はどのような機構でゲノムの広範囲に影響するか」
２つのVANC系（Fu et al 2013 EMBO J; Hosaka et al2017 Nat Com）に加え、VANCによる抗抑制の祖先型と思われる系を同定している（Sasaki et al 2022 EMBO J）。AFMと結晶解析によって結合様式を明らかにした。ここから予想されるVANCのDNA結合部位はアミノ酸配列が早い進化をする領域であった（論文準備中）。VANCによる抗抑制が働く領域とRNAiによる抑制とが共通した領域に働くことを示す論文を現在投稿中である（Sasaki et al bioRxiv）。
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| Research Progress Status |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和4年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] DDM1 silences transposons by deposition of the histone variant H2A.W2023
Author(s)
Akihisa Osakabe, Bhagyshree Jamge, Elin Axelsson, Sean A Montgomery, Svetlana Akimcheva, Annika Luisa Kuehn, Rahul Pisupati, Zdravko J Lorkovic, Ramesh Yelagandula, Tetsuji Kakutani, and Frederic Berger
Organizer
International symposium on chromatin architecture: structure and function（オンライン）
Int'l Joint Research
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