2022 Fiscal Year Annual Research Report
Global impact of marine secondary chloroplast estimated from the function of diatom pyrenoid.
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19H01153
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| Research Institution | Kwansei Gakuin University |
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Principal Investigator |
松田 祐介 関西学院大学, 生命環境学部, 教授 (30291975)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
田中 厚子 琉球大学, 理学部, 助教 (40509999)
原田 尚志 鳥取大学, 工学研究科, 准教授 (50640900)
嶋川 銀河 関西学院大学, 生命環境学部, 助教 (60853885)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2024-03-31
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| Keywords | 海洋性珪藻 / 二次葉緑体 / ピレノイド / 一次生産 / 光合成 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
海洋性珪藻類の葉緑体ピレノイド構造・機能と地球生態系への影響を定量する分子モデルを羽状目Phaeodactylum tricornutum（Pt）および中心目Thalassiosira pseudonana（Tp）を用いて構築した。
①両珪藻のPyshellに相互作用する因子として6つ程度のタンパク質が質量分析により再現性良く検出された。このうち2つは未知天然変性タンパク質だった。一方、Bestおよびθ型炭酸脱水酵素（CA）の相互作用因子に有意な候補は見いだせていない。葉緑体包膜因子であるι型CAの相互作用タンパク質を新たに探索した結果、6つ程度のタンパク質が再現性良く検出され、このうち1つはやはり天然変性タンパク質であった。光アミノ酸架橋によるピレノイド因子探索では、新奇チャネルタンパクと考えられる因子が見つかった。②新奇チャネルタンパク質はGFPタギングにより葉緑体の一部に局在することが確認された。③CRISPR/Cas9により、TpBest1,2の同時破壊株およびTpPyshellの破壊株を取得した。また、PtBest1およびPtθCA1の破壊株を取得した。PtPyshellの破壊株は現在取得中である。PtθCA1およびTpPyshellの破壊株は、極端に無機炭素への親和性が低い光合成を示し、CCMがほぼ機能しないことが分かった。TpPyshell破壊株は液相分離は維持されるがピレノイドの構造は破壊されていた。PtBest1破壊株も高CO2生育野生株と同レベルの低親和性光合成を示した。④珪藻ピレノイドは中心を貫通するチラコイド膜をもち、Pyshellがその構造を形成する。このチラコイド膜がBestとθCAの働きで、CO2発生装置としてRubiscoにCO2を供給する分子モデルが完成しつつある。⑤Pyshellは世界の海で発現している重要因子であることが分かった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
①二次葉緑体包膜やピレノイドの構成因子から、天然変性タンパク質と考えられる配列が軒並み取得され、その他の発見因子と共にピレノイド構造・機能の分子機構がいよいよ明らかになりつつある。
②θCAの局在や無機炭素輸送体の詳細を原著論文として発表し、さらに新奇チャネルタンパク質を見出し、その局在も決定しつつある。
③ゲノム編集によって、TpPyshellの破壊株とPtθCAの破壊株が共にこれまでに報告例のないほど極端に効率の悪い光合成を行うことが明らかとなった。このことから珪藻のピレノイド構造と機能は現在の何倍か高CO2環境でも必要とされる重要なものであることが強く示唆された。
④相互作用因子の探索が軌道に乗り今後も新たな因子の発見につながる目途が立った。大きな骨格となるPyshell,BestおよびθCAのピレノイド構造・機能維持に関わるモデルはほぼ完成した。
⑤これら重要ピレノイド因子の海洋メタゲノムデータベースでの解析すでに一部行われ、θCAとPyshellは海洋に広く分布して高発現し、高いグルーバルインパクトを持つ重要因子であることが確実となった。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後の実験には、引き続き海洋性珪藻二種、P.tricornutumおよびT.pseudonanaを用いる。研究全体を、引き続き以下のサブプロジェクトに分け遂行する。
①2022年度は改良型近位依存性ビオチン標識法（TurboID法）と質量分析計を用いた葉緑体プロテオミクスが技術的に成熟し、いくつかの重要因子の取得につながった。この標識・分析系を駆使して芋づる式にピレノイド因子のリストを完成させる。
②リストアップされた候補の遺伝子を取得し、この遺伝子に蛍光タンパク質遺伝子或いは蛍光低分子標識用HALOタグ遺伝子等を融合し、細胞内局在の確認を行う。また、透過型電子顕微鏡（TEM）を用いた免疫TEM観察により、リストアップされた因子の局在を順次詳細に決定し、ピレノイドモデル内に位置情報を組み込んでゆく。
③破壊と解析が完了したTpPyshell、PtθCAのデータを査読付き原著論文に順次発表する。その他因子についても破壊株の取得・解析を進め、ピレノイドモデル内に機能情報を組み込んでゆく。
④葉緑体構造・機能・動態モデルを完成し、⑤海洋環境ゲノムデータを用いて、これら因子のグローバル分布を分析、モデルに基づいた機能を分析に挿入してグローバルインパクトの分子レベルでの定量化を行う。
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Research Products
(24 results)
