2021 Fiscal Year Annual Research Report
Specific immune responses against tumor antigens in long term survivors of cancer
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19H03528
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| Research Institution | Aichi Cancer Center Research Institute |
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Principal Investigator |
松下 博和 愛知県がんセンター(研究所), 腫瘍免疫制御TR分野, 分野長 (80597782)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
垣見 和宏 東京大学, 医学部附属病院, 特任教授 (80273358)
谷田部 恭 国立研究開発法人国立がん研究センター, 中央病院, 科長 (90280809)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Keywords | 肺癌 / 長期生存 / T細胞 / ネオアンチゲン |
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| Outline of Annual Research Achievements |
がん種を問わず、一定の割合で長期生存がん患者が存在する。本研究の目的は、遺伝子変異由来の新生抗原(ネオアンチゲン)に対する免疫応答が、患者の長期生存に寄与しているかどうかを明らかにすることである。まず、当センターで収集した113例の肺癌手術症例を対象として全エクソームシーケンス（WES）とRNAシーケンス（RNA-seq）を実施した。WESのデータより遺伝子変異を同定し、in silicoのアルゴリズムを用いて遺伝子変異由来のネオアンチゲンを予測した。また、腫瘍免疫微小環境を、腫瘍因子、免疫因子、そして免疫を抑制する抗免疫因子の3つに分類して評価する新しい腫瘍免疫微小環境スコアを開発した。長期の予後データが含まれる990例のTCGAデータを活用したところ、肺癌における組織型、遺伝子変異量、抗原特異的免疫応答、シグナル伝達異常等がスコアに影響を与え、腫瘍スコアが低く、免疫スコアが高く、抗免疫スコアが低い群で予後が良好であることがわかった。
腫瘍浸潤リンパ球が認識する、上記の予測ネオアンチゲンを同定するために、上の症例のうち検体量が十分保存されていた３症例において、CD8Tシングルセル解析（CD8T scRNA/TCR-seq）を実施した。UMAPでクラスタリングを行い、Tex（exhausted T cell)クラスターのT細胞が、ネオアンチゲンやがん・精巣抗原に反応することを明らかにし、CD8Tシングルセル解析を活用したTCR-抗原同定システムを確立した。肺癌の胸水貯留症例6例（細胞株樹立症例）のうち、免疫チェックポイント阻害剤（ICI)に感受性を示した2症例にフォーカスした。ICIで増強されたリンパ球が認識するがん抗原を同定するために、胸水細胞のWES/RNA-seqと、胸水CD8Tシングルセル解析を実施した。今後、われわれのTCR-抗原同定システムで抗原を同定する。
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| Research Progress Status |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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Research Products
(15 results)
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[Journal Article] New evaluation of the tumor immune microenvironment of non-small cell lung cancer and its association with prognosis2022
Author(s)
Shinohara S, Takahashi Y, Komuro H, Matsui T, Sugita Y, Demachi-Okamura A, Muraoka D, Takahara H, Nakada T, Sakakura N, Masago K, Miyai M, Nishida R, Shomura S, Shigematsu Y, Hatooka S, Sasano H, Watanabe F, Adachi K, Fujinaga K, Kaneda S, Takao M, Ohtsuka T, Yamaguchi R, Kuroda H, Matsushita H.
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Journal Title
J Immunother Cancer
Volume: 10
Pages: e003765
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Journal Article] Mitochondrial reactive oxygen species trigger metformin-dependent antitumor immunity via activation of Nrf2/mTORC1/p62 axis in tumor-infiltrating CD8T lymphocytes2021
Author(s)
Nishida M, Yamashita N, Ogawa T, Koseki K, Warabi E, Ohue T, Komatsu M, Matsushita H, Kakimi K, Kawakami E, Shiroguchi K, Udono H.
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Journal Title
J Immunother Cancer
Volume: 9
Pages: e002954
DOI
Peer Reviewed / Open Access
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[Presentation] 肺悪性腫瘍におけるHuman leukocyte antigen (HLA) 遺伝子多型による疾患感受性及び免疫応答の個体差の形成に関するメカニズムの解明2021
Author(s)
松井琢哉, 松下博和, 黒田浩章, 坂倉範昭, 高橋祐介, 仲田健男, 大矢由子, 中西良一, 奥田勝裕, 横田圭右, 立松勉, 遠藤克彦, 坂根理司, 小田梨紗
Organizer
第121回日本外科学会定期学術集会
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