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2020 Fiscal Year Annual Research Report

無細胞ヒトプロテインアレイを用いた薬剤依存的相互作用タンパク質同定技術の開発

Research Project

Project/Area Number 19H03218
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

澤崎 達也  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 教授 (50314969)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywordsサリドマイド / 催奇形性 / 蛋白質分解 / ユビキチン / 分子のり / 蛋白質 / タンパク質分解誘導剤
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題では目的は2つある。サリドマイドとE7820をモデルに、1) ヒト全タンパク質レベルで薬剤依存的に相互作用するタンパク質を同定できる技術の開発、2) 新しく見出した基質タンパク質の細胞レベル、個体レベルの解析、および構造解析を進め、タンパク質分解誘導薬剤サリドマイド・E7820の薬効作用点の解明である。そこで本年度は、2万4千種類からなるヒトプロテインアレイを用いた大規模スクリーニングにより薬剤依存的に相互作用するタンパク質の網羅的解析と、細胞生物学的解析を行った。また、高分解能でないと薬剤の電子密度が明らかとならないため、出来るだけ小さなタンパク質での構造解析に着手し、1.8オングストロームレベルの構造解析に成功した。
I.2万4千種のヒトプロテインアレイを用いたCRBN-サリドマイド基質およびDCAF15-E7820基質の大規模スクリーニング:前年度の中規模スクリーニングの結果からスクリーニング系の条件をタンパク質の量や薬剤濃度などのファインチューニングを行い、2万4千種類のヒトプロテインアレイを用いて大規模スクリーニングを行い、網羅的な基質探索を行い、新規ネオ基質候補PLZFを見出した。
II.薬剤依存的に相互作用する新規基質タンパク質の機能解析:生化学的解析および細胞生物学的解析を行い、新規に見出したPLZFは、サリドマイドおよびサリドマイド誘導体によりCullin4-CRBN複合体により分解誘導されるネオ基質であることが明らかとなった。さらに、催奇性誘導因子であるSALL4を対象に、CRBN-thalidomide-SALL4の複合体の高分解像度(1.8オングストローム)の構造情報の取得に成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当初の計画より1年早く、新規ネオ基質PLZFの発見、高分解像度の構造情報が取得できたため。

Strategy for Future Research Activity

本計画の2年間で計画していたCRBNの基質探索は概ね終了したので、今後は、別の薬剤受容体であるDCAF15を対象に基質探索の実験を進める。

  • Research Products

    (24 results)

All 2021 2020 Other

All Journal Article (12 results) (of which Peer Reviewed: 11 results,  Open Access: 9 results) Presentation (11 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Thalidomide and its metabolite 5‐hydroxythalidomide induce teratogenicity via the cereblon neosubstrate PLZF2021

    • Author(s)
      Yamanaka Satoshi、Murai Hidetaka、Saito Daisuke、Abe Gembu、Tokunaga Etsuko、Iwasaki Takahiro、Takahashi Hirotaka、Takeda Hiroyuki、Suzuki Takayuki、Shibata Norio、Tamura Koji、Sawasaki Tatsuya
    • Journal Title

      The EMBO Journal

      Volume: 40 Pages: e105375

    • DOI

      10.15252/embj.2020105375

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] MIND bomb 2 prevents RIPK1 kinase activity-dependent and -independent apoptosis through ubiquitylation of cFLIPL2021

    • Author(s)
      Nakabayashi Osamu、Takahashi Hirotaka、Moriwaki Kenta、Komazawa-Sakon Sachiko、Ohtake Fumiaki、Murai Shin、Tsuchiya Yuichi、Koyahara Yuki、Saeki Yasushi、Yoshida Yukiko、Yamazaki Soh、Tokunaga Fuminori、Sawasaki Tatsuya、Nakano Hiroyasu
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 4 Pages: 80

    • DOI

      10.1038/s42003-020-01603-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Expression of LhFT1, the Flowering Inducer of Asiatic Hybrid Lily, in the Bulb Scales2020

