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2022 Fiscal Year Annual Research Report

Development of new approaches for exploring the structural dynamics of the membrane-less organelle in cells

Research Project

Project/Area Number 19H03168
Research InstitutionHiroshima University

Principal Investigator

楯 真一  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 教授 (20216998)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 安田 恭大  広島大学, 統合生命科学研究科(理), 助教 (40816344)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Keywords液液相分離 / 天然変性タンパク質 / NMR / B型肝炎ウイルス
Outline of Annual Research Achievements

ストレス顆粒を構成する主要タンパク質TIA1の顆粒形成機構について新たな知見を明らかにした.従来まではTIA1のC末端部にある天然変性領域間(Low Complexity Domain: LCD)での相互作用が液液相分離による顆粒型性を担うとされたが,今回の研究からLCDはN末端部にある3つのRNA結合ドメイン(RRM)と相互作用することにより,顆粒型性を促進することをみつけた.さらに興味深いことに3つのドメインの寄与は均等ではなく,2番目のドメインが最も高い親和性を示すことを見いだした.LCD-RRMの分子間相互作用が顆粒型性の初期過程の初期に係わる新たな機構を提唱する.
近接標識法を応用してストレス顆粒が解消してゆく過程のタンパク質の動態変化を観測した.具体的には,ストレス誘導後一定時間後にストレス刺激を除き,時間を変えてに光を照射して時間発展的にプロテオミクス解析を行った.詳細な解析は現在進行中であるが,ストレス顆粒形成・顆粒内機能に係わるとされる複数のタンパク質が段階的に減衰する特徴的な挙動が観測された.ストレス顆粒の解消過程に着目した時分割プロテオミクス解析は過去に例がなく,ストレス顆粒形成制御機構の新たな知見を明らかにすることができる.
B型肝炎ウイルス(HBV)の複製に液液相分離が係わることを本研究の過程で発見し,今期はその役割についても集中的に研究を進めた.プロテオミクス解析によりB型肝炎ウイルスの内殻タンパク質HBcに物理的に結合するタンパク質として同定されたCPSF6は試験管内で液液相分離により液滴構造を形成する.今期の研究は細胞内でも液滴構造を形成することが確認でき,細胞内で形成されるCPSF6液滴にもHBcが集積することを確認した.HBcの細胞内発現量の増加と共に,CPSF6液滴内への局在も増加することが明らかになった.新たなHBV複製機構を提唱する.

Research Progress Status

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和4年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (8 results)

All 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Seoul National University/UNIST Central Research Facilities(韓国)

    • Country Name
      KOREA (REP. OF KOREA)
    • Counterpart Institution
      Seoul National University/UNIST Central Research Facilities
  • [Int'l Joint Research] University of Padova(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      University of Padova
  • [Journal Article] Valosin‐containing protein regulates the stability of fused in sarcoma granules in cells by changing ATP concentrations2022

    • Author(s)
      Yasuda Kyota、Watanabe Tomonobu M.、Kang Myeong‐Gyun、Seo Jeong Kon、Rhee Hyun‐Woo、Tate Shin‐ichi
    • Journal Title

      FEBS Letters

      Volume: 596 Pages: 1412~1423

    • DOI

      10.1002/1873-3468.14353

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification of embryonic RNA granules that act as sites of mRNA translation after changing their physical properties2022

    • Author(s)
      Sato Keisuke、Sakai Moeko、Ishii Anna、Maehata Kaori、Takada Yuki、Yasuda Kyota、Kotani Tomoya
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 25 Pages: 104344~104344

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.104344

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FUS液液相分離の機能と細胞内相分離制御機構2022

    • Author(s)
      安田恭大,楯 真一
    • Journal Title

      細胞

      Volume: 54 Pages: 448-451

  • [Presentation] Structure dynamics of intrinsically disordered proteind (IDPs) and their biological roles2022

    • Author(s)
      Shin-ichi Tate
    • Organizer
      The 7th International Symposium on Drug Discovery and Design by NMR
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] NMRによる天然変性タンパク質の構造ダイナミクスと機能との相関解析2022

    • Author(s)
      楯 真一
    • Organizer
      広島大学統合生命科学研究科シンポジウム「分子原子レベルの統合生命科学研究」(招待講演)
    • Invited
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.mls.sci.hiroshima-u.ac.jp/biophys/index.html

URL: 

Published: 2023-12-25  

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