• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2021 Fiscal Year Annual Research Report

シングルセルオミックス解析による心筋リプログラミングを介した心不全治療法の開発

Research Project

Project/Area Number 19H03649
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

野村 征太郎  東京大学, 医学部附属病院, 特任助教 (10722118)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Keywordsシングルセル解析 / 心不全 / 心筋リプログラミング
Outline of Annual Research Achievements

我々は、心不全発症において心筋細胞が肥大型状態を経て代償型・不全型の細胞に分岐することを明らかにし、各細胞状態を前に進めるシグナルを同定した。そこで、不全型の心筋細胞を正常型・肥大型・代償型に逆戻りさせることができれば、心不全の本質的な治療法として確立できると考えた。本研究は、心筋細胞状態を規定する因子・内的外的要因を同定して、心筋リプログラミングによる心不全治療法を開発することを目指した。
(1)CRISPR/Cas9とシングルセルRNA-seqの統合による網羅的遺伝子ノックアウト機能解析:ノックアウトする遺伝子に対するgRNAライブラリを構築して網羅的遺伝子ノックアウトを実現し、心不全病態の解析に応用した。
(2)エピゲノム解析による内的要因の解明:マウス心臓から単離した心筋をCUT&RUNによってエピゲノム解析を行う技術を確立し、不全心筋に特徴的なDNA損傷修復分子や転写制御関連分子などの局在を同定するに至った。
(3)シングルセルRNA-seq情報を用いた細胞間相互解析:シングルセルRNA-seq解析によって心臓線維芽細胞から心筋細胞へと誘導されるTGF-betaシグナルが心筋細胞の老化を誘導していることを明らかにして論文報告した(Nomura et al. Nat Commun. 2022)。また心筋梗塞後の心臓リモデリングの過程を空間的トランスクリプトームとシングルセルRNA-seqで統合的に解析した(Nomura et al. Nat Cardiovasc Res. 2022)。
(4)心筋リプログラミングによる心不全治療法の開発:心筋肥大を制御する転写因子をシングルセルRNA-seqおよびエピゲノム解析によって同定し、その因子を心不全期に心筋で過剰発現させることで心臓が肥大形質を取り戻して心臓機能が回復することを見出した。

Research Progress Status

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

令和3年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (31 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (18 results) (of which Peer Reviewed: 18 results,  Open Access: 18 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 11 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Novel AGL variants in a patient with glycogen storage disease type IIIb and pulmonary hypertension caused by pulmonary veno-occlusive disease: A case report2023

    • Author(s)
      Shindo A, Ueda K, Minatsuki S, Nakayama Y, Hatsuse S, Fujita K, Nomura S, Hatano M, Takeda N, Akazawa H, Komuro I.
    • Journal Title

      Front Genet.

      Volume: 14 Pages: 1148067

    • DOI

      10.3389/fgene.2023.1148067

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Precision and genomic medicine for dilated and hypertrophic cardiomyopathy.2023

    • Author(s)
      Nomura S, Ono M.
    • Journal Title

      Front Cardiovasc Med.

      Volume: 10 Pages: 1137498

    • DOI

      10.3389/fcvm.2023.1137498

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] LMNA Mutations and Right Heart Failure in Patients With Cardiomyopathy and With Left Ventricular Assist Devices.2023

    • Author(s)
      Yamada T, Nomura S, Amiya E, Katoh M, Inoue S, Hatsuse S, Fujita K, Ito M, Fujita T, Bujo C, Tsuji M, Ishida J, Ko T, Yamada S, Katagiri M, Sassa T, Kinoshita O, Nawata K, Tobita T, Satoh M, Ishiwata J, Daimon M, Tatsuno K, Fukuda S, Kashimura T, Minamino T, Hatano M, Ono M, Aburatani H, Komuro I.
    • Journal Title

      J Card Fail.

      Volume: 29 Pages: 855-857

    • DOI

      10.1016/j.cardfail.2023.01.011

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cross-ancestry genome-wide analysis of atrial fibrillation unveils disease biology and enables cardioembolic risk prediction.2023

    • Author(s)
      Miyazawa K, Ito K, Ito M, Zou Z, Kubota M, Nomura S, Matsunaga H, Koyama S, Ieki H, Akiyama M, Koike Y, Kurosawa R, Yoshida H, Ozaki K, Onouchi Y; BioBank Japan Project; Takahashi A, Matsuda K, Murakami Y, Aburatani H, Kubo M, Momozawa Y, Terao C, Oki S, Akazawa H, Kamatani Y, Komuro I.
    • Journal Title

      Nat Genet.

