2019 Fiscal Year Annual Research Report
Contribution of fungoid protists Labyrinthulomycetes to planktonic food webs and biogeochemical cycles in marine ecosystem
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19H03033
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| Research Institution | Ehime University |
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Principal Investigator |
大林 由美子 愛媛大学, 沿岸環境科学研究センター, 助教 (60380284)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
高尾 祥丈 福井県立大学, 海洋生物資源学部, 准教授 (00511304)
宗林 留美 (福田留美) 静岡大学, 理学部, 准教授 (00343195)
吉川 尚 東海大学, 海洋学部, 教授 (80399104)
松浦 弘行 東海大学, 海洋学部, 准教授 (50459484)
西川 淳 東海大学, 海洋学部, 教授 (10282732)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | ラビリンチュラ類 / 細胞外加水分解酵素 / 有機物分解 / 海洋生態系 / 微生物群集 / 物質循環 / 微生物食物網 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
海洋漂泳区における生物地球化学的な物質循環プロセスのなかで、有機物の分解・分子変換に海水中の従属栄養細菌が大いに寄与していることは知られているが、真核微生物の寄与についてはよくわかっていない。本研究では、単細胞真核微生物である菌類様原生生物ラビリンチュラ類に注目し、海洋漂泳区での有機物分解・変換の担い手としてのそれらの寄与と、食物連鎖（生態系）のなかでのその位置づけを評価することを目指している。
初年度は、主に(1)ラビリンチュラ類のもつ細胞外有機物分解能の解析と、(2)ラビリンチュラ類現存量見積もり法の高効率化と信頼性明示化のための検討について、いずれも複数の系統群の分離株（対数増殖期、定常期）を用いた解析で成果が得られた。(1)では、各株について液体培地中の細胞外プロテアーゼ活性プロファイルを分析した。用いたすべての株で、対数増殖期にも定常期にも、アミノペプチダーゼ型およびトリプシン型の細胞外プロテアーゼ活性が認められた。解析の結果、ラビリンチュラ類は、栄養豊富で活発に増殖している状況においても、貧栄養で定常的な状況においても、水中の有機物分解・分子変換に貢献しうる可能性が強く示唆された。(2)では、11系統群の株について染色後フローサイトメトリーによる検出・計数を検討した。いずれの株も検出・計数は可能であった。しかし、染色による蛍光強度が株によって異なること、同じ株の対数増殖期と定常期でも異なること、対照として用いた酵母細胞とサイトグラム上での区別が難しい株もあることなどがわかり、実海水微生物群集中のラビリンチュラ類定量への適用に向けて、さらに検討しておくべき事項も浮彫となった。
また、上記の成果の他に、実際の海洋漂泳区での生態系構造解析に向けての調査で、真核微生物の捕食者となっている可能性もありうる他の生物群の動態に関しても新しい知見が得られた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究では海洋漂泳区での実態を知ることを目指しているが、実際の海洋生態系ではいろいろな要素が複雑に絡み合っており、現場観測だけでは実態をつかみにくいのが現実である。そのため、本研究では、観測や実海水試料の解析とともにラビリンチュラ類分離株を用いた解析も行っている。本年度の主要な成果は、いずれも分離株を使って得られたものであるが、海洋漂泳区での実態の解析につながる重要な情報が得られた。
フローサイトメーターを用いた海水中のラビリンチュラ類定量法については、方法の確立は未完了であるものの、活用できる可能性があることがわかった。実海水試料への適用のためにはさらなる検討が必要であるが、これらの検討と信頼性評価を進め、実際の海水中のラビリンチュラ類現存量評価に繋げていく。
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| Strategy for Future Research Activity |
海水中のラビリンチュラ類現存量見積もり法は、フローサイトメーターを用いる方法について、本年度にラビリンチュラ株を用いて実施した結果を踏まえて、方法の一部改変と再検討をさらに進め、海水試料への適用検討と信頼性評価等を行ったうえで、実海水中のラビリンチュラ類現存量評価へつなげていく。そのうえで、物理・化学環境や、ほかの生物群との関係の考察を行う。
食物網のなかでのラビリンチュラ類の位置づけに関する情報を得るためにメタ遺伝子解析の手法を用いた動物プランクトン消化管内容物の解析を試みる。また、実試料の解析とともに、同様の手法を用いた研究ですでに公表されているデータもできるだけ集め、考察材料とする。
ラビリンチュラ類の細胞外有機物分解能のうち、細胞外プロテアーゼプロファイルについては現在までに分離株を使って多くの情報が得られたが、一部の分類群ではまだ不十分なので、株を用いた解析を継続し、すでに得られている情報と合わせてまとめる。さらに、プロテアーゼ以外の高分子有機物分解酵素活性についても分析を試み、ラビリンチュラ類の細胞外有機物分解能について、その特徴を従属栄養細菌とも比較して考察する。
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Research Products
(9 results)
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[Presentation] Life history and food-habit of a lophogastrid Gnathophausia longispina in Suruga Bay, Japan2019
Author(s)
Nishikawa, J., Yonekubo, S., Yoshikawa, T., Matsuura, H., Sohrin, R., Obayashi, Y.
Organizer
PICES-2019 Annual Meeting
Int'l Joint Research
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