2023 Fiscal Year Annual Research Report
comprehensive studies on the molecular basis of early development and clonal evolution in cancer using advanced genomics.
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19H05656
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| Research Institution | Kyoto University |
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Principal Investigator |
小川 誠司 京都大学, 医学研究科, 教授 (60292900)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中川 正宏 京都大学, 医学研究科, 特定准教授 (10431850)
片岡 竜貴 岩手医科大学, 医学部, 教授 (20343254)
昆 彩奈 京都大学, 医学研究科, 特定講師 (20772403)
牧島 秀樹 京都大学, 医学研究科, 准教授 (40402127)
南谷 泰仁 東京大学, 医科学研究所, 教授 (60451811)
依田 成玄 京都大学, 医学研究科, 特定准教授 (70335454)
江藤 正俊 九州大学, 医学研究院, 教授 (90315078)
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| Project Period (FY) |
2019-06-26 – 2024-03-31
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| Keywords | ゲノム生物学 / 腫瘍生物学 / 全ゲノムシーケンス / 単一細胞シーケンス / オルガノイド / クローン進化 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
革新的なシーケンス技術の進歩により、主要ながん腫についてはドライバー変異の全体像が明らかになった一方、発がんの初期のクローン選択はどのようにして生ずるのか、その後獲得される遺伝子変異によりどのように腫瘍内の多様性が生じるのか、また、それらはどのように癌の臨床的な振る舞いと関連するのか、という新たな疑問が生じてきた。これらの未解決の課題に対して、先端技術による微小なクローンの単離と全ゲノムシーケンス、単一細胞シーケンス、オルガノイド培養技術、遺伝子異常を導入したマウスモデルの解析、大規模コホートでの遺伝子異常と表現型の関係性の解析等を駆使して、包括的な探求を行った。代表的ながん種について、がんの初期病変・起源の細胞とクローン進化の履歴を明らかにするのに加えて、非コード領域の遺伝子異常とその発がんにおける機能的意義を明らかにし、さらに大規模コホートのがんの遺伝学的解析を行い、遺伝子異常が、がんの病態・臨床像に及ぼす効果の解明を行った。がんの微小な初期病変のサンプリング、オルガノイド樹立によるクローン化とそれらの全ゲノムシーケンス解析により、がんの初期病変・起源の細胞とクローン進化の履歴を明らかにした。また、独自に開発した遺伝子変異と遺伝子発現の単一細胞シーケンスにより、クローン進化におけるドライバー変異の機能的意義の解明を行った。
本研究は、高度なゲノム解析技術とインフォマティクスに立脚した斬新な研究手法により、発がんの初期過程から浸潤、転移、再発の全容を解明した点で、高い学術的な独自性・創造性を有するとともに、様々ながん腫の遺伝子異常と表現型の関係を明らかにし、がんの治療予後の向上に資する社会的意義の高い研究成果を得た。
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| Research Progress Status |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和5年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Presentation] Evolutionary histories of breast cancer and related clones2023
Author(s)
Tomomi Nishimura, Nobuyuki Kakiuchi, Kenichi Yoshida, Takaki Sakurai, Tatsuki R. Kataoka, Morio Sawada, Yasuhide Takeuchi, Hirona Maeda, Junko Takita, Satoru Miyano, Masaki Mandai, Toshiro Sato, Kengo Takeuchi, Hironori Haga, Masakazu Toi, and Seishi Ogawa
Organizer
第82回日本癌学会学術総会
Int'l Joint Research
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[Presentation] Origin of synchronous or metachronous multiple pancreatic cancers2023
Author(s)
Tomonori Hirano, Nobuyuki Kakiuchi, Yasuhide Takeuchi, Tomomi Nishimura, Toshihiko Masui, Kazuyuki Nagai, Takayuki Anazawa,Sachiko Minamiguchi, Hironori Haga, Norimitsu Uza, Hiroshi Seno, Yuzo Kodama, Atsuhiro Masuda, Takeshi Tanaka, Seishi Ogawa
Organizer
AACR Annual Meeting 2023
Int'l Joint Research
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[Presentation] DISTINCT PATHOGENESIS OF CLONAL HEMATOPOIESIS REVEALED BY SINGLE-CELL MULTI-OMICS SEQUENCING.2023
Author(s)
Masahiro M Nakagawa, Ryosaku Inagaki, Yutaka Kuroda, Yasuhito Nannya, Lanying Zhao, Yotaro Ochi, Masanori Motomura, June Takeda, Xingxing Qi, Koji Okazaki, Akinori Yoda, Ayana Kon, Nobuyuki Kakiuchi, Hideki Makishima, Shuichi Matsuda and Seishi Ogawa
Organizer
MDS Symposium
Int'l Joint Research
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