      Volume: 55 Pages: 187-197

    • DOI

      10.1038/s41588-022-01284-9

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Endoplasmic reticulum stress-activated nuclear factor-kappa B signaling pathway induces the upregulation of cardiomyocyte dopamine D1 receptor in heart failure.2022

    • Author(s)
      Nakamura S, Numata G, Yamaguchi T, Tokiwa H, Higashikuni Y, Nomura S, Sasano T, Takimoto E, Komuro I.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun.

      Volume: 637 Pages: 247-253

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2022.11.031

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Beiging of perivascular adipose tissue regulates its inflammation and vascular remodeling.2022

    • Author(s)
      Adachi Y, Ueda K, Nomura S, Ito K, Katoh M, Katagiri M, Yamada S, Hashimoto M, Zhai B, Numata G, Otani A, Hinata M, Hiraike Y, Waki H, Takeda N, Morita H, Ushiku T, Yamauchi T, Takimoto E, Komuro I.
    • Journal Title

      Nat Commun.

      Volume: 13 Pages: 5117

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32658-6

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Manipulating Cardiomyocyte Plasticity for Heart Regeneration.2022

    • Author(s)
      Ko T, Nomura S.
    • Journal Title

      Front Cell Dev Biol.

      Volume: 10 Pages: 929256

    • DOI

      10.3389/fcell.2022.929256

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Cardiac fibroblasts regulate the development of heart failure via Htra3-TGF-β-IGFBP7 axis.2022

    • Author(s)
      Ko T, Nomura S, Yamada S, Fujita K, Fujita T, Satoh M, Oka C, Katoh M, Ito M, Katagiri M, Sassa T, Zhang B, Hatsuse S, Yamada T, Harada M, Toko H, Amiya E, Hatano M, Kinoshita O, Nawata K, Abe H, Ushiku T, Ono M, Ikeuchi M, Morita H, Aburatani H, Komuro I.
    • Journal Title

      Nat Commun.

      Volume: 7 Pages: 3275

    • DOI

      10.1038/s41467-022-30630-y

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Dysregulation of DNA Methylation in the Aryl-Hydrocarbon Receptor Repressor (AHRR) Gene.2022

    • Author(s)
      Nomura S, Morita H.
    • Journal Title

      Circ J.

      Volume: 86 Pages: 993-994

    • DOI

      10.1253/circj.CJ-22-0111

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Functional Evaluation of Human Bioengineered Cardiac Tissue Using iPS Cells Derived from a Patient with Lamin Variant Dilated Cardiomyopathy.2022

    • Author(s)
      Miura K, Matsuura K, Yamasaki Itoyama Y, Sasaki D, Takada T, Furutani Y, Hayama E, Ito M, Nomura S, Morita H, Toyoda M, Umezawa A, Onoue K, Saito Y, Aburatani H, Nakanishi T, Hagiwara N, Komuro I, Shimizu T.
    • Journal Title

      Int Heart J.

      Volume: 63 Pages: 338-346

    • DOI

      10.1536/ihj.21-790

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent Progress in Cardiovascular Research Involving Single-Cell Omics Approaches.2021

    • Author(s)
      Dai Z, Nomura S.
    • Journal Title

      Front Cardiovasc Med.

      Volume: 8 Pages: 783398

    • DOI

      10.3389/fcvm.2021.783398

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Recent Findings Related to Cardiomyopathy and Genetics.2021

    • Author(s)
      Yamada T, Nomura S.
    • Journal Title

      Int J Mol Sci.

      Volume: 22 Pages: 12522

    • DOI

      10.3390/ijms222212522

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-Cell Analysis Revealed the Role of CD8+ Effector T Cells in Preventing Cardioprotective Macrophage Differentiation in the Early Phase of Heart Failure2021

    • Author(s)
      Komai K, Ito M, Nomura S, Shichino S, Katoh M, Yamada S, Ko T, Iizuka-Koga M, Nakatsukasa H, Yoshimura A.
    • Journal Title

      Front Immunol.

