Strategic research to understand the pathogenesis and improve the prognosis of SJS/TEN by multilayered omics analysis

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19H03809
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 56060:Ophthalmology-related
• Research Institution: Kyoto Prefectural University of Medicine
• Principal Investigator: SOTOZONO CHIE 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30216585)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 上田 真由美 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任准教授 (60398386) ; 木下 茂 京都府立医科大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (30116024)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: SJS/TEN / 眼合併症 / フェノーム解析 / マイクロバイオーム解析 / プロテオーム解析 / トランスクリプトーム解析 / エピゲノム解析 / HLA

Outline of Final Research Achievements

In this study, phenome, microbiome, proteome, transcriptome, epigenomic and genomic analyses were performed on SJS/TEN　with severe ocular complications. Rather than analysing each as an independent entity, the analyses focused on the phenotypic classification identified in the phenome analysis, focusing on the same phenotype (patients with SJS/TEN associated with severe ocular complications or same suspected drug-related SJS/TEN), or comparing subtypes (severe vs. mild), and Various omics analyses, as well as referring to the results of transcriptome analyses during epigenomic analysis, have revealed new gene regulatory mechanisms associated with the condition.

Free Research Field

眼科学

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

本研究では、フェノーム解析、マイクロバイオーム解析、プロテオーム解析、トランスクリプトーム解析、エピゲノム解析、ゲノム解析等の多数のオミックス解析を合わせて実施することにより、多くの新しい病態機序を明らかとすることができた。本研究で明らかとなったSJS/TENの病態に関連する遺伝子や、miRNA, 涙液中サイトカイン、眼表面の常在細菌等は、発症の予防、早期診断・早期治療につながる可能性があるだけではなく、新規治療法の開発につながるものであると考えられる