    • Author(s)
      Kurokawa Kana、Kobayashi Junya、Nemoto Keiichirou、Nozawa Akira、Sawasaki Tatsuya、Nakatsuka Takashi、Yamagishi Masumi
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 11 Pages: 570915

    • DOI

      10.3389/fpls.2020.570915

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An IMiD-induced SALL4 degron system for selective degradation of target proteins2020

    • Author(s)
      Yamanaka Satoshi、Shoya Yuki、Matsuoka Saya、Nishida-Fukuda Hisayo、Shibata Norio、Sawasaki Tatsuya
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 3 Pages: 515

    • DOI

      10.1038/s42003-020-01240-5

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural bases of IMiD selectivity that emerges by 5-hydroxythalidomide2020

    • Author(s)
      Furihata Hirotake、Yamanaka Satoshi、Honda Toshiaki、Miyauchi Yumiko、Asano Atsuko、Shibata Norio、Tanokura Masaru、Sawasaki Tatsuya、Miyakawa Takuya
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 11 Pages: 4578

    • DOI

      10.1038/s41467-020-18488-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CIPK23 regulates blue light‐dependent stomatal opening in Arabidopsis thaliana2020

    • Author(s)
      Inoue Shin‐Ichiro、Kaiserli Eirini、Zhao Xiang、Waksman Thomas、Takemiya Atsushi、Okumura Masaki、Takahashi Hirotaka、Seki Motoaki、Shinozaki Kazuo、Endo Yaeta、Sawasaki Tatsuya、Kinoshita Toshinori、Zhang Xiao、Christie John M.、Shimazaki Ken‐Ichiro
    • Journal Title

      The Plant Journal

      Volume: 104 Pages: 679~692

    • DOI

      10.1111/tpj.14955

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] KN3014, a piperidine-containing small compound, inhibits auto-secretion of IL-1β from PBMCs in a patient with Muckle?Wells syndrome2020

    • Author(s)
      Kaneko Naoe、Kurata Mie、Yamamoto Toshihiro、Shigemura Tomonari、Agematsu Kazunaga、Yamazaki Takashi、Takeda Hiroyuki、Sawasaki Tatsuya、Koga Tomohiro、Kawakami Atsushi、Yachie Akihiro、Migita Kiyoshi、Yoshiura Koh-ichiro、Urano Takeshi、Masumoto Junya
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 10 Pages: 13562

    • DOI

      10.1038/s41598-020-70513-0

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A Human DUB Protein Array for Clarification of Linkage Specificity of Polyubiquitin Chain and Application to Evaluation of Its Inhibitors2020

    • Author(s)
      Takahashi Hirotaka、Yamanaka Satoshi、Kuwada Shohei、Higaki Kana、Kido Kohki、Sato Yusuke、Fukai Shuya、Tokunaga Fuminori、Sawasaki Tatsuya
    • Journal Title

      Biomedicines

      Volume: 8 Pages: 152~152

    • DOI

      10.3390/biomedicines8060152

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] AirID, a novel proximity biotinylation enzyme, for analysis of protein?protein interactions2020

    • Author(s)
      Kido Kohki、Yamanaka Satoshi、Nakano Shogo、Motani Kou、Shinohara Souta、Nozawa Akira、Kosako Hidetaka、Ito Sohei、Sawasaki Tatsuya
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 9 Pages: e54983

    • DOI

      10.7554/eLife.54983

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Soy and Arabidopsis receptor-like kinases respond to polysaccharide signals from Spodoptera species and mediate herbivore resistance2020

    • Author(s)
      Uemura Takuya、Hachisu Masakazu、Desaki Yoshitake、Ito Ayaka、Hoshino Ryosuke、Sano Yuka、Nozawa Akira、Mujiono Kadis、Galis Ivan、Yoshida Ayako、Nemoto Keiichirou、Miura Shigetoshi、Nishiyama Makoto、Nishiyama Chiharu、Horito Shigeomi、Sawasaki Tatsuya、Arimura Gen-ichiro
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 3 Pages: 224

