Exploring the molecular biological basis of host-microbe interactions through many-to-many interactome technology.

2021 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 19K05745
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 37030:Chemical biology-related
• Research Institution: Institute of Physical and Chemical Research
• Principal Investigator: Yazaki Junshi 国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター, 上級研究員 (70391597)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 川島 祐介 公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, ユニット長 (30588124)
• Project Period (FY): 2019-04-01 – 2022-03-31
• Keywords: インタラクトーム / プロテオーム / 複合体相互作用

Outline of Final Research Achievements

A novel label-free multiplex interactome technology, HaloTagNAPPA-MS, was constructed for simultaneous analysis of intracellular molecular complex interactions, which was not possible before. Label-free human cultured cell lysates were interacted with proteins on the solid phase, which were expressed and captured from template DNA, and the complexes were detected by mass spectrometry. Evaluation experiments showed a 36% reproducibility. A Fisher exact test compared to the positive compartment showed a P value of 0.0319, which is similar at P (0.05) and is a Proof of concept for this technology.

Free Research Field

ネットワークバイオロジー

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

HaloTagNAPPA-MSの利用で、まだ20程度のクエリであるにも拘らず、巨大な細胞内分子複合体コミュニケーション地図が構築された。この地図はこれまでにない学術的に卓越した成果である。この技術は今後ヒト共生微生物・感染菌の分泌分子群のネットワーク地図構築にも利用され新規疾患標的因子や新規薬用成分の一斉同定を可能にすることから、社会的意義が高い。それら結果を利用した新微生物薬品・健康食品・治療法開発などの社会的インパクトが期待される。これまで得られた結果は、既存技術に対する優位性、対費用効果の高さ、などから学術的・社会的インパクトが大きい。