      Volume: 12 Pages: 763647

    • DOI

      10.3389/fimmu.2021.763647

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Three-Dimensional Visualization of Hypoxia-Induced Pulmonary Vascular Remodeling in Mice.2021

    • Author(s)
      Fujiwara T, Takeda N, Hara H, Ishii S, Numata G, Tokiwa H, Maemura S, Suzuki T, Takiguchi H, Kubota Y, Seo K, Sakata A, Nomura S, Hatano M, Ueda K, Harada M, Toko H, Takimoto E, Akazawa H, Nishimura S, Komuro I.
    • Journal Title

      Circulation

      Volume: 144 Pages: 1452-1455

    • DOI

      10.1161/CIRCULATIONAHA.121.056219

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] New Vision, Mission, and Values of the Japanese Circulation Society.2021

    • Author(s)
      Ishida M, Matsumoto C, Kida K, Fukuda M, Kagiyama N, Kusunose K, Matsumoto S, Nomura S, Okumura T, Shiono Y, Taniguchi T, Mizuno A, Kishi T, Node K, Komuro I, Hirata KI; Directors of the Japanese Circulation Society.
    • Journal Title

      Circ J.

      Volume: 85 Pages: 2248-2251

    • DOI

      10.1253/circj.CJ-21-0822

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Single-Cardiomyocyte RNA Sequencing to Dissect the Molecular Pathophysiology of the Heart.2021

    • Author(s)
      Katoh M, Nomura S, Yamada S, Aburatani H, Komuro I.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 2320 Pages: 183-192

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-1484-6_18

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Activation of Sympathetic Signaling in Macrophages Blocks Systemic Inflammation and Protects against Renal Ischemia-Reperfusion Injury.2021

    • Author(s)
      Hasegawa S, Inoue T, Nakamura Y, Fukaya D, Uni R, Wu CH, Fujii R, Peerapanyasut W, Taguchi A, Kohro T, Yamada S, Katagiri M, Ko T, Nomura S, Nakanishi Ozeki A, Susaki EA, Ueda HR, Akimitsu N, Wada Y, Komuro I, Nangaku M, Inagi R.
    • Journal Title

      J Am Soc Nephrol.

      Volume: 32 Pages: 1599-1615

    • DOI

      10.1681/ASN.2020121723

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Prediction of single-cell mechanisms for disease progression in hypertrophic remodelling by a trans-omics approach.2021

    • Author(s)
      Hamano M, Nomura S, Iida M, Komuro I, Yamanishi Y.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 11 Pages: 8112

    • DOI

      10.1038/s41598-021-86821-y.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Multiomics analysis to develop precision medicine in heart failure2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      日本循環器学会
    • Invited
  • [Presentation] 心筋梗塞の心臓リモデリングを制御する空間的なメカノセンシング機構2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      日本循環器学会
    • Invited
  • [Presentation] Molecular Mechanisms of Heart Failure2021

    • Author(s)
      Seitaro Nomura
    • Organizer
      Asian Pacific Society of Cardiology Congress (APSC2022)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 拡張型心筋症の発症機序2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      日本循環器学会
    • Invited
  • [Presentation] 統合的シングルセル解析による循環器疾患システム構造の理解と精密医療の発展2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      第263回日本循環器学会関東甲信越地方会 教育セッションⅠ 循環器病克服のための基礎研究のすすめ
    • Invited
  • [Presentation] 循環器疾患システム構造の理解を目指した統合的シングルセル解析2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      第25回日本心血管内分泌代謝学会学術総会若手主宰シンポジウム「心血管内分泌研究の最前線」
    • Invited
  • [Presentation] Integrated single-cell analysis to understand the system architecture of cardiovascular disease2021

    • Author(s)
      Seitaro Nomura
    • Organizer
      第44回日本分子生物学会
    • Invited
  • [Presentation] Spatial transcriptomics of cardiovascular diseases2021

    • Author(s)
      Seitaro Nomura
    • Organizer
      2021 Asia Pacific Spatial Biology Summit
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ゲノムからみた心筋症の精密医療2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      第25回日本心不全学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] 心不全における心筋細胞の分子生物学的考察と臨床応用(心不全のシステム循環器学)2021

    • Author(s)
      野村征太郎
    • Organizer
      第69回日本心臓病学会学術集会
    • Invited
  • [Presentation] DNA damage leading to heart failure2021

    • Author(s)
      Seitaro Nomura
    • Organizer
      European Society of Cardiology
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Book] 循環器疾患最新の治療2022-20232022

    • Author(s)
      野村征太郎・小室一成
    • Total Pages
      520
    • Publisher
      南江堂
    • ISBN
      978-4-524-22995-6
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 心筋梗塞・心不全の治療標的としての心保護因子Htra3の同定2021

    • Inventor(s)
      野村征太郎、候聡志、油谷浩幸、小室一成
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      No. 63/292,079
    • Overseas

URL: 

Published: 2023-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi