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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Nanogeomicrobiology

Research Project

Project/Area Number 19H03310
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

加藤 真悟  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 上級研究員 (40554548)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 鈴木 庸平  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (00359168)
伊藤 隆  国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 特別嘱託研究員 (80321727)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2024-03-31
Keywords鉄酸化菌 / 鉄還元菌 / バイオミネラル / メタゲノム / 分離培養 / ナノ鉱物 / 微生物ダークマター / 生物地球化学的循環
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、「多種多様な未培養微生物が酸化鉄ナノ鉱物の生成・溶解を駆動し、地球表層環境における様々な元素の挙動・循環を支配している」という作業仮説の検証を通じて、それらの未培養微生物を分離培養により同定し、地球表層環境における「酸化鉄ナノ鉱物の生成・溶解プロセスの実態」と「微生物-酸化鉄ナノ鉱物-多元素の相互作用」を解明することを目的とした。2023年度は、本計画で得た中性pH付近で単独で鉄酸化および鉄還元によって増殖できる’Rhodoferax lithotrophicus’ MIZ03株について、追加の性状・系統解析を行い、新種としての記載論文を投稿した(リビジョン中)。また、本計画で採取した鉄マット試料のメタゲノムデータを、最新のツールを用いて再解析を行い、鉄のサイクルに関わる遺伝子ベースの議論を深めた。その結果、これまでに分離培養した酸化鉄ナノ鉱物を還元する分離株(5株)および鉄酸化する分離株(4株)の他に、さらに多様な鉄酸化・還元微生物が同環境中に存在することを示唆した。これらのメタゲノム解析および分離株の性状結果を統合して、同環境中の鉄サイクルのモデルを提示する論文を執筆中である。鉄含有温泉地より分離した鉄還元菌(2株)について、さらに詳細な性状・系統解析を進め、それぞれが新種以上で新規の微生物であることを示唆し、記載論文を執筆中である。鉄含有鉱物を含む磁性粒子が検出された深海底硫化物チムニーのメタゲノム解析を行い、その磁性粒子を形成すると推定される未培養Nitrospinaeのゲノム再構築に成功した。本成果は、共著論文としてFrontiers in Microbiology誌に受理された。以上、上記の仮説検証に必要な知見を着実に積み重ねている。

Research Progress Status

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和5年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (2 results)

All 2023 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Bullet-shaped magnetosomes and metagenomic-based magnetosome gene profiles in a deep-sea hydrothermal vent chimney2023

    • Author(s)
      Nakano Shinsaku、Furutani Hitoshi、Kato Shingo、Kouduka Mariko、Yamazaki Toshitsugu、Suzuki Yohey
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 14 Pages: 1174899

    • DOI

      10.3389/fmicb.2023.1174899

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Remarks]

    • URL

      https://www.jcm.riken.jp/JCM/staff/skato/index.html

URL: 

Published: 2024-12-25  

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