    • DOI

      10.1038/s42003-020-0959-4

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A novel MRGPRX2-targeting antagonistic DNA aptamer inhibits histamine release and prevents mast cell-mediated anaphylaxis2020

    • Author(s)
      Suzuki Yasuyuki、Liu Shuang、Ogasawara Tomio、Sawasaki Tatsuya、Takasaki Yasushi、Yorozuya Toshihiro、Mogi Masaki
    • Journal Title

      European Journal of Pharmacology

      Volume: 878 Pages: 173104~173104

    • DOI

      10.1016/j.ejphar.2020.173104

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ヒト脱ユビキチン化酵素タンパク質アレイの開発とその応用例2020

    • Author(s)
      高橋 宏隆、山中 聡士、徳永 文稔、澤崎 達也
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 92 Pages: 64~74

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2020.920064

  • [Presentation] in vitro及びin cellにおけるPROTAC依存的に相互作用する基質探索系の構築2020

    • Author(s)
      松岡沙耶, 山中聡士, 澤崎達也
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 標的タンパク質の選択的分解のためのIMiD誘導性SALL4デグロンシステム2020

    • Author(s)
      庄屋祐希, 山中聡士, 福田尚代, 柴田哲男, 澤崎達也
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] タンパク質-タンパク質相互作用解析のためのAirIDを用いたAGIAタグ依存的近位依存性ビオチン化技術AGIAiD2020

    • Author(s)
      山田航大, 城戸康希, 塩屋亮平, 澤崎達也
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] 新規マラリアワクチン候補PfRiprにより誘導されるウサギモノクローナル抗体の評価2020

    • Author(s)
      小澤龍彦, 岸裕幸, 村口篤, 坪井敬文, 高島英造, 澤崎達也
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] サリドマイド代謝物によるC2H2型ジンクフィンガーの分解選択性の構造基盤2020

    • Author(s)
      降旗大岳, 山中聡士, 本田敏章, 柴田哲男, 田之倉優, 澤崎達也, 宮川拓也
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
  • [Presentation] Development of USP-DUB specific inhibitor using human DUB protein array2020

    • Author(s)
      Takahashi H, Yamanaka S, Kuwada S, Higaki K, Sato Y, Fukai S, Tokunaga F, Sawasaki T.
    • Organizer
      第93回 日本生化学会大会
    • Invited
  • [Presentation] 新規マラリアワクチン候補GAMAに対する侵入阻害抗体の作製2020

    • Author(s)
      曾我 郁弥、徳永 聡、小澤 龍彦、長岡 ひかる、高島 英造、岸 裕幸、村口篤、坪井 敬文、澤崎 達也
    • Organizer
      第61回 日本生化学会中国・四国支部例会
  • [Presentation] コムギ無細胞技術を基盤としたイオンチャネル解析技術の開発2020

    • Author(s)
      山田 航大、谷崎 圭隆、竹田 浩之、野澤 彰、澤崎 達也
    • Organizer
      第61回 日本生化学会中国・四国支部例会
  • [Presentation] 植物体で利用可能な新規ケミカルプロテインノックダウン技術の構築2020

    • Author(s)
      村松ちひろ, 野澤彰, 根本圭一郎, 澤崎達也
    • Organizer
      第55回植物化学調節学会大会
  • [Presentation] コムギ無細胞系を基盤としたオーキシン依存的TIR1-IAA相互作用解析系の構築2020

    • Author(s)
      堀 凌輔, 野澤 彰, 佐藤 明子, 嶋田 幸久, 澤崎 達也
    • Organizer
      第55回植物化学調節学会大会
  • [Presentation] 生体内インタラクトーム解析に適した近位依存性ビオチン化酵素AirIDの開発2020

    • Author(s)
      城戸康希, 澤崎 達也
    • Organizer
      第71回日本電気泳動学会総会
  • [Remarks] 澤崎研吸湿HP

    • URL

      http://www.pros.ehime-u.ac.jp/cell-free/index.html

URL: 

Published: 2021-12-27  

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