APOBEC3B-induced genome mutations and its contribution to clonal evolution in cancers

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19H03502
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 50010:Tumor biology-related
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: Takaori-Kondo Akifumi 京都大学, 医学研究科, 教授 (20324626)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 村川 泰裕 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, チームリーダー (50765469) ; 白川 康太郎 京都大学, 医学研究科, 助教 (80728270)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: APOBEC / がん / クローン進化 / ゲノム変異 / シチジン脱アミノ化 / C-to-T変異

Outline of Final Research Achievements

1.Single cell RNA sequencing revealed that APOBEC3B is preferentially expressed in G2/M cell cycle (Hirabayashi et al., BBRC 2021).2.We employed mass spectrometry to identify interacting proteins of endogenous APOBEC3B in myeloma cell lines. We detected 30 interacting proteins and among these, ILF2 enhanced APOBEC3B deaminase activities (Kazuma et al., Sci Rep 2022). 3.We identified 6735 enhancers including 3237 novel enhancer sequences in clinical myeloma samples and are investigating their physiological roles in myeloma progression and chemotherapy resistance.(Unpublished data)

Free Research Field

血液学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

APOBEC3Bの過剰発現は多くのがんで共通しており、APOBEC3Bの酵素活性がその遺伝子変異の根源にあることから、本研究で得られた知見は多くのがんで共通のメカニズムである可能性がある。さらに、その活性阻害により、多くのがんのクローン進化を抑制することができれば、APOBEC3B脱アミノ化酵素阻害剤を従来の化学療法と併用することにより、治療抵抗性や遠隔転移を抑制し、従来の抗がん剤の成績を向上させる新たな治療法の開発につながる可能性があり臨床的にも極めて重要である。